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数智药学——医院药学新质生产力
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作者 郑鉴凌 尹彦超 +3 位作者 汤莹 郭敏 刘东 李娟 《医药导报》 CAS 北大核心 2024年第9期1502-1508,共7页
从数智技术、数字智商、数据智能3个层面定义数智药学的概念。通过整理近年来医院药学领域从信息化到数字化再到智能化的发展历程,结合华中科技大学同济医学院附属同济医院在数智药学领域的实践经验探讨数智药学的涵义,为医院药学的转... 从数智技术、数字智商、数据智能3个层面定义数智药学的概念。通过整理近年来医院药学领域从信息化到数字化再到智能化的发展历程,结合华中科技大学同济医学院附属同济医院在数智药学领域的实践经验探讨数智药学的涵义,为医院药学的转型提供新思路、新助力。数智药学是具备数字智商的药师,结合自身药学知识,将数智技术应用到医院药学场景中,获取并生产数据智能的药学分支学科。数智药学已经成为医院药学中的一门新兴的交叉学科,能够促进未来医院药学的高质量发展,是医院药学的新质生产力。 展开更多
关键词 数智药学 医院药学 新质生产力
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胀果甘草查尔酮异构酶基因的克隆及序列分析
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作者 尹彦超 张晓冬 +4 位作者 马永生 周姗 高智强 胡婷 刘颖 《生物技术通讯》 CAS 2017年第3期274-280,共7页
目的:对胀果甘草甘草苷生物合成途径的关键酶查尔酮异构酶(CHI)进行基因克隆及序列分析。方法:根据乌拉尔甘草CHI基因c DNA序列设计引物,以胀果甘草主根总RNA为模板RT-PCR扩增CHI基因c DNA序列,并对其进行分析。结果:克隆得到20条胀果甘... 目的:对胀果甘草甘草苷生物合成途径的关键酶查尔酮异构酶(CHI)进行基因克隆及序列分析。方法:根据乌拉尔甘草CHI基因c DNA序列设计引物,以胀果甘草主根总RNA为模板RT-PCR扩增CHI基因c DNA序列,并对其进行分析。结果:克隆得到20条胀果甘草CHI基因c DNA序列,开放读框全长690 bp,编码229个氨基酸残基。20条胀果甘草CHI基因的c DNA序列存在22个变异位点,一致性为99.54%,可分为6种单倍型;其编码的氨基酸序列存在14个变异位点,一致性为98.98%。胀果甘草CHI基因编码蛋白为稳定性亲水蛋白,相对分子质量为24.5×103,等电点为5.3~6.2,不含信号肽,无跨膜区,二级结构以α螺旋和无规则卷曲为主,保守结构域包含一个查耳酮超家族结构域。同源性分析显示,不同物种间的CHI基因同源性较低。结论:克隆了胀果甘草CHI基因c DNA序列,为进一步研究不同基原甘草中甘草苷生物合成的分子调控机制奠定了基础,并为优质甘草的分子选育提供了理论依据。 展开更多
关键词 胀果甘草 查尔酮异构酶 生物信息学分析
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磺胺类药物交叉过敏管理的临床调查和现状分析 被引量:3
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作者 杨洋 尹彦超 +7 位作者 杨光洁 肖潇 徐阳 陈国松 胡迪 信凡雪 李飞娥 李娟 《药物流行病学杂志》 CAS 2021年第12期822-826,共5页
