期刊导航
期刊开放获取
河南省图书馆
退出
期刊文献
+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
检索
高级检索
期刊导航
共找到
3
篇文章
<
1
>
每页显示
20
50
100
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
显示方式:
文摘
详细
列表
相关度排序
被引量排序
时效性排序
马铃薯StSRP1的克隆、表达及生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
庞鹏湘
常燕楠
+1 位作者
尉瑞敏
郜刚
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期10-16,共7页
胁迫相关基因的表达导致代谢物的积累和生化与生理途径的改变,对于植物适应不利胁迫条件至关重要。通过研究马铃薯StSRP1的结构和在逆境胁迫中的表达情况,为验证马铃薯StSRP1在抵抗生物胁迫过程中的作用奠定了基础。运用电子克隆法获得S...
胁迫相关基因的表达导致代谢物的积累和生化与生理途径的改变,对于植物适应不利胁迫条件至关重要。通过研究马铃薯StSRP1的结构和在逆境胁迫中的表达情况,为验证马铃薯StSRP1在抵抗生物胁迫过程中的作用奠定了基础。运用电子克隆法获得StSRP1全长序列,利用生物信息学分析StSRP1的核酸序列、氨基酸序列、蛋白质结构和启动子,基于NCBI数据库,选取20条与StSRP1匹配度高的胁迫相关蛋白序列构建了系统进化树,对不同物种间的SRP蛋白进行比对。经ABA、MJ和病菌的诱导,对StSRP1进行qRT-PCR分析。克隆获得StSRP1全长867 bp,可编码288个氨基酸,无信号肽序列,无跨膜区,有34个可能的磷酸化位点,亲水性蛋白,定位于内质网。StSRP1的表达受ABA、MJ和病菌的调控。StSRP1可能参与马铃薯逆境胁迫应答过程。
展开更多
关键词
马铃薯
胁迫相关基因
生物信息学
实时荧光定量PCR
下载PDF
职称材料
马铃薯StZnT11的电子克隆、表达及生物信息学分析
被引量:
1
2
作者
尉瑞敏
常燕楠
+2 位作者
庞鹏湘
索艳云
郜刚
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期362-371,共10页
马铃薯锌转运蛋白(Solanum tuberosum zinc transporter 11,StZnT11)对于维持细胞中锌稳态至关重要。通过研究StZnT11在非生物胁迫和生物胁迫下的表达情况,为验证马铃薯StZnT11在青枯菌生物胁迫过程中的作用奠定了基础。从前期工作获得...
马铃薯锌转运蛋白(Solanum tuberosum zinc transporter 11,StZnT11)对于维持细胞中锌稳态至关重要。通过研究StZnT11在非生物胁迫和生物胁迫下的表达情况,为验证马铃薯StZnT11在青枯菌生物胁迫过程中的作用奠定了基础。从前期工作获得的表达文库中得到EST序列,利用NCBI中的Blast工具,对原始序列进行同源性分析,选择与原始序列的相似度、覆盖度、e期望值最高的一条同源对象序列。通过电子克隆,得到StZnT11基因。采用生物信息学方法对StZnT11基因的基因序列及编码的氨基酸组成、理化性质、分子进化、磷酸化位点、高级结构等多角度进行分析。结果表明,该基因cDNA全长1300bp,编码348个氨基酸,编码蛋白含23个磷酸化位点,有1个信号肽,有9个跨膜区域,是定位在质膜上的疏水性蛋白。通过氨基酸序列比对,StZnT11蛋白与烟草、番茄和辣椒等植物中的锌转运蛋白同源性较高。实时荧光定量聚合酶链反应检测结果表明,StZnT11在不同浓度的外源植物激素脱落酸(ABA)的作用下上调。组织定位检测提示StZnT11主要表达于特定组织(茎维管系统的韧皮部和叶片维管束)。这些结果为进一步进行该基因的实验克隆及功能验证研究提供了理论依据。
展开更多
关键词
马铃薯
锌转运蛋白11
生物信息学
实时荧光定量PCR
原文传递
马铃薯StPR-STH2基因的克隆、表达及生物信息学分析
3
作者
常燕楠
尉瑞敏
+1 位作者
庞鹏湘
郜刚
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第19期6229-6237,共9页
致病相关蛋白是由植物病原体和防御相关信号分子诱导的一类蛋白质超家族,其增强植物对生物和非生物胁迫的抗性。为了研究马铃薯StPR-STH2基因在应激胁迫中的作用和功能,利用生物信息学分析、RT-qPCR和荧光原位杂交等方法研究其结构及其...
