利用微卫星标记分析海南地区马群体的遗传多样性和群体结构

本研究以海南地区的马群体为主要研究对象,利用12个品种共计456匹马(包含52匹海南地区马)的微卫星DNA位点(12个ISAG推荐的微卫星位点)数据研究海南地区马群体的遗传多样性和群体遗传结构。研究结果显示,海南地区马群体的12个微卫星DNA位点共检测到99个等位基因,其中大多数位点处于哈代-温伯格平衡和连锁平衡状态,有效等位基因(Ne)为1.248~8.282,Shannon指数(I)均值为1.636,观测杂合度(Ho)均值为0.840、期望杂合度(He)均值为0.727、多态信息含量(PIC)均值为0.698,表明目前海南地区马群体遗传多样性水平较高(PIC>0.5);NJ系统发育树、STRUCTURE贝叶斯聚类分析和FCA因子分析结果显示海南地区马群体与阿哈捷金马、阿拉伯马和温血马之间的遗传关系较近,说明该马群主要来源于这些马品种;群体遗传分化分析结果显示海南地区马群体与其他马群之间的遗传分化系数(Fst)为0.041~0.103,均值为0.094,属于中等遗传分化水平(0.05<Fst<0.15)。本研究认为海南地区的马群体具有较高的遗传多样性,且主要来源于阿哈捷金马、阿拉伯马和温血马等国外优质马种。本研究结果可为海南地区马遗传资源的价值评估、开发与利用提供参考。

利用微卫星分析康西草原马匹种群的遗传多样性和群体结构

旨在揭示康西草原马匹的品种来源以及群体遗传结构。本研究采集了当地60匹健康状况良好、体重适中、3~6岁之间不区分公母马的血液样品,试验分为6个种群并以纯血马等4个国外马品种、1个我国地方马品种作为对照,通过设计引物并提取基因组DNA结合微卫星扩增法对染色体上12个微卫星位点的等位基因进行检测,并对各种群遗传多样性参数、群体分化指数、瓶颈效应以及群体结构进行分析。试验按照群体个数为依据分为6组,每组1个重复,每个重复以该组样本量为标准。分析6个种群马的遗传参数结果表明,其中共检测到221个等位基因,平均Shannon指数为1.691;有效等位基因数(Ne)为3.649~5.397;期望杂合度(He)为0.681~0.798;观测杂合度(Ho)为0.632~0.780;平均多态信息含量(PIC)为0.643~0.772。这些结果表明,6个群体都具有很高的遗传多样性。通过微卫星DNA位点的连锁不平衡及哈迪-温伯格平衡分析发现,大多数位点的P值都大于校正值(P=0.0065),表示较多位点都处于哈迪-温伯格及连锁平衡状态。各群体间群体分化系数(Fst)表明,群体间分化程度较低(Fst<0.15)。基于Nei’s遗传距离与地理距离之间Mantel相关性检验显示二者之间呈现正相关性(R=0.502),但未达到显著水平(P=0.310);各马匹种群瓶颈效应分析表明,P值极显著(P(IAM)<0.01)说明该地区的马群体受到过瓶颈效应的影响且该马群体历史上数量有大规模的减少。通过FCA因子分析、基于Nei’s标准遗传距离UPGMA树状图以及Structure贝叶斯聚类分析发现,该地区马种群与纯血马和温血马聚为一类,说明该种群最有可能主要来源于温血马和纯血马。这些结果揭示,康西草原地区马匹具有较高的遗传多样性,该地马群体的血统与纯血马和温血马相近,这为当地马遗传资源评估以及开发利用打下了坚实的基础。

