TRAF1/C5和TNF-α基因多态性与结核病易感性分析

目的分析肿瘤坏死因子受体相关蛋白1(tumor necrosis factor receptor-associated factor 1,TRAF1)/补体5(complement component 5,C5)rs10818488和肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-alpha,TNF-α)rs1800629基因多态性、环境因素及其交互作用对结核病(tuberculosis,TB)易感性的影响。方法选取TB多发家庭中TB确诊患者作为TB病例组,当地社区同期体检的健康志愿者作为健康对照(healthy controls,HC)组,与TB组有血缘关系且共同居住者组成家庭密切接触(healthy household contacts,HHC)组。采用logistic回归分析模型分析基因型和环境因素与TB的关联,叉生分析结合logistic回归分析模型分析基因与环境交互作用。结果年龄>45岁(χ^(2)=7.90,OR=2.28,95%CI:1.28~4.04,P=0.005)、吸烟(χ^(2)=15.27,OR=4.70,95%CI:2.16~10.22,P<0.001)增加HHC组TB发病风险。吸烟(χ^(2)=13.94,OR=3.58,95%CI:1.83~7.01,P<0.001)、居住地为农村(χ^(2)=25.05,OR=3.81,95%CI:2.26~6.42,P<0.001)和居室环境卫生较差(χ^(2)=15.31,OR=3.20,95%CI:1.79~5.73,P<0.001)增加HC组TB发病风险。TRAF1/C5 rs10818488位点中,携带AG基因型(共显性及超显性模型)、GG基因型(共显性模型)和AG-GG基因型(显性模型)增加HHC组和HC组患TB风险。TNF-αrs1800629位点与TB易感性暂未显示存在关联。分析基因与环境交互作用,在TB组和HHC组间,TRAF1/C5 rs10818488位点AG-GG基因型与吸烟存在协同作用;而在TB组和HC组间,rs10818488位点AG-GG基因型与吸烟和居室环境卫生较差存在协同作用,与居住地存在相乘交互作用,均使TB发病风险提高。结论TRAF1/C5 rs10818488位点的基因多态性可能与TB发病风险有关,且其与吸烟、居住地、居室环境卫生存在交互作用,共同影响TB的易感性。

P2X7和TAP2基因多态性与结核病易感关联性的家庭病例对照研究

目的分析P2X7 rs2230911和TAP2 rs3819721位点基因多态性和基因与环境之间的交互作用对结核病(tuberculosis,TB)易感性的影响。方法本研究采用以家庭为单位的病例对照研究,选取2017年1月—2021年1月广东省多个结核病防治单位收集的结核病多发家庭中结核病确诊患者作为病例(TB)组,与病例组有血缘关系且未患病者组成家庭密切接触者(healthy household contacts,HHC)组,选取当地健康居民家庭为健康对照(healthy controls,HC)组。Logistic回归分析一般人口学特征、行为和环境因素与结核病的关联,广义多因子降维法(generalized multifactor dimensionality reduction,GMDR)分析基因-环境交互作用对结核病患病的影响。结果P2X7 rs2230911位点的CG基因型(OR共显性=1.84,95%CI:1.04~3.26)、CG-GG基因型(OR显性=1.94,95%CI:1.02~3.69)和TAP2 rs3819721位点的AG基因型(OR共显性=3.34,95%CI:1.71~6.54;OR超显性=3.43,95%CI:1.73~6.80)、AA基因型(OR共显性=4.64,95%CI:1.18~18.28)、AG-AA基因型(OR显性=4.26,95%CI:2.16~8.41)均会增加健康对照人群患结核病的风险。而TAP2 rs3819721位点的AG基因型(OR共显性=1.93,95%CI:1.05~3.53)、AG-AA基因型(OR显性=1.95,95%CI:1.09~3.50)均会增加家庭密切接触者患结核病的风险。GMDR分析基因-环境交互作用显示,在TB组和HHC组间,吸烟、每周锻炼、TAP2 rs3819721间存在交互作用(P<0.05,TA=0.689,CVC=10/10)。而在TB组和HC组间,九因子作用模型(人均住房面积、居住地、体质量指数、文化程度、吸烟、每周锻炼、室内环境卫生、P2X7 rs2230911、TAP2rs3819721)是最佳模型(P<0.05,TA=0.767,CVC=10/10)。结论P2X7 rs2230911位点和TAP2rs3819721位点的基因多态性及其与环境因素之间的交互作用在结核病的发病机制中可能发挥重要作用。

TAP2基因多态性与肺结核易感性的病例对照家系研究

目的 肺结核(pulmonary tuberculosis,PTB)感染具有个体差异性,研究抗原处理相关转运蛋白2(transporter-associated with antigen processing 2,TAP2)基因多态性对PTB发病的影响,并分析TAP2基因与人口学特征、行为因素、环境因素在PTB发病中的交互作用。方法 使用病例对照家系研究方法,将广东省多个结核防治单位收集的PTB多发家系中确诊患者作为病例组(PTB组),PTB多发家系中未患病者作为健康家庭密切接触者(healthy household contacts,HHC)组,当地同期收集的健康家系的家庭成员作为健康对照(healthy controls,HC)组。logistic回归分析模型分析各影响因素与PTB的关联,决策树(classification and regression tree,CART)模型分析发病危险因素间交互作用。结果 logistic回归分析模型分析结果显示,对于HHC组,年龄、男性、吸烟和缺乏健身活动是PTB发病危险因素;对于HC组,城镇户口、BMI>18.5kg/m^(2)和室内干燥是发病保护因素,男性、吸烟、缺乏健身活动和室内环境卫生较差是PTB发病危险因素。PTB组与HHC组、HC组比较均发现rs3819721与PTB易感性相关。PTB组与HHC组的CART模型分析结果显示,不吸烟与有健身活动共存可降低PTB发病风险。PTB组与HC组模型分析结果显示,缺乏健身活动且携带rs3819721 AG+AA基因型的人群PTB患病风险更高。结论 TAP2 rs3819721位点基因多态性与PTB发病相关,且其与缺乏健身活动在PTB发病中存在交互作用。暂未发现rs241447位点基因多态性与PTB发病有关。