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应用生物信息学鉴定急性STEMI患者通路及Hub基因
被引量:
1
1
作者
刘铮
王治财
+3 位作者
仓彦
钱云云
刘静
尹依恒
《安徽理工大学学报(自然科学版)》
CAS
2022年第1期93-98,共6页
利用基因表达综合数据库数据集的生物信息学分析,确定4h内STEMI患者血液RNA诊断生物标志物。从基因表达综合数据库中提取RNA表达谱数据集,寻找差异表达基因并对差异基因进行富集分析,在蛋白相互作用网络中筛选Hub基因,建立了基于Hub基...
利用基因表达综合数据库数据集的生物信息学分析,确定4h内STEMI患者血液RNA诊断生物标志物。从基因表达综合数据库中提取RNA表达谱数据集,寻找差异表达基因并对差异基因进行富集分析,在蛋白相互作用网络中筛选Hub基因,建立了基于Hub基因的随机森林模型和逻辑回归模型。结果表明,与健康对照组比较,STEMI患者中鉴定出300个明显DEGs。炎症和免疫相关的途径显著富集,鉴定出7个关键基因,即FPR2、ITGAM、BST1、CEACAM8、MMP9、ELANE和FPR1。通过对7个Hub基因构建随机森林模型和逻辑回归模型,准确地将STEMI样本与健康对照样本分开,对STEMI的预测具有较高的准确性。
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关键词
急性ST段抬高型心肌梗死
差异表达基因
Hub基因
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职称材料
题名
应用生物信息学鉴定急性STEMI患者通路及Hub基因
被引量:
1
1
作者
刘铮
王治财
仓彦
钱云云
刘静
尹依恒
机构
安徽理工大学医学院
同济大学附属上海市第十人民医院心内科
出处
《安徽理工大学学报(自然科学版)》
CAS
2022年第1期93-98,共6页
基金
国家自然科学基金资助项目(82070329)。
文摘
利用基因表达综合数据库数据集的生物信息学分析,确定4h内STEMI患者血液RNA诊断生物标志物。从基因表达综合数据库中提取RNA表达谱数据集,寻找差异表达基因并对差异基因进行富集分析,在蛋白相互作用网络中筛选Hub基因,建立了基于Hub基因的随机森林模型和逻辑回归模型。结果表明,与健康对照组比较,STEMI患者中鉴定出300个明显DEGs。炎症和免疫相关的途径显著富集,鉴定出7个关键基因,即FPR2、ITGAM、BST1、CEACAM8、MMP9、ELANE和FPR1。通过对7个Hub基因构建随机森林模型和逻辑回归模型,准确地将STEMI样本与健康对照样本分开,对STEMI的预测具有较高的准确性。
关键词
急性ST段抬高型心肌梗死
差异表达基因
Hub基因
Keywords
acute ST-segment elevation myocardial infarction
differentially expressed gene
Hub gene
分类号
R541.4 [医药卫生—心血管疾病]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
应用生物信息学鉴定急性STEMI患者通路及Hub基因
刘铮
王治财
仓彦
钱云云
刘静
尹依恒
《安徽理工大学学报(自然科学版)》
CAS
2022
1
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参考文献
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