目的运用网络药理学研究桃红四物汤治疗骨质疏松(OP)的作用机制。方法运用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)获取桃红四物汤的化合物及靶标,经筛选后输入Uniprot获取对应基因Symbol;从人类基因数据库(Gene Card:The Human Gene Dat...目的运用网络药理学研究桃红四物汤治疗骨质疏松(OP)的作用机制。方法运用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)获取桃红四物汤的化合物及靶标,经筛选后输入Uniprot获取对应基因Symbol;从人类基因数据库(Gene Card:The Human Gene Database)获取OP的疾病基因,并筛选出交集基因;运用STRING构建蛋白质互作用网络(PPI)、g:Profiler数据分析平台进行基因本体(GO)富集及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用Cytoscape3.7.1软件绘制“中药-活性成分-靶标-通路”网络图,并进行网络拓扑学分析以确定核心基因。结果经筛选得到桃红四物汤活性成分46种,靶标基因216个,与疾病基因对照去重后获得交集基因137个,GO富集分析后共获得符合筛选标准的条目660条,KEGG富集分析共获得99条。结论豆甾醇、β-谷甾醇为桃红四物汤主要活性成分,治疗的核心靶点包括丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT)1、JUN等,涉及酶结合、转录基因调节等多个生物过程,调控丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)-AKT等信号通路。展开更多
文摘目的运用网络药理学研究桃红四物汤治疗骨质疏松(OP)的作用机制。方法运用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)获取桃红四物汤的化合物及靶标,经筛选后输入Uniprot获取对应基因Symbol;从人类基因数据库(Gene Card:The Human Gene Database)获取OP的疾病基因,并筛选出交集基因;运用STRING构建蛋白质互作用网络(PPI)、g:Profiler数据分析平台进行基因本体(GO)富集及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用Cytoscape3.7.1软件绘制“中药-活性成分-靶标-通路”网络图,并进行网络拓扑学分析以确定核心基因。结果经筛选得到桃红四物汤活性成分46种,靶标基因216个,与疾病基因对照去重后获得交集基因137个,GO富集分析后共获得符合筛选标准的条目660条,KEGG富集分析共获得99条。结论豆甾醇、β-谷甾醇为桃红四物汤主要活性成分,治疗的核心靶点包括丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶(AKT)1、JUN等,涉及酶结合、转录基因调节等多个生物过程,调控丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、磷脂酰肌醇-3-激酶(PI3K)-AKT等信号通路。