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生物序列拼装欧拉路径算法的Gamma描述及其并行化研究
被引量:
1
1
作者
廖文昭
童维勤
蔡立志
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2004年第4期707-711,共5页
序列拼装是生物基因测序的一个重要环节 ,也是生物信息学重要的研究内容 .〔2〕中将 Eulerian路径的方法应用于序列拼接 ,较好地解决传统序列拼装软件中存在的 repeat问题 ,从而提高序列拼装的精度 .但对于该方法的研究目前还只有串行...
序列拼装是生物基因测序的一个重要环节 ,也是生物信息学重要的研究内容 .〔2〕中将 Eulerian路径的方法应用于序列拼接 ,较好地解决传统序列拼装软件中存在的 repeat问题 ,从而提高序列拼装的精度 .但对于该方法的研究目前还只有串行化的实现 ,拼装速度不够理想 .在本文中 ,我们采用了并行化 Gamma模型形式化地描述了用于序列拼装的 Eulerian方法 ,并给出了
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关键词
序列拼装
Gamma模型
并行化
欧拉路径
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职称材料
面向互联网应用的云操作系统的架构设计
被引量:
2
2
作者
支小莉
廖文昭
+1 位作者
蔡立志
童维勤
《上海大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期44-48,共5页
云计算的核心理念是按需提供IT服务,这对基础设施提供商带来巨大的影响.介绍以中小企业为主要服务群体的云操作系统INACloud的架构设计,并且综合考虑实际运维问题、自主创新和开源软件等因素以及面向互联网应用动态多变的资源需求,重点...
云计算的核心理念是按需提供IT服务,这对基础设施提供商带来巨大的影响.介绍以中小企业为主要服务群体的云操作系统INACloud的架构设计,并且综合考虑实际运维问题、自主创新和开源软件等因素以及面向互联网应用动态多变的资源需求,重点探讨调度策略、监控设计和计费管理等方面.
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关键词
云操作系统
架构
二次开发
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职称材料
序列拼装程序的并行化研究与实现
3
作者
蔡立志
童维勤
廖文昭
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2003年第14期105-107,共3页
基因序列拼装是分子生物研究的重要环节之一。随着DNA序列的快速增长,如何提高基因序列拼装的速度,成为当前基因组研究的重要问题。为充分利用SMP以及集群的资源,在找出Phrap程序的瓶颈后,分别在SUNEnterprise3500及集群上将串行的Phra...
基因序列拼装是分子生物研究的重要环节之一。随着DNA序列的快速增长,如何提高基因序列拼装的速度,成为当前基因组研究的重要问题。为充分利用SMP以及集群的资源,在找出Phrap程序的瓶颈后,分别在SUNEnterprise3500及集群上将串行的Phrap程序进行了并行化。论文论述实现并行拼接程序的机理和性能。
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关键词
并行化
序列拼装
消息传递
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职称材料
基于ZigBee技术的儿童追踪器的设计与实现
4
作者
刘如冰
鲁久玲
+2 位作者
王莉
廖文昭
吴望龙
《电脑知识与技术》
2021年第13期231-234,共4页
ZigBee技术是一种用于无线设备之间的,借助无线通信协议来实现短距离无线数据的接收和发送的通信方式。随着我国人民的生活水平逐步提高,社会越来越关注和重视有关儿童安全的问题。本文设计了一种基于ZigBee技术的儿童追踪器,它采用GPS...
