目的探寻金叶败毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)的药理作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP...目的探寻金叶败毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)的药理作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中药分子机制的生物信息学分析工具(Bioin⁃formatics Analysis Tool for Molecular Mechanism of Traditional Chinese Medicine,BATMAN-TCM)检索筛选金叶败毒颗粒中金银花、蒲公英、鱼腥草、大青叶的化学成分和作用靶点。查询OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)、GeneCards数据库获得疾病相关靶点基因,进而运用Cytoscape软件构建药物活性分子-靶点基因作用网络,通过R语言包clusterProfiler进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释和基于京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,预测金叶败毒颗粒对COVID-19的作用机制。结果共筛选获得药物活性分子31个。靶点基因110个,主要包含PTGS2、AR、ESR1、PPARG、PRSS1、NOS2、NR3C2等核心靶点。富集分析得到GO条目2138项(P<0.05),KEGG信号通路134条(P<0.05),主要富集的通路有AGE-RAGE信号通路、动脉粥样硬化、TNF-α信号通路、甲型流感等。结论金叶败毒颗粒的活性化合物能作用于TNF信号等核心炎症通路,从而对COVID-19起到抗氧化损伤、抗炎作用。展开更多
文摘目的探寻金叶败毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019,COVID-19)的药理作用机制。方法通过中药系统药理学数据库与分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中药分子机制的生物信息学分析工具(Bioin⁃formatics Analysis Tool for Molecular Mechanism of Traditional Chinese Medicine,BATMAN-TCM)检索筛选金叶败毒颗粒中金银花、蒲公英、鱼腥草、大青叶的化学成分和作用靶点。查询OMIM(Online Mendelian Inheritance in Man)、GeneCards数据库获得疾病相关靶点基因,进而运用Cytoscape软件构建药物活性分子-靶点基因作用网络,通过R语言包clusterProfiler进行基因本体(gene ontology,GO)功能注释和基于京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,预测金叶败毒颗粒对COVID-19的作用机制。结果共筛选获得药物活性分子31个。靶点基因110个,主要包含PTGS2、AR、ESR1、PPARG、PRSS1、NOS2、NR3C2等核心靶点。富集分析得到GO条目2138项(P<0.05),KEGG信号通路134条(P<0.05),主要富集的通路有AGE-RAGE信号通路、动脉粥样硬化、TNF-α信号通路、甲型流感等。结论金叶败毒颗粒的活性化合物能作用于TNF信号等核心炎症通路,从而对COVID-19起到抗氧化损伤、抗炎作用。