目的:调查某院磺胺类药物使用现状,探讨该类药物交叉过敏管理的必要性。方法:通过病历系统筛选和统计该院磺胺类药物使用情况,包括主要种类、既往过敏患者使用情况等。设计问卷调查医疗人员对磺胺类药物过敏的认知情况,包括磺胺类药物... 目的:调查某院磺胺类药物使用现状,探讨该类药物交叉过敏管理的必要性。方法:通过病历系统筛选和统计该院磺胺类药物使用情况,包括主要种类、既往过敏患者使用情况等。设计问卷调查医疗人员对磺胺类药物过敏的认知情况,包括磺胺类药物的识别量,及其过敏和交叉过敏掌握情况。结果:我院主要使用的磺胺类药物有13种。2019年10月~2020年12月住院患者中既往磺胺类药物过敏的占0.5%,其中27例既往磺胺类药物过敏史患者住院期间接受其他磺胺类药物治疗,属于未严格遵循药品说明书使用。目前医院暂无磺胺类药物过敏事项超说明书使用的处方规范和审核机制。医疗人员对15种磺胺类药物的平均识别量仅为(2.4±2.0)种,76.6%的受调查人员认为磺胺类抗菌药物可交叉过敏,62.1%的认为磺胺类药物均可能交叉过敏。结论:尽管目前关于磺胺类药物之间交叉过敏尚无共识或广泛证据,但磺胺类药物交叉过敏事件及由此导致的医疗损害和纠纷仍不断有个案发生。考虑到以患者为中心,有必要加强磺胺类药物的过敏管理以降低医疗损害风险。 展开更多
关键词 磺胺类药物 交叉过敏 药品管理
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采煤机滚筒抑制粉尘扩散和瓦斯燃烧能力的改进 被引量:5
4
作者 张敬芳 尹彦超 +2 位作者 王进京 郝尚清 魏硕 《煤矿机械》 北大核心 2020年第9期83-85,共3页
在分析综采工作面粉尘和瓦斯防治方法的基础上,提出了一种采煤机滚筒喷雾抑制粉尘扩散和瓦斯燃烧的新方法。通过合理调整喷嘴的安装位置和角度,优化喷嘴的分布,可以使滚筒转动时喷出的水雾能够均匀地、严密地包裹住滚筒,阻隔空气进入截... 在分析综采工作面粉尘和瓦斯防治方法的基础上,提出了一种采煤机滚筒喷雾抑制粉尘扩散和瓦斯燃烧的新方法。通过合理调整喷嘴的安装位置和角度,优化喷嘴的分布,可以使滚筒转动时喷出的水雾能够均匀地、严密地包裹住滚筒,阻隔空气进入截割部。这样既降低了瓦斯燃烧的可能性,也阻止了截割部产生的粉尘向外扩散,提高了降尘效果。该方法为粉尘和瓦斯防治提供了一种新思路,为滚筒喷雾的改进和仿真奠定了基础。 展开更多
关键词 采煤机 滚筒 喷雾 粉尘扩散 瓦斯燃烧
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矿用新型流量控制阀的出口过流面积分析
5
作者 张敬芳 王进京 +2 位作者 尹彦超 郝尚清 魏硕 《机床与液压》 北大核心 2022年第1期137-140,共4页
为探究矿用新型流量控制阀出口流量稳定性的机制,对其出口过流面积进行分析,提出一种原理简单、精度高的新方法。基于Fluent分析软件,仿真得到阀芯3种位移下的出口压力云图和出口在阀中心面的投影云图。结合出口结构特征推导出不同情况... 为探究矿用新型流量控制阀出口流量稳定性的机制,对其出口过流面积进行分析,提出一种原理简单、精度高的新方法。基于Fluent分析软件,仿真得到阀芯3种位移下的出口压力云图和出口在阀中心面的投影云图。结合出口结构特征推导出不同情况下的出口节流面积计算公式;利用MATLAB软件分别绘制仿真分析和理论推导的出口节流面积随阀芯位移的变化曲线并进行对比,验证理论计算的准确性。结果表明:该矿用新型流量控制阀出口过流面积特性能够适应进出口压力的变化、保持出口流量的稳定,在工程上对其动态特性研究具有一定的参考价值。 展开更多
关键词 矿用新型流量控制阀 过流面积 仿真分析
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建筑工程质量检测的控制与管理
6
作者 尹彦超 王晓龙 李欣 《新材料·新装饰》 2021年第14期163-164,共2页
文章首先阐述了建筑工程质量检测的作用,其次说明了建筑工程质量检测中存在的问题,最后提出了建筑工程质量检测的控制与管理措施,包括对检测人员进行业务培训,实现建筑工程质量检测工作系统化管理,保证建筑工程施工中样本的真实性,保证... 文章首先阐述了建筑工程质量检测的作用,其次说明了建筑工程质量检测中存在的问题,最后提出了建筑工程质量检测的控制与管理措施,包括对检测人员进行业务培训,实现建筑工程质量检测工作系统化管理,保证建筑工程施工中样本的真实性,保证检测设备的精准性。 展开更多
关键词 建筑工程 质量检测 控制管理
