目的:基于网络药理学方法探究参蛭通心胶囊核心药对人参-水蛭治疗扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy,DCM)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and an...目的:基于网络药理学方法探究参蛭通心胶囊核心药对人参-水蛭治疗扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy,DCM)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、BATMAN-TCM数据库获取人参-水蛭药对的活性成分及潜在靶点并导入UniProt数据库对所得基因进行标准化处理;运用人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)获取DCM已知靶点;通过绘制韦恩图得到药物与疾病的交集靶点,将药物活性成分及药物-疾病共同靶点等数据导入Cytoscape 3.7.2软件,构建药物-成分-疾病-靶点网络;运用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interactions,PPI)并筛选出核心靶点;将核心靶基因导入基因功能注释数据库(the database for annotation visualization and integrated discovery,DAVID)平台对所得交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,同时利用OmicShare进行数据的可视化分析。结果:经筛选共获得人参-水蛭药对有效成分35个,药物-疾病交集靶点184个,涉及的核心靶点主要有胰岛素、白蛋白、肿瘤坏死因子、内皮一氧化氮合成酶、过氧化物酶体增殖物激活受体、白细胞介素1β等。人参-水蛭的有效成分通过对细胞膜、细胞外间隙、电压门控钙通道复合体等部位的作用、一氧化氮生物合成过程的正调控、细胞间信号传递、对凋亡过程的负调控等过程和CAMP信号通路等在内的多个信号通路协同作用治疗DCM。结论:参蛭通心胶囊的核心药对人参-水蛭可以通过参与调控多成分、多靶点、多通路治疗DCM。展开更多
目的:利用网络药理学方法探讨人参四物汤治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)网络数据库对人参四物汤的有效成分及作用靶点进行挖掘和筛选,利用Uniprot蛋白质数据库...目的:利用网络药理学方法探讨人参四物汤治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)网络数据库对人参四物汤的有效成分及作用靶点进行挖掘和筛选,利用Uniprot蛋白质数据库寻找蛋白质靶点所对应的人类基因,同时以“coronary heart disease”为关键词挖掘Gene Cards、TTD、DRUGBANK数据库中冠心病相关作用靶点,利用微生信在线数据分析作图网站制作韦恩图,并将所得交集靶点导入Cytoscape 3.7.2,构建“药物-有效成分-靶点-疾病”网络。基于STRING数据库,构建蛋白质-蛋白质相互作用网络模型;再利用Bisogenet进行拓扑分析,筛选出关键靶点;最后利用Metascape数据库对药物-疾病交集靶点进行生物功能和通路的富集分析。结果:人参四物汤治疗冠心病的核心活性成分为山柰酚、豆甾醇、β-谷甾醇等。核心靶点为核磷脂素1(NPM1)、异质性胞核核糖核蛋白U(HNRNPU)、热休克蛋白A5[Heat Shock Protein Family A(Hsp70)Member 5,HSPA5]、热休克蛋白A8[Heat Shock Protein Family A(Hsp70)Member 8,HSPA8]、人真核翻译延伸因子1a1(EEF1A1)、异质性胞核核糖核蛋白P2(FUS)、核糖体蛋白S27A(RPS27A)、反式激活应答DNA结合蛋白(TARDBP)等。关键通路为脂质与动脉粥样硬化、血流剪切力与动脉粥样硬化、白细胞介素-17(Interleukin-17,IL-17)信号通路等。结论:人参四物汤通过多成分、多靶点、多通路治疗冠心病,为临床冠心病的治疗提供了新的思路。展开更多