ZigBee技术是一种用于无线设备之间的,借助无线通信协议来实现短距离无线数据的接收和发送的通信方式。随着我国人民的生活水平逐步提高,社会越来越关注和重视有关儿童安全的问题。本文设计了一种基于ZigBee技术的儿童追踪器,它采用GPS定位技术和ZigBee无线通信技术,以达到在PC机上对儿童定位实时追踪的功能。在本系统的数据采集节点中,ZigBee终端拓展的定位模块用于对儿童所在位置进行定位数据的采集,并借助传输节点发送定位信息到PC端的上位机进行实时显示。与传统的系统相比,该系统具有低功耗、电路简单等特点。
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关键词
儿童追踪器
ZIGBEE
定位
低功耗
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职称材料
题名
生物序列拼装欧拉路径算法的Gamma描述及其并行化研究
被引量:
1
1
作者
廖文昭
童维勤
蔡立志
机构
上海大学计算机学院
出处
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2004年第4期707-711,共5页
文摘
序列拼装是生物基因测序的一个重要环节 ,也是生物信息学重要的研究内容 .〔2〕中将 Eulerian路径的方法应用于序列拼接 ,较好地解决传统序列拼装软件中存在的 repeat问题 ,从而提高序列拼装的精度 .但对于该方法的研究目前还只有串行化的实现 ,拼装速度不够理想 .在本文中 ,我们采用了并行化 Gamma模型形式化地描述了用于序列拼装的 Eulerian方法 ,并给出了
关键词
序列拼装
Gamma模型
并行化
欧拉路径
Keywords
sequences assembly
gamma model
parallelization
eulerian path
分类号
TP301 [自动化与计算机技术—计算机系统结构]
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职称材料
题名
面向互联网应用的云操作系统的架构设计
被引量:
2
2
作者
支小莉
廖文昭
蔡立志
童维勤
机构
上海大学 计算机工程与科学学院
中国电信股份有限公司上海信息网络部
上海市计算机软件评测实验室
上海大学计算机工程与科学学院
出处
《上海大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期44-48,共5页
基金
上海市科技创新行动计划资助项目(11511500200)
文摘
云计算的核心理念是按需提供IT服务,这对基础设施提供商带来巨大的影响.介绍以中小企业为主要服务群体的云操作系统INACloud的架构设计,并且综合考虑实际运维问题、自主创新和开源软件等因素以及面向互联网应用动态多变的资源需求,重点探讨调度策略、监控设计和计费管理等方面.
关键词
云操作系统
架构
二次开发
Keywords
cloud operating system
architecture
second development
分类号
TP3 [自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
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职称材料
题名
序列拼装程序的并行化研究与实现
3
作者
蔡立志
童维勤
廖文昭
机构
上海大学计算机学院
出处
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2003年第14期105-107,共3页
基金
上海市教委曙光计划资助(编号:2000SG40)项目
文摘
基因序列拼装是分子生物研究的重要环节之一。随着DNA序列的快速增长,如何提高基因序列拼装的速度,成为当前基因组研究的重要问题。为充分利用SMP以及集群的资源,在找出Phrap程序的瓶颈后,分别在SUNEnterprise3500及集群上将串行的Phrap程序进行了并行化。论文论述实现并行拼接程序的机理和性能。
关键词
并行化
序列拼装
消息传递
Keywords
paralleli zation,sequences assembly,message passing
分类号
TP311 [自动化与计算机技术—计算机软件与理论]
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职称材料
题名
基于ZigBee技术的儿童追踪器的设计与实现
4
作者
刘如冰
鲁久玲
王莉
廖文昭
吴望龙
机构
湖南工商大学计算机与信息工程学院
出处
《电脑知识与技术》
2021年第13期231-234,共4页
基金
2019年湖南省大学生创新创业训练计划项目(S201910554018)。
文摘
ZigBee技术是一种用于无线设备之间的,借助无线通信协议来实现短距离无线数据的接收和发送的通信方式。随着我国人民的生活水平逐步提高,社会越来越关注和重视有关儿童安全的问题。本文设计了一种基于ZigBee技术的儿童追踪器,它采用GPS定位技术和ZigBee无线通信技术,以达到在PC机上对儿童定位实时追踪的功能。在本系统的数据采集节点中,ZigBee终端拓展的定位模块用于对儿童所在位置进行定位数据的采集,并借助传输节点发送定位信息到PC端的上位机进行实时显示。与传统的系统相比,该系统具有低功耗、电路简单等特点。
关键词
儿童追踪器
ZIGBEE
定位
低功耗
分类号
TN919 [电子电信—通信与信息系统]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
生物序列拼装欧拉路径算法的Gamma描述及其并行化研究
廖文昭
童维勤
蔡立志
《小型微型计算机系统》
CSCD
北大核心
2004
1
下载PDF
职称材料
2
面向互联网应用的云操作系统的架构设计
支小莉
廖文昭
蔡立志
童维勤
《上海大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2013
2
下载PDF
职称材料
3
序列拼装程序的并行化研究与实现
蔡立志
童维勤
廖文昭
《计算机工程与应用》
CSCD
北大核心
2003
0
下载PDF
职称材料
4
基于ZigBee技术的儿童追踪器的设计与实现
刘如冰
鲁久玲
王莉
廖文昭
吴望龙
《电脑知识与技术》
2021
0
下载PDF
职称材料
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