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乌拉尔甘草查尔酮合酶基因的克隆及序列分析 被引量:4
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作者 周姗 马永生 +4 位作者 胡婷 张晓冬 尹彦超 高智强 刘颖 《生物技术通讯》 CAS 2017年第6期812-817,共6页
目的:对乌拉尔甘草查尔酮合酶(CHS)进行cDNA序列克隆及分析。方法:根据Gen Bank数据库中已注册胀果甘草CHS的cDNA序列(EU706287)设计引物,采用RT-PCR法从乌拉尔甘草根样中克隆CHS的cDNA序列,利用Editseq 7.10、DNAMAN 6.0及MEGA 5.0进... 目的:对乌拉尔甘草查尔酮合酶(CHS)进行cDNA序列克隆及分析。方法:根据Gen Bank数据库中已注册胀果甘草CHS的cDNA序列(EU706287)设计引物,采用RT-PCR法从乌拉尔甘草根样中克隆CHS的cDNA序列,利用Editseq 7.10、DNAMAN 6.0及MEGA 5.0进行序列分析。结果:克隆得到34条长度为1175 bp的CHS序列,包含一个完整的开放读框,编码一条由389个氨基酸残基组成的多肽。这34条CHS序列可分为15种单倍型(单倍型1~15),一致性为98.97%,存在61个变异位点;其对应的34条CHS氨基酸序列,可分为9种氨基酸序列类型(AA-1~AA-9),一致性为99.51%,存在13个变异位点。同源性分析显示,乌拉尔甘草中该基因序列与胀果甘草在进化关系上最近,与小立碗藓在进化关系上最远。结论:克隆了乌拉尔甘草CHS基因cDNA序列,并对其进行了序列多态性分析,为进一步研究CHS基因在甘草黄酮代谢途径中的作用提供了理论依据。 展开更多
关键词 乌拉尔甘草 查尔酮合酶 CDNA 克隆
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光果甘草查尔酮异构酶基因的克隆及序列分析 被引量:2
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作者 张晓冬 尹彦超 +4 位作者 周姗 马永生 胡婷 高智强 刘颖 《生物技术通讯》 CAS 2017年第4期478-484,共7页
目的:对光果甘草黄酮代谢途径中的关键酶查尔酮异构酶(CHI)进行基因克隆和序列分析。方法:取新鲜光果甘草主根,立即投入液氮,作为提取RNA的植物材料;用植物RNA提取试剂盒提取光果甘草总RNA,用逆转录试剂盒对其逆转录得cDNA;根据文献报... 目的:对光果甘草黄酮代谢途径中的关键酶查尔酮异构酶(CHI)进行基因克隆和序列分析。方法:取新鲜光果甘草主根,立即投入液氮,作为提取RNA的植物材料;用植物RNA提取试剂盒提取光果甘草总RNA,用逆转录试剂盒对其逆转录得cDNA;根据文献报道的乌拉尔甘草CHI序列设计特异性引物,扩增光果甘草CHI基因并测序;用生物信息学软件对所得序列进行分析。结果:扩增得到22条光果甘草CHI基因cDNA序列,其编码区全长为690bp,编码229个氨基酸残基。DNAMAN比对表明22条光果甘草cDNA序列间存在16个变异位点,一致性为99.67%,可分为7种单倍型,其中单倍型1为主流单倍型,所占比重为45.5%;氨基酸序列间存在10个变异位点,一致性为99.38%。生物信息学分析表明光果甘草CHI基因编码蛋白为稳定性亲水蛋白,相对分子质量为24 000,等电点为5.56~6.76,不含信号肽,无跨膜区,保守结构域包含一个查尔酮超家族结构域,二级结构以α螺旋和无规卷曲为主。MEGA 5.0同源性分析显示光果甘草7种CHI单倍型间亲缘关系良好且与同属植物乌拉尔甘草的进化关系最近,与蕨类植物香鳞毛蕨的进化关系最远。结论:克隆了光果甘草CHI基因并对其进行了序列分析,为进一步探究CHI基因对甘草苷生物合成的分子调控机制奠定了基础。 展开更多
关键词 光果甘草 查尔酮异构酶 甘草苷 克隆 生物信息学分析
