基于多种网络药理平台探讨小陷胸汤治疗高血压的作用机制

目的:基于网络药理学方法探讨小陷胸汤治疗高血压的作用机制。方法:通过SymMap、TCMSP、DrugBank 3个数据库获得小陷胸汤的有效成分及其靶点;并与TCMSP、TCMIP、DrugBank 3个数据库收集的高血压的靶点进行比对,获得小陷胸汤作用于高血压的靶点。运用David数据库对小陷胸汤和高血压共同作用靶点蛋白进行GO富集分析和KEGG通路富集分析;运用STRING数据库得到小陷胸汤作用于高血压的PPI网络;运用Cytoscape对PPI网络进行拓扑分析得到关键靶点。结果:小陷胸汤作用于高血压的有效成分有33个,相关靶点48个,关键靶点基因14个。GO富集分析显示,小陷胸汤治疗高血压的生物过程显著富集在对非生物刺激的反应、毒蕈碱型乙酰胆碱受体信号通路、系统过程的调节、第二信使介导的信号、细胞增殖等;细胞组分主要富集在轴突、质膜部分、不对称突触、神经末梢、神经元投射、突触后膜、细胞外基质等;分子功能主要富集在胺受体活性、肾上腺素受体活性、毒蕈碱乙酰胆碱受体活性、G蛋白偶联的乙酰胆碱受体活性、α-肾上腺素受体活性等;KEGG通路富集显示小陷胸汤治疗高血压影响的通路主要有神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、血管平滑肌收缩、肌动蛋白细胞骨架的调节、色氨酸代谢等。结论:小陷胸汤治疗高血压的机制可能是通过小陷胸汤黄连的成分槲皮素、小檗碱、R-氢化小檗碱,半夏的成分卡文定碱、豆甾醇、松柏苷和瓜蒌的成分菠菜甾醇等达到抗炎抗氧化应激,改善内皮功能等作用,通过调节相关靶蛋白的基因表达,调控血管组织重构与细胞外基质代谢,减轻炎性反应,参与神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路、血管平滑肌收缩等通路来降低血压。

基于网络药理学和分子对接预测大黄素治疗脑缺血中风的作用机制

目的:利用网络药理学和分子对接的方法,预测大黄素治疗脑缺血中风的作用机制。方法:使用SymMap、TCMSP、OMIM、Drugbank数据库获得大黄素治疗脑缺血中风靶点,并通过Uniprot数据库进行格式统一及非人源靶点的去除。然后利用AlzData数据库进行大黄素治疗脑缺血中风的靶点在大脑细胞中的分布表达情况分析,使用DAVID数据库对其进行KEGG通路分析和GO分析,得到相关通路。结果:大黄素治疗脑缺血中风的潜在作用靶点共10个,分别为CASP3、KDR、PTGS1、TNF、MMP9、PRKCE、PTGS2、MYC、TP53,各自在大脑星形胶质细胞、小胶质细胞、内皮细胞等中有不同程度的表达,涉及KEGG相关富集通路12条、GO生物过程富集条目14条、GO细胞组分富集条目3条、GO细胞功能富集条目2条。分子对接结果发现与CASP3、KDR、PTGS1、TNF、MMP9结合较好。结论:大黄素可能主要通过CASP3、KDR、PTGS1、TNF、MMP9作用于细胞凋亡通路及炎症反应相关等通路来发挥治疗脑缺血中风的作用。

交泰丸治疗失眠与口疮的网络药理学机制研究

目的:运用网络药理学技术探讨交泰丸治疗失眠与口疮的作用机制。方法:第一步,检索TCMSP等药物数据库获取黄连和肉桂的有效成分和靶点,两者靶点取并集,就是交泰丸总的作用靶点。第二步,检索OMIM等疾病数据库获取口疮与失眠的基因靶点,两者取交集,就是引起上述疾病发生的共有靶点,最后把方剂总的靶点与两种疾病共有靶点进行关联,就得到交泰丸治疗两种疾病的关键位点。第三步,使用Cytoscape软件构建方剂-成分-靶点-疾病网络,第四步,把得到的关键靶点提交至String平台,构建蛋白相互作用网络(PPI),然后应用分子复杂检测(MCODE)算法进行模块分析,cytohubbe插件进行核心靶点筛选,并把核心靶点录入DisGeNET数据库中,评估基因与疾病的关联度,最后使用Metascape工具对关键靶点进行生物富集与通路分析,并构筑靶点通路图。结果:得到交泰丸19个有效成分456个药物靶点。口疮4124个基因靶点;失眠2622个基因靶点,两种疾病共有基因位点813个,交泰丸治疗口疮的靶点有294个,治疗失眠的靶点有159个,294个靶点与159个靶点取交集得到108个关键靶点。合并简化得到129个节点,386条边的网络图。把108个关键靶点提交至String平台绘制PPI网络,共涉及107个节点,848条边,MCODE分析出6大模块,遴选出10个核心靶点。靶点通路图共涉及103个节点,367条边。结论:通过检索化合物来源数据库,发现方剂成分可以抑制神经突触兴奋,减少不良刺激,改善睡眠,提高机体免疫力,维持内环境稳态,限制炎性损伤,从而修复黏膜。根据生物富集分析结果发现,靶点分子功能主要和神经内分泌递质有关;细胞成分主要和突触膜有关;生物过程主要和免疫炎症与体内激素有关,Kegg通路分析发现,cAMP、HIF-1和Ca2+信号,糖尿病并发症中的AGE-RAGE通路影响着疾病的转归。根据中医异病同治的理论和网络药理学研究显示,该方紧扣病机,直达病所,是治疗心肾不交证型的经典方剂。