HIV全序列中重复序列的研究

文章统计了HIV全序列中所有不同长度的重复序列,并分析了其重复序列的AT/GC含量。研究发现:(1)重复序列出现的次数n与出现次数为n的重复序列总数N(n)之间存在power-law关系,这表明在HIV全序列中,只有少数重复序列会出现很多次,大部分重复序列只会出现少数几次;(2)HIV全序列中的AT含量高于GC含量,并且对于不同长度K的重复序列,100%AT含量的重复序列总是多于100%GC含量的重复序列,最长的100%AT含量的重复序列比100%GC含量的重复序列要长,这表明HIV全序列在进化过程中可能经受了更多的AT压力。通过对HIV全序列中的重复序列的分析,进一步讨论HIV进化历程及特点。