-
题名双歧杆菌BB12菌株Sec分泌途径及底物蛋白分析
- 1
-
-
作者
岳旭升
暮雪
张百惠
吴天
张路路
朱德全
-
机构
佳木斯大学理学院
佳木斯大学生命科学学院
-
出处
《安徽农业科学》
CAS
2019年第19期175-177,共3页
-
基金
黑龙江省大学生创新创业训练计划重点项目(201810222022)
-
文摘
[目的]采用生物信息学方法分析双歧杆菌BB12菌株的Sec途径分泌系统及预测底物蛋白。[方法]以双歧杆菌BB12菌株基因组注释的蛋白氨基酸序列为研究对象,在NCBI中以Fasta形式下载,采用一系列生物信息学软件分析该基因组中Sec分泌途径及底物蛋白行使的功能,同时采用COG功能数据库对这些蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]通过分析发现双歧杆菌BB12菌株Sec分泌途径相关的蛋白基因共有9个,其中5个是Sec分泌途径构建蛋白基因,2个信号肽酶识别基因,1个脂蛋白信号肽识别基因和1个信号肽识别蛋白编码基因。Sec底物蛋白分析发现该菌共含1583个蛋白,经过Sec分泌途径到细胞外的蛋白有57个,35个具有COG功能,占61%,其中被SpaseI型信号肽酶识别的有37个,被SpaseⅡ型信号肽酶识别的有20个。[结论]COG功能注释显示一些蛋白没有功能,有功能的蛋白主要与氨基酸运输和代谢、碳水化合物的运输和代谢、功能细胞壁/膜和无机离子运输和代谢功能有关。
-
关键词
双歧杆菌BB12
基因组
分泌蛋白
功能分析
-
Keywords
Bifidobacterium BB12
Genome
Secreted protein
Functional analysis
-
分类号
TS201
[轻工技术与工程—食品科学]
-