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X射线辐照处理对光果甘草质量的影响研究
9
作者 高智强 胡婷 +3 位作者 尹彦超 张晓冬 李文东 刘颖 《中国医药导刊》 2017年第10期1031-1035,共5页
目的:研究X射线辐照处理对光果甘草中三萜类及黄酮类有效成分含量及产量的影响。方法:采用辐照剂量分别为5、10、30、50 Gy的X射线辐照处理光果甘草种子,空白对照组为未经X射线辐照处理的光果甘草种子。栽培1年后,采用高效液相色谱(HPLC... 目的:研究X射线辐照处理对光果甘草中三萜类及黄酮类有效成分含量及产量的影响。方法:采用辐照剂量分别为5、10、30、50 Gy的X射线辐照处理光果甘草种子,空白对照组为未经X射线辐照处理的光果甘草种子。栽培1年后,采用高效液相色谱(HPLC)法测定各甘草样品中甘草酸、异甘草酸、甘草苷和异甘草苷的含量,并计算其产量,运用SAS分析软件进行统计学分析。结果:随着辐照剂量的增加,各组光果甘草样品的干重、有效成分含量及产量均呈现出先升高后降低再升高的趋势;干重以及三萜类化合物的含量和产量在辐射剂量为5 Gy时达到最大值,黄酮类化合物的含量和产量在辐照剂量为50 Gy时达到最大值。结论:光果甘草经X射线辐照处理后,其黄酮类及三萜类有效成分的含量和产量均明显增加,辐照处理极有可能导致了三萜及黄酮代谢途径功能基因的变异,本研究可为光果甘草的品种改良奠定基础。 展开更多
关键词 光果甘草 X射线 HPLC 三萜类化合物 黄酮类化合物
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乌拉尔甘草查耳酮异构酶基因多态性分析 被引量:1
10
作者 马永生 张晓冬 +4 位作者 尹彦超 周姗 胡婷 高智强 刘颖 《生物技术通讯》 CAS 2017年第4期471-477,576,共8页
目的:对乌拉尔甘草黄酮代谢途径中的关键酶查耳酮异构酶(CHI)进行基因克隆及多态性分析。方法:取5株乌拉尔甘草新鲜根样,提取RNA并逆转录得cDNA,利用特异引物克隆乌拉尔甘草CHI基因,测序并对所得序列进行多态性分析。结果:共获得62条全... 目的:对乌拉尔甘草黄酮代谢途径中的关键酶查耳酮异构酶(CHI)进行基因克隆及多态性分析。方法:取5株乌拉尔甘草新鲜根样,提取RNA并逆转录得cDNA,利用特异引物克隆乌拉尔甘草CHI基因,测序并对所得序列进行多态性分析。结果:共获得62条全长为690 bp的乌拉尔甘草CHI基因cDNA序列,编码229个氨基酸残基。多态性分析显示62条CHI基因cDNA序列存在47个变异位点,可分为20种不同单倍型(单倍型1~20),其相似度为99.62%;氨基酸序列存在30个变异位点,可分为16种类型(AA1~AA16),一致性为98.99%。CHI基因编码蛋白为稳定性亲水蛋白,相对分子质量为24 400,等电点为5.3~6.7,二级结构以α螺旋和无规卷曲为主。同源性分析显示,该基因序列与豆科植物大豆的CHI基因亲缘性最近。结论:克隆了乌拉尔甘草CHI基因并对其进行了多态性分析,为进一步探究CHI基因对甘草苷生物合成的分子调控机制奠定基础。 展开更多
关键词 乌拉尔甘草 查耳酮异构酶 甘草苷 基因克隆 多态性分析
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X射线辐照处理对甘草三萜类及黄酮类有效成分含量的影响 被引量:3
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作者 胡婷 高智强 +5 位作者 马永生 周姗 尹彦超 张晓冬 李文东 刘颖 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第17期17-21,共5页