文摘动脉粥样硬化(atherosclerosis, AS)是脂质沉积于血管壁导致的慢性炎症性疾病,是冠心病、高血压病、心力衰竭等心脑血管疾病的病理基础,动脉粥样硬化斑块的稳定或破裂是心血管事件发生与否的重要影响因素。细胞焦亡是一种促炎性质的程序性细胞死亡,过度的细胞焦亡可引起细胞裂解死亡并发级联炎症反应。越来越多的研究表明细胞焦亡在AS的病理进程中扮演重要角色,NOD样受体蛋白3 (nod-like receptor protein 3,NLRP3)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-1(cysteinyl aspartate specific proteinase-1,Caspase-1)、细胞焦亡执行蛋白(gasdermin D,GSDMD)等细胞焦亡的关键蛋白参与AS血管内皮细胞损伤、内皮功能障碍、平滑肌细胞表型转换、巨噬细胞死亡、泡沫细胞形成等过程,已成为AS新的治疗靶点。中医药是历史悠久的医药学体系,随着研究的深入,中药复方及中药单体活性成分通过调控细胞焦亡干预AS的作用逐步被阐明,且具有多途径,多靶点,不良反应小等独特优势。基于上述研究,阐述细胞焦亡的概念及发生机制,归纳细胞焦亡在AS病程中的作用,并总结中药复方和单味中药有效成分基于细胞焦亡干预AS的研究进展,以期为AS的防治及中药新药的开发提供新的思路。
文摘目的:基于网络药理学方法探究参蛭通心胶囊核心药对人参-水蛭治疗扩张型心肌病(dilated cardiomyopathy,DCM)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)、BATMAN-TCM数据库获取人参-水蛭药对的活性成分及潜在靶点并导入UniProt数据库对所得基因进行标准化处理;运用人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)获取DCM已知靶点;通过绘制韦恩图得到药物与疾病的交集靶点,将药物活性成分及药物-疾病共同靶点等数据导入Cytoscape 3.7.2软件,构建药物-成分-疾病-靶点网络;运用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作网络(protein-protein interactions,PPI)并筛选出核心靶点;将核心靶基因导入基因功能注释数据库(the database for annotation visualization and integrated discovery,DAVID)平台对所得交集靶点进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析,同时利用OmicShare进行数据的可视化分析。结果:经筛选共获得人参-水蛭药对有效成分35个,药物-疾病交集靶点184个,涉及的核心靶点主要有胰岛素、白蛋白、肿瘤坏死因子、内皮一氧化氮合成酶、过氧化物酶体增殖物激活受体、白细胞介素1β等。人参-水蛭的有效成分通过对细胞膜、细胞外间隙、电压门控钙通道复合体等部位的作用、一氧化氮生物合成过程的正调控、细胞间信号传递、对凋亡过程的负调控等过程和CAMP信号通路等在内的多个信号通路协同作用治疗DCM。结论:参蛭通心胶囊的核心药对人参-水蛭可以通过参与调控多成分、多靶点、多通路治疗DCM。
文摘目的:利用网络药理学方法探讨人参四物汤治疗冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)网络数据库对人参四物汤的有效成分及作用靶点进行挖掘和筛选,利用Uniprot蛋白质数据库寻找蛋白质靶点所对应的人类基因,同时以“coronary heart disease”为关键词挖掘Gene Cards、TTD、DRUGBANK数据库中冠心病相关作用靶点,利用微生信在线数据分析作图网站制作韦恩图,并将所得交集靶点导入Cytoscape 3.7.2,构建“药物-有效成分-靶点-疾病”网络。基于STRING数据库,构建蛋白质-蛋白质相互作用网络模型;再利用Bisogenet进行拓扑分析,筛选出关键靶点;最后利用Metascape数据库对药物-疾病交集靶点进行生物功能和通路的富集分析。结果:人参四物汤治疗冠心病的核心活性成分为山柰酚、豆甾醇、β-谷甾醇等。核心靶点为核磷脂素1(NPM1)、异质性胞核核糖核蛋白U(HNRNPU)、热休克蛋白A5[Heat Shock Protein Family A(Hsp70)Member 5,HSPA5]、热休克蛋白A8[Heat Shock Protein Family A(Hsp70)Member 8,HSPA8]、人真核翻译延伸因子1a1(EEF1A1)、异质性胞核核糖核蛋白P2(FUS)、核糖体蛋白S27A(RPS27A)、反式激活应答DNA结合蛋白(TARDBP)等。关键通路为脂质与动脉粥样硬化、血流剪切力与动脉粥样硬化、白细胞介素-17(Interleukin-17,IL-17)信号通路等。结论:人参四物汤通过多成分、多靶点、多通路治疗冠心病,为临床冠心病的治疗提供了新的思路。
