基于LASSO回归筛选影响肺腺癌患者预后的糖酵解相关基因

目的:确定用于评估肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)患者糖酵解相关基因的风险评分模型。方法:使用公共数据库癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中LUAD患者转录组数据,通过基因富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)、差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)分析和最小绝对收缩选择算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)回归分析构建风险预测模型。通过Kaplan-Meier分析、受试者工作特征(receiver operating characteristic,ROC)曲线、单因素及多因素Cox回归分析验证模型预测性能。使用CIBERSORT算法计算高、低风险两组免疫细胞浸润差异。构建用于临床预测患者预后的列线图。结果:识别出3个糖酵解相关基因集,筛选出6个糖酵解相关基因构建风险评分模型。高风险组总生存率显著低于低风险组,验证性结果显示该模型有良好的预测性能。高、低风险两组的免疫细胞浸润情况存在显著差异。列线图的构建开发了一种可以预测LUAD患者生存率的定量方法。结论:基于糖酵解相关基因构建的风险评分模型为早期LUAD患者预测预后提供了新型生物标志物。

名医传承知识图谱的构建方法与应用研究

目的:传统名医传承方式受时间、学习方式等限制,造成学习内容通常重实践、少理论,技术丰富,知识面窄。构建名医学术传承知识图谱用以弥补在传统传承方式中的缺憾。方法:本文提出将知识图谱与名医传承相结合,通过“自上向下”的知识图谱构建方式与高质量的结构化数据,建立较为全面的知识体系。结果:形成的名医传承知识图谱包含名家学术思想和经验,也包含师承关系与学术脉络。结论:名医学术思想的传承是中医药学发展的关键,名医知识图谱的构建未来能够让更多的人学习、传承各位名老中医的思想,为名医传承提供助力。

一种面向Hadoop平台的自适应授权机制

针对Hadoop授权系统对系统管理员强依赖且不够灵活的问题,以增强授权工作的时效性与全面性为目的建立了一种自适应授权机制。考虑到用户访问行为随时间动态变化特点,提出通过用户的审计日志数据进行用户行为分析的方法,对用户可疑状态进行评估,为Hadoop平台提出较为准确的权限调整建议。建立的面向Hadoop平台的自适应授权机制,能够根据用户实时行为数据动态调整用户对Hadoop平台相关资源的访问权限。Hadoop平台的授权工作是保护大数据环境下用户敏感信息和隐私数据的重要工作,通过建立一种自适应授权机制,能够为Hadoop平台的授权工作提供助力。

SM-PCR技术检测血浆ctDNA在晚期肺腺癌患者治疗中的应用

目的:探讨单分子PCR(single molecule-PCR,SM-PCR)技术检测血浆ctDNA在晚期肺腺癌患者治疗中的应用。方法:分析2017年6月至2018年5月就诊于天津医科大学肿瘤医院的晚期肺腺癌患者30例,使用SM-PCR技术富集血液样本目标基因(EG-FR、KRAS、BRAF、ALK、HER2、TP53)区域的ctDNA片段,构建测序文库,进行高通量测序;使用基于扩增阻滞突变系统(amplication refractory mutation system,ARMS)实时荧光PCR法进行肿瘤组织样本EGFR检测,比较血浆与组织表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)突变检测结果的一致性。结果:SM-PCR与ARMS-PCR两种方法检测结果一致性较好(Kappa=0.867,P<0.001);McNemar检验亦提示检测结果差异无统计学意义(P=0.500)。结论:SM-PCR技术可用于血浆EGFR突变检测,其目标检测位点更全面,且可同时检测多种突变,分析结果更为精细,可实现绝对定量。

安罗替尼治疗KRAS突变型晚期肺腺癌1例

近年来,晚期非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)患者逐渐增多,治疗方法也明显增多,然而,目前对于靶向治疗表皮生长因子受体(epidermal growth factor receptor,EGFR)/间变性淋巴瘤激酶(anaplastic lymphoma kinase,ALK)耐药或化疗失败的三线及以上患者,国内外并没有标准的治疗方案,临床治疗效果也不尽如人意,安罗替尼是一种新型小分子多靶点酪氨酸激酶抑制剂,可强效抑制血管内皮细胞生长因子受体(vascular endothelial growth factor receptor,VEGFR)、血小板衍生生长因子受体(platelet-derived growth factor receptor,PDGFR)、纤维母细胞生长因子受体(fibroblast growth factor receptor,FGFR)和c-Kit等多个靶点,ALTER0303是一项关于安罗替尼作为晚期NSCLC三线治疗方案的临床研究,结果显示安罗替尼能显著延长晚期NSCLC患者的总生存期(overall survival,OS)和无进展生存期(progression-free survival,PFS),本文报道安罗替尼治疗KRAS突变型晚期肺腺癌1例。

