利用Python编程提取基因组基因序列

当前分子细胞类中小型实验室缺乏生物信息或编程背景研究员,无法对基因组进行大数据挖掘。本文从生物信息学角度将Python编程应用于生命科学领域,利用循环遍历算法,和Python特有的字典数据格式开发批量挖掘基因组上基因序列和CDS序列的代码。为生命科学研究提供便利。最后将该代码实际应用于挖掘人类线粒体基因组上的全部基因序列和CDS序列,并成功输出结果。

门诊皮肤科痤疮疾病用药分析

分析及评价医院痤疮疾病用药的规律及合理性,为临床痤疮疾病药物治疗提供参考。方法:收集我院门诊2020年3月~2020年9月治疗痤疮处方,对患者及其用药的基本情况进行分析,并采用DDDs值、DDD及DUI进行评价主要药物的用药合理性及其用药的趋势分析。结果:本次处方分析数据中得出青春期(18~28岁)的就诊人数最多,且女性患者高于男性患者。各痤疮药品中药物利用指数(DUI)均小于1.0。结论:分析痤疮用药中,夏季的痤疮发病率的高峰期,其中乳膏剂所占比例较大,对治疗痤疮效果明显。本院痤疮用药基本合理,无药物滥用倾向。

Perl语言统计核酸GC含量程序开发

生命科学领域中无论是PCR还是测序,都需要了解目的核酸的GC含量。由于目前缺乏独立统计核酸GC含量的程序。该文采用Perl语言编程,设计处理了核酸序列统计GC含量的程序。程序采用了BioPerl环境,利用字符串拆分、遍历算法和正则表达式对核酸序列进行GC碱基的挖掘。最后该脚本可以应用于Windows和Linux系统。适合用于多环境。