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牛裂体吸虫线粒体DNA序列和基因排序分析
被引量:
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作者
肖景莹
蔡连顺
+5 位作者
長瀧充
德弘慎治
Jarilla Blanca R.
嶋田雅暁
David Blair
吾妻健
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期252-256,共5页
目的为探讨牛裂体吸虫(Schistosoma bovis)在裂体属内的系统发生位置,测定牛裂体吸虫线粒体基因部分序列,并分析该编码区域的基因序列和基因排序。方法以GNT-K法抽提牛裂体吸虫成虫基因组DNA,用兼并和特异引物扩增目的基因。扩增产物经...
目的为探讨牛裂体吸虫(Schistosoma bovis)在裂体属内的系统发生位置,测定牛裂体吸虫线粒体基因部分序列,并分析该编码区域的基因序列和基因排序。方法以GNT-K法抽提牛裂体吸虫成虫基因组DNA,用兼并和特异引物扩增目的基因。扩增产物经纯化后克隆于pGEM1T质粒载体,并转化大肠埃希菌。抽提和纯化阳性质粒DNA,并测序。以纯化后的阳性质粒DNA为模板,根据已获得的序列设计内部特异引物,采用引物步移法获得全长目的片段。在GenBank中查找曼氏血吸虫等相关血吸虫线粒体基因序列,作基因排序及比较分析后,以邻接法绘制系统发生树。结果测定了牛裂体吸虫线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基Ⅳ~Ⅰ基因序列(nicotinamide adeninedinucleotide dehydrogenase subunit4-1gene,nad4-nad1),其长度为2214bp。分析该编码区基因排序为nad4-trnQ(Gln)-trnK(Lys)-nad3-trnD(Asp)-nad1。牛裂体吸虫在该区域的线粒体基因排序与非洲支系血吸虫相似,与亚洲支系血吸虫有很大的不同;根据牛裂体吸虫与其他8种吸虫部分nad4,nad3,部分nad1和部分nad4+nad3+nad1基因序列比对结果,分别构建系统发生树。结果表明,牛裂体吸虫与埃及血吸虫位于同一簇,归属于非洲血吸虫支系,这与由基因排序推测的牛裂体吸虫的系统发生位置结果相一致。结论牛裂体吸虫属于非洲支系而非亚洲支系血吸虫。
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关键词
牛裂体吸虫
nad4
nad3
nad1
基因排序
系统发生关系
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职称材料
题名
牛裂体吸虫线粒体DNA序列和基因排序分析
被引量:
1
1
作者
肖景莹
蔡连顺
長瀧充
德弘慎治
Jarilla Blanca R.
嶋田雅暁
David Blair
吾妻健
机构
日本高知大学医学部
佳木斯大学基础医学院
日本长崎大学热带医学研究所
澳大利亚詹姆斯库克大学热带生物学院
出处
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第4期252-256,共5页
基金
日本学术振兴会科学研究费补助金(No.16406010)
黑龙江省科技厅科学技术研究项目(No.LC2009C15)
佳木斯大学科学技术研究项目(No.S2009-066)~~
文摘
目的为探讨牛裂体吸虫(Schistosoma bovis)在裂体属内的系统发生位置,测定牛裂体吸虫线粒体基因部分序列,并分析该编码区域的基因序列和基因排序。方法以GNT-K法抽提牛裂体吸虫成虫基因组DNA,用兼并和特异引物扩增目的基因。扩增产物经纯化后克隆于pGEM1T质粒载体,并转化大肠埃希菌。抽提和纯化阳性质粒DNA,并测序。以纯化后的阳性质粒DNA为模板,根据已获得的序列设计内部特异引物,采用引物步移法获得全长目的片段。在GenBank中查找曼氏血吸虫等相关血吸虫线粒体基因序列,作基因排序及比较分析后,以邻接法绘制系统发生树。结果测定了牛裂体吸虫线粒体烟酰胺腺嘌呤二核苷酸脱氢酶亚基Ⅳ~Ⅰ基因序列(nicotinamide adeninedinucleotide dehydrogenase subunit4-1gene,nad4-nad1),其长度为2214bp。分析该编码区基因排序为nad4-trnQ(Gln)-trnK(Lys)-nad3-trnD(Asp)-nad1。牛裂体吸虫在该区域的线粒体基因排序与非洲支系血吸虫相似,与亚洲支系血吸虫有很大的不同;根据牛裂体吸虫与其他8种吸虫部分nad4,nad3,部分nad1和部分nad4+nad3+nad1基因序列比对结果,分别构建系统发生树。结果表明,牛裂体吸虫与埃及血吸虫位于同一簇,归属于非洲血吸虫支系,这与由基因排序推测的牛裂体吸虫的系统发生位置结果相一致。结论牛裂体吸虫属于非洲支系而非亚洲支系血吸虫。
关键词
牛裂体吸虫
nad4
nad3
nad1
基因排序
系统发生关系
Keywords
Schistosoma bovis
NADH dehydrogenase 4
NADH dehydrogenase 3
NADH dehydroge-nase 1
Gene order
Phylogenetic relationship
分类号
R383.2 [医药卫生—医学寄生虫学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
牛裂体吸虫线粒体DNA序列和基因排序分析
肖景莹
蔡连顺
長瀧充
德弘慎治
Jarilla Blanca R.
嶋田雅暁
David Blair
吾妻健
《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2010
1
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职称材料
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