KIF2C在肝细胞癌中的作用及ceRNA调控网络构建

目的:分析驱动蛋白家族成员2C(KIF2C)在肝细胞癌(HCC)中的表达及意义;探索竞争内源性RNA(ceRNA)网络在HCC发展中的潜在作用。方法:利用肿瘤芯片数据库(Oncomine)、肿瘤基因组图谱(TCGA)和基因表达谱交互分析(GEPIA)数据库分析KIF2C在HCC中的表达,及其与HCC的总生存期(OS)、无病生存期(DFS)及病理分级等临床参数的关系;通过RT-qPCR实验分析KIF2C在HCC组织和配对的癌旁组织中的表达;通过细胞功能实验分析干预KIF2C表达对HCC细胞增殖、侵袭与迁移的影响;利用STRING和GeneMANIA数据库探索与KIF2C互作的蛋白和基因;使用高通量测序,寻找log2|FC|>1条件下的差异基因,并进行GO与KEGG富集分析,探索KIF2C潜在的作用通路;通过共表达分析,筛选互作的RNA后构建ceRNA调控网络。结果:KIF2C在HCC中显著高表达(P<0.001);KIF2C表达水平影响HCC患者的生存预后及病理分级(P<0.05);细胞功能实验表明KIF2C过表达促进HCC细胞的增殖、侵袭与迁移(P<0.05);有10个蛋白参与KIF2C的蛋白互作;共有20个基因参与KIF2C的基因互作;筛选出3754个长非编码RNA、7621个差异表达信使RNA和170个差异表达微小RNA;GO与KEGG富集分析显示,相关差异基因参与细胞外囊泡、质膜固有成分等功能,且显著富集于p53信号通路、PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路;最后,12个lncRNA和5个miRNA构成了一个ceRNA网络,其中has-miR-181b-5p是关键的miRNA。结论:KIF2C在HCC中显著高表达且提示预后不良,KIF2C过表达促进HCC细胞的增殖、侵袭和迁移活动;获得与KIF2C相关的ceRNA调控网络,其在HCC中发挥重要作用。

CDC14b在乳腺癌组织中的表达水平和临床预后价值研究

目的:探讨细胞分裂周期蛋白14b(cell division cycle protein 14b,CDC14b)在乳腺癌(breast cancer,BC)中的潜在作用及分子机制。方法:利用基因表达综合数据库(gene expression omnibus,GEO)和肿瘤基因组图谱(cancer genome atlas,TCGA)提供的微阵列芯片和m RNA测序数据,验证CDC14b的表达水平,确定CDC14b在BC中的诊断价值和预后作用。筛选CDC14b共表达基因(由Spearman相关性确定),通过基因肿瘤学(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路分析,探讨CDC14b在BC中的潜在分子机制。结果:CDC14b mRNA在TCGA中1 085例BC的CDC14b mRNA表达水平较291例非BC显著降低(P<0.05),合并微阵列芯片数据分析CDC14b低表达对BC患者的总生存期(OS)(P=0.001)和无病生存期(DFS)(P<0.001)预后有意义。研究共纳入19组GEO微阵列芯片,其中13组提示CDC14b的m RNA水平在BC组织中下调,荟萃分析显示CDC14b在BC中显著下调(均数化标准差=-1.420),集成受试者工作特征曲线下面积(AUC)为0.930,敏感度为0.900,特异度为0.820,未见明显发表偏倚。经Spearman相关性分析,共获得127个CDC14b共表达基因,均集中在蛋白激酶Hippo信号通路、癌症相关胆碱代谢、粘着斑和磷脂酶D信号通路上。结论:CDC14b表达下调可能是评估BC患者不良预后因素,可能通过激活蛋白激酶Hippo信号通路等促进BC的发生发展。

超声引导肝癌裸鼠异位种植瘤不完全消融模型的建立

目的建立良好的肝癌裸鼠异位种植瘤不完全消融模型,探索残余癌分子景观的改变。方法将8只免疫缺陷BALB/c裸鼠以MHCC97-H肝癌细胞系建立异位种植瘤模型,简单随机分为实验组和对照组,每组4只。实验组进行模拟临床肝癌不完全消融,对照组仅进行假消融。通过超声诊断仪、热成像相机、大体病理、HE染色、高通量全转录组测序评估模型间的差异性改变。结果肝癌裸鼠异位种植瘤全部获得成功。实验组热成像相机监测针尖周围肿瘤温度位于50~73.9℃。与对照组相比,实验组HE染色大多显示为坏死区域-变性区域-肿瘤细胞区域共存的现象,坏死区域为(23.75±13.77)%,变性区域为50%(30%)。高通量全转录组测序显示体内外不完全消融模拟模型中存在数百个交集稳定分子景观。结论通过成功建立肝癌不完全消融残余癌的裸鼠异位种植模型,可为分子层面上研究不完全消融残余癌的生物学特性提供条件。