舌鳞状细胞癌来源的C.sputigena的分离、鉴定及全基因组分析

目的:分离及鉴定舌鳞状细胞癌(tongue squamous cell carcinoma,TSCC)来源的生痰二氧化碳嗜纤维菌(C.sputigena),从基因组水平分析其耐药和毒力特征。方法:对TSCC患者的癌组织黏膜的细菌进行分离培养,获得菌株n105及n106。通过菌落形态、革兰染色、16S rRNA序列分析及进化树构建鉴定菌种,采用纸片扩散法检测菌株对4种抗菌药物(克拉霉素、对甲硝唑、青霉素和左氧氟沙星)的敏感性,采用第三代测序技术对菌株n106进行全基因组测序。结果:菌株n105及n10616S r RNA序列经BLAST比对及构建Neighbour-Joining进化树,鉴定为C.sputigena。药敏实验表明,C.sputigena菌株n105及n106对克拉霉素敏感,对甲硝唑、青霉素和左氧氟沙星均耐药。全基因组测序结果发现,C.sputigena菌株n106的基因组长度为2.86 Mb,鸟嘌呤-胞嘧啶含量为38.36%,编码2609个基因。预测毒力基因为tufA、app、clpV、cpsA、acpXL和fHbp,耐药基因为blaCSP-1和erm(F)。结论:TSCC来源的C.sputigena对甲硝唑、青霉素和左氧氟沙星耐药,携带多种毒力及耐药基因,具备潜在致病特征。从微生物角度为早期防控和治疗TSCC提供了新的策略。