目的:探讨X射线辐照处理对乌拉尔甘草中三萜类及黄酮类有效成分含量的影响,提高栽培甘草的突变率,为甘草的分子育种奠定基础。方法:分别采用不同辐射剂量的X射线对甘草种子进行辐照处理,栽培1年后采收。采用HPLC测定甘草样品中2种三萜... 目的:探讨X射线辐照处理对乌拉尔甘草中三萜类及黄酮类有效成分含量的影响,提高栽培甘草的突变率,为甘草的分子育种奠定基础。方法:分别采用不同辐射剂量的X射线对甘草种子进行辐照处理,栽培1年后采收。采用HPLC测定甘草样品中2种三萜类成分(甘草酸、异甘草酸)及4种黄酮类成分(甘草苷、异甘草苷、甘草素及异甘草素)的含量,计算各成分产量,应用非参数检验进行统计学分析。结果:X射线辐照样品中三萜类和黄酮类有效成分的含量及产量均高于空白组。各有效成分产量随辐射剂量增加而呈先上升后下降再上升趋势。当辐射剂量为5 Gy时,各化合物的产量与空白组相比显著提高;当辐射剂量增加至10 Gy时,各化合物产量有所下降;当辐射剂量增加至20 Gy时,化合物产量再次明显提高,并在辐射剂量为50 Gy时达到最大值。结论:X射线辐照处理能增加甘草生物量及其有效物质的含量和产量,其机制可能是X射线引起甘草基因突变,从而引起代谢物的变化。 展开更多
关键词 甘草 X射线 甘草苷 异甘草苷 甘草素 异甘草素 甘草酸 异甘草酸
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UPLC法测定乌拉尔甘草与光果甘草中7个黄酮类成分的含量 被引量:15
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作者 胡婷 高智强 +5 位作者 尹彦超 张晓冬 周思含 丁宇 李文东 刘颖 《药物分析杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期763-771,共9页
目的:建立同时测定乌拉尔甘草与光果甘草药材中甘草素、异甘草素、甘草苷、异甘草苷、芹糖甘草苷、芹糖异甘草苷、甘草查尔酮A含量的高灵敏度、高效率分析方法。方法:以市售乌拉尔甘草、光果甘草为实验材料,采用UPLC法对样品中7个黄酮... 目的:建立同时测定乌拉尔甘草与光果甘草药材中甘草素、异甘草素、甘草苷、异甘草苷、芹糖甘草苷、芹糖异甘草苷、甘草查尔酮A含量的高灵敏度、高效率分析方法。方法:以市售乌拉尔甘草、光果甘草为实验材料,采用UPLC法对样品中7个黄酮类成分进行测定。使用ACQUITY UPLC BEH C_(18)色谱柱(2.1 mm×100 mm,1.7μm),以乙腈(A)-0.05%磷酸水溶液(B)为流动相,梯度洗脱,流速为0.3mL·min^(-1),检测波长分别为276 nm(检测芹糖甘草苷、甘草苷、甘草素)、360 nm(检测异甘草苷、芹糖异甘草苷)、370 nm(检测异甘草素)、380 nm(检测甘草查尔酮A),柱温40℃。结果:甘草素、异甘草素、甘草苷、异甘草苷、芹糖甘草苷、芹糖异甘草苷、甘草查尔酮A分离度良好,回归方程分别为Y=1.244 4×10~7X+2.511 4×10~2(r=0.999 9)、Y=2.676 2×10~7X+1.115 6×10~2(r=0.999 1)、Y=7.014 4×10~6X+8.672 4×10~3(r=0.996 7)、Y=1.532 8×10~7X+8.844 9×10~2(r=0.998 8)、Y=5.435 8×10~6X-2.554 9×10~3(r=0.998 7)、Y=1.227 8×10~7X-5.843 0×10~2(r=0.999 9)和Y=1.542 0×10~7X-2.888 4×10~3(r=0.996 4),线性范围分别为0.713~7.13μg、0.078 2~0.782μg、13.5~135μg、2.08~20.8μg、8.04~80.4μg、3.15~31.4μg、0.858~8.58μg,检测下限和定量下限依次为1.43 ng和3.57 ng、0.019 4 ng和0.155 ng、0.172 ng和0.515 ng、0.078 3 ng和0.235 ng、0.211 ng和0.676 ng、0.120 ng和0.361 ng、0.182 ng和0.608 ng。本方法灵敏度、精密度、准确性、重复性、回收率、耐用性均良好。