致病相关蛋白是由植物病原体和防御相关信号分子诱导的一类蛋白质超家族,其增强植物对生物和非生物胁迫的抗性。为了研究马铃薯StPR-STH2基因在应激胁迫中的作用和功能,利用生物信息学分析、RT-qPCR和荧光原位杂交等方法研究其结构及其在青枯菌诱导下的表达量和组织定位情况。结果表明,StPR-STH2长度为569 bp,编码164个氨基酸,无跨膜区、无信号肽。具有21个磷酸化位点,定位于细胞质中,含有1个Bet_v1-like保守结构域,更接近茄科植物,启动子区含有多种参与植物激素、干旱胁迫和防御应激反应的顺式作用元件。StPR-STH2在青枯菌和植物激素脱落酸(ABA)和茉莉酸甲酯(MJ)的诱导下会上调表达,定位于茎叶的维管束中,具有一定的组织特异性。因此推断StPR-STH2与青枯菌所引起的植株维管束系统病害有关,可能参与马铃薯抗青枯病的胁迫应答机制。本研究为后续深入研究StPR-STH2蛋白的功能及其在马铃薯抗青枯病中发挥的作用提供理论基础。
展开更多
关键词
马铃薯(Solanum
tuberosum)
致病相关蛋白
生物信息学
实时荧光定量PCR
荧光原位杂交
原文传递
题名
马铃薯StSRP1的克隆、表达及生物信息学分析
被引量:
2
1
作者
庞鹏湘
常燕楠
尉瑞敏
郜刚
机构
山西师范大学生命科学学院
出处
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019年第7期10-16,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31771858)
文摘
胁迫相关基因的表达导致代谢物的积累和生化与生理途径的改变,对于植物适应不利胁迫条件至关重要。通过研究马铃薯StSRP1的结构和在逆境胁迫中的表达情况,为验证马铃薯StSRP1在抵抗生物胁迫过程中的作用奠定了基础。运用电子克隆法获得StSRP1全长序列,利用生物信息学分析StSRP1的核酸序列、氨基酸序列、蛋白质结构和启动子,基于NCBI数据库,选取20条与StSRP1匹配度高的胁迫相关蛋白序列构建了系统进化树,对不同物种间的SRP蛋白进行比对。经ABA、MJ和病菌的诱导,对StSRP1进行qRT-PCR分析。克隆获得StSRP1全长867 bp,可编码288个氨基酸,无信号肽序列,无跨膜区,有34个可能的磷酸化位点,亲水性蛋白,定位于内质网。StSRP1的表达受ABA、MJ和病菌的调控。StSRP1可能参与马铃薯逆境胁迫应答过程。
关键词
马铃薯
胁迫相关基因
生物信息学
实时荧光定量PCR
Keywords
potato
stress-related protein
bioinformatics
qRT-PCR
分类号
S53 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
马铃薯StZnT11的电子克隆、表达及生物信息学分析
被引量:
1
2
作者
尉瑞敏
常燕楠
庞鹏湘
索艳云
郜刚
机构
山西师范大学生命科学学院
出处
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第2期362-371,共10页
基金
国家自然科学基金(No.31771858)资助~~
文摘
马铃薯锌转运蛋白(Solanum tuberosum zinc transporter 11,StZnT11)对于维持细胞中锌稳态至关重要。通过研究StZnT11在非生物胁迫和生物胁迫下的表达情况,为验证马铃薯StZnT11在青枯菌生物胁迫过程中的作用奠定了基础。从前期工作获得的表达文库中得到EST序列,利用NCBI中的Blast工具,对原始序列进行同源性分析,选择与原始序列的相似度、覆盖度、e期望值最高的一条同源对象序列。通过电子克隆,得到StZnT11基因。采用生物信息学方法对StZnT11基因的基因序列及编码的氨基酸组成、理化性质、分子进化、磷酸化位点、高级结构等多角度进行分析。结果表明,该基因cDNA全长1300bp,编码348个氨基酸,编码蛋白含23个磷酸化位点,有1个信号肽,有9个跨膜区域,是定位在质膜上的疏水性蛋白。通过氨基酸序列比对,StZnT11蛋白与烟草、番茄和辣椒等植物中的锌转运蛋白同源性较高。实时荧光定量聚合酶链反应检测结果表明,StZnT11在不同浓度的外源植物激素脱落酸(ABA)的作用下上调。组织定位检测提示StZnT11主要表达于特定组织(茎维管系统的韧皮部和叶片维管束)。这些结果为进一步进行该基因的实验克隆及功能验证研究提供了理论依据。
