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基于地理环境相似度的长江经济带入侵物种虚拟负样本生成方法
1
作者
肖巍峰
左绿荇
+1 位作者
杨文涛
李朝奎
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期214-224,共11页
入侵物种空间分布建模的核心数据源来源于物种多样性采样(物种出现点和未出现点),然而,大多数入侵物种标本库只记录物种出现点样本信息,缺乏对未出现点(负样本)位置的记录。因此,生成有效的入侵物种虚拟负样本是建立物种空间分布模型的...
入侵物种空间分布建模的核心数据源来源于物种多样性采样(物种出现点和未出现点),然而,大多数入侵物种标本库只记录物种出现点样本信息,缺乏对未出现点(负样本)位置的记录。因此,生成有效的入侵物种虚拟负样本是建立物种空间分布模型的关键。本文提出了一种基于地理环境相似度的虚拟负样本生成方法。首先利用主成分分析(PCA)方法对地理环境原始变量进行线性相关性建模,基于提取的主成分,采用K-means算法对入侵物种样本进行聚类分析并计算各样本的地理环境相似度。在此基础上,通过建立基于主成分的入侵物种相似性度量与可信度计算框架来识别虚拟负样本。以长江经济带入侵物种一年蓬(Erigeron annuus)数据集为例,分析了整个区域虚拟负样本的可信度。结果表明,与空间随机采样和单类支持向量机采样相比,用本研究提出的方法生成的样本数据建立的logistic回归和支持向量机预测结果更优,验证了该方法的可行性与有效性。基于地理环境相似度的虚拟负样本抽样策略有助于解决由于随机采样而引起的误采样到潜在入侵点的难题,同时负样本的可信度能有助于识别不同等级的入侵物种适应区。
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关键词
入侵物种
地理环境
可信度
一年蓬
长江经济带
原文传递
题名
基于地理环境相似度的长江经济带入侵物种虚拟负样本生成方法
1
作者
肖巍峰
左绿荇
杨文涛
李朝奎
机构
湖南科技大学地球科学与空间信息工程学院
湖南省地质灾害监测预警与应急救援工程技术研究中心
湖南科技大学测绘遥感重点实验室
出处
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第1期214-224,共11页
基金
湖南省自然科学基金创新研究群体项目(2020JJ1003)
湖南省教育厅科研项目(20C0805)。
文摘
入侵物种空间分布建模的核心数据源来源于物种多样性采样(物种出现点和未出现点),然而,大多数入侵物种标本库只记录物种出现点样本信息,缺乏对未出现点(负样本)位置的记录。因此,生成有效的入侵物种虚拟负样本是建立物种空间分布模型的关键。本文提出了一种基于地理环境相似度的虚拟负样本生成方法。首先利用主成分分析(PCA)方法对地理环境原始变量进行线性相关性建模,基于提取的主成分,采用K-means算法对入侵物种样本进行聚类分析并计算各样本的地理环境相似度。在此基础上,通过建立基于主成分的入侵物种相似性度量与可信度计算框架来识别虚拟负样本。以长江经济带入侵物种一年蓬(Erigeron annuus)数据集为例,分析了整个区域虚拟负样本的可信度。结果表明,与空间随机采样和单类支持向量机采样相比,用本研究提出的方法生成的样本数据建立的logistic回归和支持向量机预测结果更优,验证了该方法的可行性与有效性。基于地理环境相似度的虚拟负样本抽样策略有助于解决由于随机采样而引起的误采样到潜在入侵点的难题,同时负样本的可信度能有助于识别不同等级的入侵物种适应区。
关键词
入侵物种
地理环境
可信度
一年蓬
长江经济带
Keywords
invasive species
geographic environment
confidence level
Erigeron annuus
the Yangtze River Economic Belt
分类号
Q16 [生物学—普通生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于地理环境相似度的长江经济带入侵物种虚拟负样本生成方法
肖巍峰
左绿荇
杨文涛
李朝奎
《生物多样性》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
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