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题名基于基因芯片的儿童皮肌炎生物信息学分析
被引量:1
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作者
岑昕陶
魏姗姗
马思宁
闫璐
孙乐栋
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机构
南方医科大学珠江医院皮肤科
南方医科大学第五附属医院
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出处
《实用皮肤病学杂志》
2021年第6期326-330,共5页
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文摘
目的 通过生物信息学方法,探究与儿童皮肌炎相关的差异基因,进一步阐明儿童皮肌炎的发病机制。方法 选取基因表达汇编数据库的基因表达芯片数据(GSE11083),利用R语言筛选差异基因。使用Metascape在线工具进行GO功能和KEGG通路富集分析,同时利用String数据库和Cytoscape软件进行蛋白相互作用网络分析,并筛选儿童皮肌炎发病的关键基因。结果 筛选出差异基因共179个,其中表达上调3个,表达下调176个。GO分析显示差异基因主要富集在中性粒细胞活化、自噬和抗微生物体液反应等生物学过程。KEGG分析显示差异基因主要富集在Fc受体介导的吞噬作用、T淋巴细胞受体等信号通路。筛选获得的5个关键基因为PTPRC、LAMTOR1、CLEC12A、ITGAV和RAB5C。结论 通过对儿童皮肌炎基因芯片的生物信息学分析,PTPRC、LAMTOR1与CLEC12A等基因可能参与儿童皮肌炎的发病机制。
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关键词
皮肌炎
儿童
生物信息学
GEO数据库
差异基因
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Keywords
Dermatomyositis,juvenile
Bioinformatics
GEO database:Differentially expressed genes
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分类号
R593.26
[医药卫生—内科学]
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题名生物制剂治疗系统性红斑狼疮新进展
被引量:5
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作者
岑昕陶
孙乐栋
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机构
南方医科大学珠江医院皮肤科
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出处
《中国麻风皮肤病杂志》
2019年第9期572-576,共5页
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文摘
系统性红斑狼疮是一种表现多样的慢性自身免疫病,可累及全身。糖皮质激素及免疫抑制剂为主的传统药物对部分SLE患者的疗效欠佳,且长期应用毒副作用大。生物制剂的出现为SLE治疗带来新的选择,临床应用中也取得了一定成效。本文就生物制剂在红斑狼疮临床治疗中的新进展作一综述。
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关键词
生物制剂
治疗
系统性红斑狼疮
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Keywords
biologics
treatment
systemic lupus erythematosus
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分类号
R593.241
[医药卫生—内科学]
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