关键词
马铃薯
锌转运蛋白11
生物信息学
实时荧光定量PCR
Keywords
potato
zinc transporter 11
bioinformatics
real-time fluorescent quantitative PCR
分类号
S532 [农业科学—作物学]
Q943.2 [生物学—植物学]
原文传递
题名
马铃薯StPR-STH2基因的克隆、表达及生物信息学分析
3
作者
常燕楠
尉瑞敏
庞鹏湘
郜刚
机构
山西师范大学生命科学学院
出处
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第19期6229-6237,共9页
基金
国家自然科学基金项目(31771858)
2019年山西省优秀研究生创新项目(2019SY312)共同资助。
文摘
致病相关蛋白是由植物病原体和防御相关信号分子诱导的一类蛋白质超家族,其增强植物对生物和非生物胁迫的抗性。为了研究马铃薯StPR-STH2基因在应激胁迫中的作用和功能,利用生物信息学分析、RT-qPCR和荧光原位杂交等方法研究其结构及其在青枯菌诱导下的表达量和组织定位情况。结果表明,StPR-STH2长度为569 bp,编码164个氨基酸,无跨膜区、无信号肽。具有21个磷酸化位点,定位于细胞质中,含有1个Bet_v1-like保守结构域,更接近茄科植物,启动子区含有多种参与植物激素、干旱胁迫和防御应激反应的顺式作用元件。StPR-STH2在青枯菌和植物激素脱落酸(ABA)和茉莉酸甲酯(MJ)的诱导下会上调表达,定位于茎叶的维管束中,具有一定的组织特异性。因此推断StPR-STH2与青枯菌所引起的植株维管束系统病害有关,可能参与马铃薯抗青枯病的胁迫应答机制。本研究为后续深入研究StPR-STH2蛋白的功能及其在马铃薯抗青枯病中发挥的作用提供理论基础。
关键词
马铃薯(Solanum
tuberosum)
致病相关蛋白
生物信息学
实时荧光定量PCR
荧光原位杂交
Keywords
Potato(Solanum tuberosum)
Pathogenesis-related protein
Bioinformatics
Real-time fluorescence quantitative PCR
Fluorescence in situ hybridization
分类号
S532 [农业科学—作物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马铃薯StSRP1的克隆、表达及生物信息学分析
庞鹏湘
常燕楠
尉瑞敏
郜刚
《生物技术通报》
CAS
CSCD
北大核心
2019
2
下载PDF
职称材料
2
马铃薯StZnT11的电子克隆、表达及生物信息学分析
尉瑞敏
常燕楠
庞鹏湘
索艳云
郜刚
《生物工程学报》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
原文传递
3
马铃薯StPR-STH2基因的克隆、表达及生物信息学分析
常燕楠
尉瑞敏
庞鹏湘
郜刚
《分子植物育种》
CAS
CSCD
北大核心
2020
0
原文传递
已选择
0
条
导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
检索结果
已选文献
上一页
1
下一页
到第
页
确定
用户登录
登录
IP登录
使用帮助
返回顶部