ALK阳性非小细胞肺癌患者口服阿来替尼所致心动过缓1例

患者女性,71岁,主因“咳嗽咳痰伴发热1个月余”于2019年3月就诊于外院。既往体健,否认高血压、心脏病、糖尿病史,否认吸烟史和肿瘤家族史。ECOG评分1分。2019年3月外院胸部强化CT显示:右下肺中央型肺癌伴右肺中叶不张;右肺下叶结节,纵隔肿大淋巴结,考虑转移瘤;心包积液;肝内低密度灶,转移瘤。头部MRI显示:左枕叶异常信号,转移瘤可能。ECT显示:胸骨、左侧第6肋、T5、T12、L4椎体、右侧骶髂关节、右侧髋臼放射性浓聚影,考虑转移。气管镜病理显示:(肺)浸润性腺癌,以乳头状生长为主。免疫组织化学法检测结果显示:CK5/6(-),CK7(+),Ki-67(+<25%),TTF-1(+),P40(-),Napsin-A(+)。心电图显示正常。诊断:右肺癌,腺癌,ⅣB期(T2aN2M1c,骨、脑转移)。

基于数据流攻击特征值的异常流量监测研究

针对预算不高的中小型企业,通过研究流量监测模型,采用准确率以及检测效率高的特征值库检测方法,设计并实现了一个异常流量监测系统。基于Web应用的常见漏洞特别是最新漏洞的攻击代码来设置特征值对流量进行监测,具有数据包解析、异常检测、会话提取、文件提取4个功能。并能通过整体流量的可视化统计分析、协议分析和展示IP访问地图,让用户的体验更加直观清晰,具有低成本、简洁高效的特点。

Super-ARMS法检测EGFR突变在NSCLC的临床应用

目的:探讨Super-ARMS法检测体液EGFR突变在晚期非小细胞肺癌(NSCLC)患者治疗中的应用。方法:收集天津医科大学肿瘤医院自2019年4月1日—2019年12月30日161例NSCLC患者的血液、脑脊液、心包积液标本,采用Super-ARMS法对EGFR基因片段进行检测,根据突变结果对EGFR突变类型分析判断。结果:161例NSCLC患者标本中,86例(53.4%)EGFR突变阳性。19号外显子(19-del)缺失、21号外显子(L858R)基因点突变及T790M点突变最常见。S768I有5例(3.1%);G719X突变4例(2.5%);L861Q有1例(0.6%);不同性别、是否吸烟者之间突变差异均无统计学意义(均P>0.05);在年龄、是否存在EGFR-TKIs治疗史间差异均有统计学意义(均P<0.05)。EGFR基因突变率在女性、不吸烟患者中较高。结论:NSCLC患者EGFR突变率较高。Super-ARMS法可用于体液EGFR突变检测,其结果较准确,且可同时检测多种突变及并存突变。

LC-FT-ICR-MS方法鉴定黄连解毒汤在大鼠血浆中的原形及代谢产物研究

为深入研究黄连解毒汤体内发挥疗效的效应物质基础,本文采用正负离子扫描模式下的LC-FT-ICR-MS方法,通过与黄连解毒汤提取物和混合对照品的保留时间和高分辨质谱信号比较分析,发现并确证了给予黄连解毒汤后大鼠血浆中主要的38个入血成分,包括22个原形成分和16个代谢产物。在原型成分中,16个原型化合物通过与对照品比对得到了准确鉴定;在代谢产物中,除M11为一相代谢产物外,黄连解毒汤主要成分在大鼠体内多以二相代谢产物形式存在,包括葡糖醛酸和硫酸化产物。该研究通过对黄连解毒汤入血成分的分析,基本阐明了黄连解毒汤体内发挥药效的可能作用物质基础,为进一步的药理作用及其机制研究提供了依据。