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马氏珠母贝TTLL基因的序列特征、SNP筛选及其与生长性状的关联分析
被引量:
1
1
作者
尹诗欣
李志屿
+4 位作者
杨晶淼
廖永山
杨创业
邓岳文
王庆恒
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期949-959,共11页
为了探究微管蛋白酪氨酸连接酶样(tubulin tyrosine ligase-like, TTLL)在马氏珠母贝Pinctada fucata martensii中的作用,对TTLL基因的序列特征、表达模式及其SNP位点进行了相关分析。结果表明:采用RACE技术克隆获得马氏珠母贝TTLL基因c...
为了探究微管蛋白酪氨酸连接酶样(tubulin tyrosine ligase-like, TTLL)在马氏珠母贝Pinctada fucata martensii中的作用,对TTLL基因的序列特征、表达模式及其SNP位点进行了相关分析。结果表明:采用RACE技术克隆获得马氏珠母贝TTLL基因cDNA全长为1 962 bp,其中,开放阅读框(ORF)为1 611 bp,编码536个氨基酸,5′UTR长134 bp, 3′UTR长191 bp;TTLL蛋白靠近N端处具有一个TTL结构域;多序列比对及系统进化树分析显示,马氏珠母贝与其他物种的TTLL氨基酸序列具有较高的同源性,并与长牡蛎Crassostrea gigas等双壳贝类聚为一支;qRT-PCR分析显示,TTLL基因在马氏珠母贝外套膜、闭壳肌、性腺、肝胰腺、鳃和足中均有表达,在性腺中表达量最高(P<0.05),在生长性状较好的大规格群体和杂交家系中高表达(P<0.05),在卵和受精卵中的表达量也显著高于其他发育时期(P<0.05);马氏珠母贝TTLL基因共有277个SNP位点,其中,109个SNP位点符合哈迪-温伯格平衡,6个位点为中度多态,103个位点为低度多态;对基因外显子SNPs单倍型分析发现,4个SNP位点形成了2个单倍块、5种单倍型,单倍型GG为优异单倍型,其生长性状显著高于单倍型AA;对基因突变位点分析发现,7个SNP位点发生了突变,包括4个错义突变和3个同义突变,其中,位点g.7572350 T>G和g.7572368 A>G与壳宽显著性关联(P<0.05),位点g.7572405 C>T与壳长、壳高显著性关联(P<0.05),而其他突变位点对生长性状无显著性关联(P>0.05)。研究表明,TTLL基因参与马氏珠母贝的生长发育过程,且其优异单倍型GG及突变位点g.7572350 T>G、g.7572368 A>G和g.7572405 C>T均有利于马氏珠母贝的生长。
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关键词
马氏珠母贝
微管蛋白酪氨酸连接酶样(TTLL)
序列特征
表达模式
SNPS
生长性状
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职称材料
紫甘蓝色素及其在化妆品中的应用
被引量:
3
2
作者
陈燕飞
尹诗欣
+1 位作者
杨家臣
刘燕霞
《韶关学院学报》
2021年第3期65-69,共5页
为开发天然有机的色素原料,以紫甘蓝为原料,采用"水-微波提取法"高效且无添加地提取获得天然紫甘蓝色素后,研究其不同pH值环境下的色彩变化规律,以及清除自由基的作用,将其作为着色添加剂,制作成可食用、且具有保健作用的指...
为开发天然有机的色素原料,以紫甘蓝为原料,采用"水-微波提取法"高效且无添加地提取获得天然紫甘蓝色素后,研究其不同pH值环境下的色彩变化规律,以及清除自由基的作用,将其作为着色添加剂,制作成可食用、且具有保健作用的指甲油和口红等化妆品.这是对紫甘蓝色素制作化妆品的首次尝试,为紫甘蓝的多元化利用的开发如作为食品、药品、化妆品等有益添加剂,起到抛砖引玉的作用.
