三品种外种猪SLA-DQA基因的PCR-RFLP分析

对杜洛克、长白猪和大白猪的SLA-DQA第1和第2内含子部分序列以及完整的第2外显子进行群体分析,PCR-RFLP分型。结果表明:三品种猪在EcoRⅠ酶切位点上,基因型频率BB(0.5604)高于AB(0.3626)和AA(0.0769),B等位基因频率较高;在AluⅠ酶切位点上,基因型频率NN(0.6154)高于MN(0.3407)和MM(0.0440),N等位基因频率较高。三品种猪仅在EcoRⅠ酶切位点上达到Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),各组合基因型频率差异均不显著(P>0.05)。在2个酶切位点上,杜洛克的杂合度最高为0.4966,依次为大白猪0.2774和长白猪0.1467。

猪5个群体SLA微卫星遗传多样性

文章旨在比较广东地方猪、华南野猪(S.s.chirodontus)和引入品种白细胞抗原复合体(Swine leukocyteantigen complex,SLA)的遗传多样性,为猪的抗病选育提供理论依据。在SLA区域内选取18个多态性丰富的微卫星(SLA-MS),分别对皮特兰、杜洛克、大花白、蓝塘猪以及华南野猪进行遗传分型。结果表明,SLA不同区域平均遗传多样性高低依次为SLAⅡ(He=0.628,PIC=0.581)>SLAⅠ(He=0.530,PIC=0.474)>SLAⅢ(He=0.526,PIC=0.458);5个群体间分子多样性指数(MDI)依次为华南野猪(0.716)>蓝塘猪(0.614)>大花白(0.559)>皮特兰(0.550)>杜洛克(0.507)。总体看来,SLA-MS的遗传多样性高低依次为华南野猪>广东地方猪>引入品种。基于Garza-Williamson指数(GWI)分析,杜洛克和大花白相较于华南野猪瓶颈效应严重;遗传距离分析表明蓝塘猪和华南野猪首先聚为一类,然后与大花白聚为一大类,而皮特兰和杜洛克则单独聚为一支。文章为广东地方猪种质资源的保护、抗病选育和配套系的生产提供了理论基础。

外种猪SLA-MS分型与免疫参数的关联

【目的】研究大白猪、长白猪的白细胞抗原复合体(swine leukocyte antigen,SLA)区域微卫星遗传多样性,探讨单倍型与免疫参数的相关性,为猪抗病育种提供参考依据。【方法】在SLA区域内筛选了13个多态性丰富的微卫星座位计算遗传多样性,并在Ⅰ、Ⅱ类区域筛选靠近功能基因且多态性丰富的微卫星进行单倍型分型,分析单倍型与免疫参数的关联。【结果】大白猪的期望杂合度(He=0.70)和多态信息含量(PIC=0.65)均分别高于长白猪(He=0.67,PIC=0.62);Ⅰ类区域6种单倍型与免疫参数的多重比较表明,H2的红细胞平均血红蛋白浓度(mean corpuscular hemoglobin concentration,MCHC)分别显著高于H3和H5的值(P<0.05,P<0.01);H2的血小板分布宽度(platelet distribution width,PDW)显著低于H3的值(P<0.05)。Ⅱ类区域的12种单倍型与免疫参数的多重比较表明,H1′的红细胞计数(red blood cell count,RBC)差异显著低于H6′、H9′对应的值(P<0.05);H1′的淋巴细胞(lymphocytes,LYM)百分比显著低于单倍型H7′的值(P<0.05),极显著低于H6′、H9′和H11′的值(P<0.01);H6′的MCHC的数值显著低于H7′的值(P<0.05),极显著低于H1′、H11′的值(P<0.01);H9′的MCHC的值显著低于H1′、H7′和H11′的值(P<0.05);H9′的红细胞平均体积(mean corpuscularvolume,MCV)显著低于单倍型H1′、H6′和H11′的值(P<0.05),极显著低于H7′的值(P<0.01);H11′的单核细胞(monocytes,MONO)百分比显著低于H6′、H7′(P<0.05)和H1′的值(P<0.01),H6′、H7′和H9′的值分别显著低于H1′的值(P<0.05,P<0.01)。【结论】大白猪的SLA微卫星遗传多样性高于长白猪,SLA区域不同微卫星单倍型与免疫参数PDW、MCHC、RBC、MCV、LYM、MONO存在关联,这可进一步用于猪的健康指数的评价。

SLAⅠ类基因研究新进展

SLAⅠ类基因编码细胞表面高度多态的糖蛋白,负责将内源性抗原肽递呈给T细胞,激发特异的免疫反应。文章介绍了近年来SLAⅠ类基因分子结构、组织中的表达、表达调节、基因分型、多态性及进化研究的新进展,重点介绍了SLAⅠ类基因分型方法及多态性研究。SLAⅠ类基因分型方法主要包括血清学法、DNA序列测定、PCR-SSP、PCR-SSOP、微卫星法,其中PCR-SSP法快速简便,在SLAⅠ类基因分型研究中应用广泛。文章对SLAⅠ类基因在基因功能、肽疫苗、异种移植等方面的研究和应用前景进行了讨论。