油茶炭疽病新致病菌Colletotrichum kahawae的多基因序列鉴定

本研究通过林间病情观察,组织分离法分离纯化病健交界处病原菌,根据柯赫氏法则检测其致病性,采用形态学方法初步鉴定了7株典型炭疽属真菌,分别为MYGD1、MYGD2、MYGD3、MYGD4、MYGD5、MYGD6和MYGD7,结合形态学及分子鉴定对该7株病原菌进行了系统鉴定。结果表明:在ITS-CAL-GAPDH-ACT-TUB 5个基因所构建的系统发育树中,MYGD7与卡哈瓦炭疽菌(Colletotrichum kahawae)以99%的置信度聚为一个独立进化分支;MYGD1与果生炭疽菌(Colletotrichum fructicola)的权威菌株ICMP18613以99%的置信度聚为一个独立进化支;MYGD2、MYGD3、MYGD4、MYGD5、MYGD6与山茶炭疽菌(Colletotrichum camelliae)的权威菌株ICMP 10643和ICMP 18542以99%的置信度聚为一个独立进化分支。根据形态学特征,结合多基因系统发育树,鉴定MYGD7为卡哈瓦炭疽菌,MYGD1为果生炭疽菌,MYGD2、MYGD3、MYGD4、MYGD5和MYGD6为山茶炭疽菌。这是卡哈瓦炭疽菌为油茶炭疽病病原菌的首次报道。炭疽病是油茶的主要病害之一,明确贵州省油茶炭疽病的病原菌种类,对该病害的科学防治具有重要意义。

高通量RNA-seq技术开发梵净山重楼SSR标记

梵净山重楼(Paris polyphylla Smith var. chinensis)是中国重要的中草药之一。本研究利用MISA软件从重楼块根高通量转录组数据库的38 802条Unigenes中共搜索挖掘出6 333个SSR标记。66.76%的二核苷酸重复是这些SSR标记的主要重复类型,然后是18.77%的三核苷酸重复、11.50%的单核酸苷酸重复及2.97%的四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复。在所有被功能注释的Unigenes中,481条Unigenes涉及调控重楼皂苷、黄酮、种子萌发和种子生长发育,从这些Unigenes共搜索挖掘到90个SSR标记。通过对这90个SSR标记的有效性验证,获得具有清晰扩增条带的SSR标记20对。以选取的14份重楼种质为材料,对扩增出清晰条带的20对SSR标记进行多态性检测后,获得16对具有多态性的SSR标记引物。引物多态性信息含量指数(polymorphism information content, PIC)介于0.067~0.561,平均值为0.293;14个重楼种质聚类在两个不同类群。本研究结果可为梵净山重楼种质资源鉴定、遗传多样性分析和分子标记辅助选择育种提供SSR标记。