应激温度对蛋鸡生产性能的影响

为了研究应激温度对蛋鸡生产性能的影响,证明适温条件对蛋鸡生产性能的重要性,试验选取了健康的25周龄芦花蛋鸡240只,随机分成3组(低温试验1组、适温试验2组、高温试验3组),每组80只,试验期为第25~35周龄,试验1组蛋鸡在温度-2~4℃下饲养,试验2组蛋鸡在温度15~21℃下饲养,试验3组蛋鸡在温度28~34℃下饲养,分别计算3组蛋鸡的平均产蛋率、平均日采食量以及料蛋比。结果表明,温度15~21℃下试验2组蛋鸡的平均产蛋率最高,温度-2~4℃下试验1组蛋鸡的平均日采食量最多,温度-2~4℃下试验1组蛋鸡的料蛋比最大。综合分析,在适温(15~21℃)下蛋鸡的产蛋性能最好。此结果说明,适宜温度对产蛋鸡生产性能的重要性,在适宜温度条件下能够降低产蛋鸡对于饲料的消耗、提高产蛋率、降低料蛋比,对于饲养蛋鸡过程中增产增效、节约成本具有重要的意义。

北京市延庆区马匹毛色、运动及性情性状相关基因的分型研究

为有效开发利用北京市延庆区马遗传资源,促进旅游业的发展,育成性能优良的骑乘马品种,试验以北京市延庆区60匹马为研究对象,采用DNA测序和聚合酶链式反应-限制性片段长度多态性(P CR-RFLP)法对毛色性状基因MC1R、ASIP、KIT,运动性状基因DMRT3以及性情性状基因SLC6A4,进行基因分型,并对各基因群体遗传参数[等位基因频率、基因型频率及各基因突变位点的期望杂合度(expected heterozygosity,He)、观测杂合度(observed heterozygosity,Ho)、多态信息含量(p olymorphism information content,PIC)及哈迪-温伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE]进行统计分析。结果表明:北京市延庆区马匹MC1R基因的外显子1第248位碱基存在突变(C→T),为错义突变,共有EE、Ee和ee三种基因型;ASIP基因的外显子2第192位碱基存在11 bp的缺失突变,共有AA和aa两种基因型;KIT基因的外显子14第122位存在突变(G→A),为沉默突变,共有GG和gg两种基因型;DMRT3基因外显子1第301位碱基存在突变(C→A),为无义突变,共有TT、Tt和tt三种基因型;SLC6A4基因外显子14第45位存在突变(T→C),为沉默突变,共有CC、Cc和cc三种基因型。MC1R基因的优势等位基因为E,优势基因型为Ee(非栗毛色);ASIP基因的优势等位基因为A,优势基因型为AA(非黑毛色);KIT基因的优势等位基因为g,优势基因型为gg(非花毛色);DM-RT3基因的优势等位基因为T,优势基因型为TT(非对侧步);SLC6A4基因的优势基因为C,优势基因型为CC(上悍威)。MC1R、KIT和DMRT3基因突变位点在群体中均处于哈迪-温伯格平衡状态(P>0.05),而ASIP和SLC6A4基因突变位点在群体中偏离哈迪-温伯格平衡状态(P<0.05),其中MC1R基因突变位点的Ho和He较高,其他基因突变位点的Ho和He较低;MC1R和ASIP基因突变位点属于中等多态性水平(0.25<PIC<0.5),KIT、DMRT3及SLC6A4基因突变位点属于低等多态性水平(PIC<0.25)。说明延庆区马匹毛色丰富,上悍威类型的马匹占多数,但对侧步表型的马匹数量较少。

基于全基因组重测序的岔口驿马分子遗传特性研究

本研究以岔口驿马为主要研究对象,分析了其群体结构以及其与百色马、哈萨克马品种的遗传关系和受选择位点。实验采用PCA分析、系统发育树分析、ADMIXTURE分析以探明群体遗传结构和品种间的遗传关系;采用群体遗传分化指数(Fst)、核苷酸多样性(θπ)和XP-EHH 3种方法检测岔口驿马受选择位点,提取相应的基因进行富集分析。研究结果表明,在这3个马品种中,岔口驿马与哈萨克马的遗传关系更近;使用3种分析方法所筛选到的岔口驿马与百色马的候选基因有110个,岔口驿马与哈萨克马的候选基因有25个;GO和KEGG富集分析结果显示,岔口驿马与百色马的差异基因主要富集在骨骼发育通路,而岔口驿马与哈萨克马的差异基因主要富集在神经发育相关通路。本研究初步揭示了岔口驿马的遗传特性,并为岔口驿马保种选育工作提供了参考依据。