新疆高致病性禽流感流行病学调查与疫源分析

2004年以来．世界范围内暴发了高致病性禽流感（High Pathogenic Avian Influenza．HPAI）疫情．疫情波及亚洲、欧洲、非洲及北美洲，中国有多个省区发生了HPAI疫情。2005年的11月11日新疆喀什地区泽普县发生了HPAI疫情．并在短短的1个月内．新疆近2000多公里的范围内出现多达10个HPAI疫点．全年共计11起．成为全国的HPAI重点灾区之一。

禽流感病毒新疆株A/Duck/XJ/4的M基因的序列分析

利用RT-PCR技术对禽流感病毒新疆株A/Duck/XJ/4的M基因进行了扩增与克隆,得到了全长核苷酸序列为1 016 bp的M基因,序列分析表明,M基因最大的开放阅读框位于19-1 000碱基;M1蛋白位于19-777碱基,编码252个氨基酸。M2蛋白位于19-44碱基和733-1 000碱基,编码97个氨基酸。同源性分析显示,A/Duck/XJ/4株M基因的核苷酸序列和氨基酸序列与所选H5N1亚型的参考毒株以及所选不同HA亚型的参考毒株均有很高的同源性。

禽流感病毒新疆株A/Duck/XJ/4的NP基因序列分析

用RT-PCR法，以1株H5N1亚型禽流感病毒新疆分离株A／Duck／XJ／4为模板，扩增了NP全基因cD-NA，克隆至T载体，并进行序列测定。序列分析结果表明：扩增的NP基因全长1518 bp，最大的开放阅读框在18～1514 bp，编码499个氨基酸。将A／Duck／XJ／4毒株NP基因序列与15株A型流感病毒NP基因序列进行比较，各毒株间NP基因核苷酸序列同源性81．4％～99．0％，编码的氨基酸同源性在92．8％～99．6％。

H5N1亚型禽流感病毒新疆株HA基因的克隆及序列分析

参照已发表的H5N1亚型禽流感的HA基因序列，设计了1对引物，对禽流感病毒新疆株A／Duck／XJ／3（H5N1）、A／Duck／XJ／4（H5N1）、A／CH／XJ／5（H5N1）、A／Goose／XJ／10（H5N1）和A／Duck／XJ／11（H5N1）进行RT—PCR扩增和克隆，获得了5个毒株的HA全长核苷酸序列，分别为1779bp、1774bp、1776bp、1758bp和1740bp序列分析表明，在HA切割位点处均有多个连续的碱性氨基酸（-R-E-R-R-R-K-K-R-）插入，具有高致病性禽流感病毒的特征，同源性分析表明，新疆分离株之间的核苷酸同源性在96.9％～98.8％；与来自青海湖斑头雁、广西天鹅、香港白鹭和台湾鸽等不同野禽毒株同源性为95.7％～100％；与来自香港、越南、浙江的人源禽流感毒株的同源性为95.2％～98.2％。

H5N1亚型禽流感病毒新疆株NA基因的克隆及序列分析

利用RT-PCR技术对3株H5N1亚型高致病性禽流感病毒新疆株的NA基因进行了扩增,分别得到了3个毒株的NA基因,序列分析表明,3个毒株NA的全长核苷酸序列均为1 380 bp。同源性分析表明,3个分离株之间的核苷酸同源性在95.1%-97.9%之间;与来自青海、浙江、广东、东南亚等不同地区水禽禽流感病毒毒株的同源性为90.3%-98.8%;与分离自香港、浙江、越南等地区的流感病毒同源性为86.7%-97.9%。