乌拉尔甘草中,除甘草查尔酮A含量为(0.171±0.070)mg·g^(-1)外,其他6个成分的含量[甘草素(0.399±0.164)mg·g^(-1)、异甘草素(0.131±0.061)mg·g^(-1)、甘草苷(7.116±2.515)mg·g^(-1)、异甘草苷(0.948±0.366)mg·g^(-1)、芹糖甘草苷(4.933±1.873)mg·g^(-1)、芹糖异甘草苷(1.193±0.672)mg·g^(-1)]均高于光果甘草样品中相应成分的含量[(0.276±0.127)、(0.105±0.041)、(4.342±1.167)、(0.568±0.262)、(4.706±0.808)、(1.031±0.437)]mg·g^(-1)。甘草素与异甘草素、芹糖甘草苷与芹糖异甘草苷的含量在2种基原甘草样品中均有显著的相关关系(P<0.01)。结论:本文运用UPLC梯度洗脱方法建立了同时测定甘草药材中7个黄酮类成分含量的方法,为甘草药材质量标准的制定以及质量评价提供参考。 展开更多
关键词 乌拉尔甘草 光果甘草 甘草素 异甘草素 甘草苷 异甘草苷 芹糖甘草苷 芹糖异甘草苷 甘草查尔酮A 超高效液相色谱
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过表达CHI基因提高甘草毛状根中黄酮类化合物含量的研究 被引量:9
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作者 侯嘉铭 尹彦超 +4 位作者 田少凯 张智新 杨林 李文东 刘颖 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第1期319-327,共9页
查尔酮异构酶(chalcone isomerase,CHI,EC5.5.1.6)是甘草黄酮类有效成分生物合成途径中的第二个限速酶,发挥重要的调控作用。本课题组在前期研究基础上,筛选出黄酮高含量甘草特异对应的CHI基因型,通过基因融合法构建了过表达CHI基因的... 查尔酮异构酶(chalcone isomerase,CHI,EC5.5.1.6)是甘草黄酮类有效成分生物合成途径中的第二个限速酶,发挥重要的调控作用。本课题组在前期研究基础上,筛选出黄酮高含量甘草特异对应的CHI基因型,通过基因融合法构建了过表达CHI基因的植物双元表达载体,并通过电转法将其转化到发根农杆菌ACCC10060中,用于侵染甘草子叶和胚轴,获得过表达CHI基因的甘草毛状根系,利用qRT-PCR法测定各甘草毛状根系中CHI基因的拷贝数,并利用UPLC法测定各甘草毛状根系中4种黄酮类化合物的含量。结果显示获得了拷贝数分别为1和5的过表达CHI基因甘草毛状根系,且其总黄酮、甘草苷、甘草素和异甘草素的含量均显著高于野生型毛状根,表明过表达CHI基因能显著提高甘草毛状根中黄酮类化合物的含量。本文为解析CHI基因的功能提供了理论依据,筛选出3个过表达CHI基因甘草毛状根系用于后续扩大培养,可为离体积累甘草黄酮类化合物奠定基础。 展开更多
关键词 甘草 查尔酮异构酶 过表达 毛状根 UPLC QRT-PCR
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甘草CHS基因多态性与甘草苷含量的相关性分析 被引量:7
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作者 张晓冬 周姗 +5 位作者 尹彦超 胡婷 高智强 韩沂霖 李文东 刘颖 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第4期646-658,共13页