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关键词
紫甘蓝色素
天然色素
清除自由基
可变色色素
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职称材料
题名
马氏珠母贝TTLL基因的序列特征、SNP筛选及其与生长性状的关联分析
被引量:
1
1
作者
尹诗欣
李志屿
杨晶淼
廖永山
杨创业
邓岳文
王庆恒
机构
广东海洋大学水产学院
广东海洋大学珍珠研究所
广东省珍珠养殖与加工工程技术研究中心
出处
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期949-959,共11页
基金
广东省教育厅科研项目(2020ZDZX1045)
北海市科技计划项目(2020165010)
广东省农业农村厅科研项目(粤财农[2020]4号)。
文摘
为了探究微管蛋白酪氨酸连接酶样(tubulin tyrosine ligase-like, TTLL)在马氏珠母贝Pinctada fucata martensii中的作用,对TTLL基因的序列特征、表达模式及其SNP位点进行了相关分析。结果表明:采用RACE技术克隆获得马氏珠母贝TTLL基因cDNA全长为1 962 bp,其中,开放阅读框(ORF)为1 611 bp,编码536个氨基酸,5′UTR长134 bp, 3′UTR长191 bp;TTLL蛋白靠近N端处具有一个TTL结构域;多序列比对及系统进化树分析显示,马氏珠母贝与其他物种的TTLL氨基酸序列具有较高的同源性,并与长牡蛎Crassostrea gigas等双壳贝类聚为一支;qRT-PCR分析显示,TTLL基因在马氏珠母贝外套膜、闭壳肌、性腺、肝胰腺、鳃和足中均有表达,在性腺中表达量最高(P<0.05),在生长性状较好的大规格群体和杂交家系中高表达(P<0.05),在卵和受精卵中的表达量也显著高于其他发育时期(P<0.05);马氏珠母贝TTLL基因共有277个SNP位点,其中,109个SNP位点符合哈迪-温伯格平衡,6个位点为中度多态,103个位点为低度多态;对基因外显子SNPs单倍型分析发现,4个SNP位点形成了2个单倍块、5种单倍型,单倍型GG为优异单倍型,其生长性状显著高于单倍型AA;对基因突变位点分析发现,7个SNP位点发生了突变,包括4个错义突变和3个同义突变,其中,位点g.7572350 T>G和g.7572368 A>G与壳宽显著性关联(P<0.05),位点g.7572405 C>T与壳长、壳高显著性关联(P<0.05),而其他突变位点对生长性状无显著性关联(P>0.05)。研究表明,TTLL基因参与马氏珠母贝的生长发育过程,且其优异单倍型GG及突变位点g.7572350 T>G、g.7572368 A>G和g.7572405 C>T均有利于马氏珠母贝的生长。
关键词
马氏珠母贝
微管蛋白酪氨酸连接酶样(TTLL)
序列特征
表达模式
SNPS
生长性状
Keywords
Pinctada fucata martensii
TTLL
sequence feature
expression pattern
SNPs
growth trait
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
紫甘蓝色素及其在化妆品中的应用
被引量:
3
2
作者
陈燕飞
尹诗欣
杨家臣
刘燕霞
机构
韶关学院英东生物与农业学院
出处
《韶关学院学报》
2021年第3期65-69,共5页
文摘
为开发天然有机的色素原料,以紫甘蓝为原料,采用"水-微波提取法"高效且无添加地提取获得天然紫甘蓝色素后,研究其不同pH值环境下的色彩变化规律,以及清除自由基的作用,将其作为着色添加剂,制作成可食用、且具有保健作用的指甲油和口红等化妆品.这是对紫甘蓝色素制作化妆品的首次尝试,为紫甘蓝的多元化利用的开发如作为食品、药品、化妆品等有益添加剂,起到抛砖引玉的作用.
关键词
紫甘蓝色素
天然色素
清除自由基
可变色色素
Keywords
purple cabbage pigment
natural pigment
free radicals scavenging
color-changing pigment
分类号
S635.1 [农业科学—蔬菜学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
马氏珠母贝TTLL基因的序列特征、SNP筛选及其与生长性状的关联分析
尹诗欣
李志屿
杨晶淼
廖永山
杨创业
邓岳文
王庆恒
《大连海洋大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
下载PDF
职称材料
2
紫甘蓝色素及其在化妆品中的应用
陈燕飞
尹诗欣
杨家臣
刘燕霞
《韶关学院学报》
2021
3
下载PDF
职称材料
已选择
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