2015版《中华人民共和国药典》明确规定,甘草药材中甘草苷含量不得低于0.5%,然而目前市售栽培甘草大量存在甘草苷含量不达标的现象。由于功能基因多态性对于次生代谢产物的积累至关重要,因此本文试图对甘草苷生物合成途径中的关键酶—... 2015版《中华人民共和国药典》明确规定,甘草药材中甘草苷含量不得低于0.5%,然而目前市售栽培甘草大量存在甘草苷含量不达标的现象。由于功能基因多态性对于次生代谢产物的积累至关重要,因此本文试图对甘草苷生物合成途径中的关键酶——查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)进行基因多态性分析,筛选出甘草苷高/低含量样品对应的特异基因型,为进一步解析甘草苷生物合成的分子机制提供参考。本文利用HPLC法测得60株甘草样品中4种主要黄酮类化合物(甘草苷、异甘草苷、甘草素、异甘草素)的含量,应用Spearman相关性分析及χ2检验进行统计学分析,发现4种黄酮类化合物含量间具有相关关系且不同基原间含量差异显著,乌拉尔甘草>光果甘草>胀果甘草。因此筛选出含量最高的5株乌拉尔甘草及含量最低的5株胀果甘草分为黄酮高、低含量组,对其CHS基因进行克隆及序列分析。10株样品共获得了336条长度为1 175 bp的CHS c DNA序列,存在249个变异位点,其中错义突变位点141个,可分为137种单倍型;编码389个氨基酸残基,存在130个变异位点,可分为102种氨基酸序列类型;主流CHS氨基酸序列类型为AA-3,黄酮高含量组甘草样品特有的主流氨基酸序列类型为AA-35,黄酮低含量组甘草样品特有主流氨基酸序列类型为AA-36,AA-35与AA-36在193位与229位处存在I/V、V/T突变。采用Discovery Studio 2.5对蛋白三维结构进行分析,结果表明AA-35的229位的缬氨酸为底物丙二酰辅酶A的结合位点。MEGA 5.0同源性分析表明甘草CHS亲缘关系良好,与其他物种区分度良好。本文筛选获得了黄酮高/低含量组甘草样品的特异CHS基因型,对于指导优质甘草的分子育种具有重要意义。 展开更多
关键词 甘草 甘草苷 查尔酮合酶 基因多态性
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光果甘草CHS基因的克隆与多态性分析 被引量:1
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作者 高智强 胡婷 +5 位作者 张晓冬 尹彦超 吴晨华 周姗 马永生 刘颖 《中国实验方剂学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期32-38,共7页
目的:克隆光果甘草Glycyrrhiza glabra查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)基因并分析其基因多态性。方法:通过逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)从光果甘草主根中扩增得到CHS cDNA序列,测序并运用生物信息学软件对测序结果进行分析。... 目的:克隆光果甘草Glycyrrhiza glabra查尔酮合酶(chalcone synthase,CHS)基因并分析其基因多态性。方法:通过逆转录聚合酶链式反应(RT-PCR)从光果甘草主根中扩增得到CHS cDNA序列,测序并运用生物信息学软件对测序结果进行分析。结果:克隆得到19条长度为1 175 bp的光果甘草CHS cDNA序列,测序结果显示其一致性99.10%,存在81个变异位点,可分为17种单倍型;氨基酸序列分析显示,这19条cDNA序列共编码14种氨基酸序列类型,一致性99.34%,存在25个变异位点。生物信息学分析表明光果甘草CHS cDNA序列编码蛋白为稳定性亲水蛋白,平均相对分子质量42.6 kDa,等电点5.75-6.21,不含信号肽,无跨膜区,保守结构域包含1个查尔酮合酶超家族结构域,二级结构以α螺旋和无规卷曲为主。同源性分析显示,光果甘草CHS cDNA序列与乌拉尔甘草G.uralensis以及胀果甘草G.inflata在进化关系上最近,与小立碗藓Physcomitrella patens在进化关系上最远。结论:成功克隆并得到了光果甘草CHS cDNA序列,且这些序列编码区具有丰富的多态性。 展开更多
关键词 光果甘草 查尔酮合酶 克隆 生物信息学 小立碗藓 乌拉尔甘草 胀果甘草
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