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大黄藤中黄藤素生物合成途径关键酶基因的筛选 被引量:1
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作者 周兴乾 耿应敏 +1 位作者 张体操 郑兰平 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第6期1873-1882,共10页
黄藤素是大黄藤的主要功效成分,是典型的小檗碱类异喹啉类生物碱,具有广泛的抗炎、抗菌活性。本研究运用代谢组学与转录组学研究,筛选了与黄藤素合成显著相关的差异表达基因(DEGs),并对其中8个DEGs进行了实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证... 黄藤素是大黄藤的主要功效成分,是典型的小檗碱类异喹啉类生物碱,具有广泛的抗炎、抗菌活性。本研究运用代谢组学与转录组学研究,筛选了与黄藤素合成显著相关的差异表达基因(DEGs),并对其中8个DEGs进行了实时荧光定量PCR(qRT-PCR)验证。代谢组学研究共检测到106种生物碱,其中包含23种异喹啉类生物碱。黄藤素在根与叶的对比组中位居差异代谢物差异倍数前十位,其在根中的相对含量约是叶中的47.5倍。通过转录组学研究,共188条基因注释到异喹啉类生物碱的生物合成途径上,其中36条基因具有显著差异,根与叶的对比组包含33条DEGs,30条DEGs在黄藤素的生物合成途径上。最后,通过代谢组学与转录组学关联分析,筛选到4条基因序列的表达模式与黄藤素具有显著相关性。qRT-PCR实验结果表明8个DEGs的表达趋势均与转录组结果一致。本研究不仅丰富了大黄藤的组学数据,也为黄藤素的生物合成研究奠定了基础,并进一步为其他异喹啉类生物碱生物合成途径上关键酶基因的解析提供了参考。 展开更多
关键词 大黄藤 多组学 生物合成途径 黄藤素 异喹啉类生物碱
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昆明杯冠藤与青羊参叶绿体基因组特征比较及系统发育分析
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作者 耿应敏 周兴乾 +1 位作者 张体操 郑兰平 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期764-774,共11页
昆明杯冠藤和青羊参隶属于夹竹桃科鹅绒藤属,是重要的药用植物。本研究对昆明杯冠藤和青羊参叶绿体基因组进行测序、组装,并对两者叶绿体基因组的结构特征及其系统发育位置进行了分析。结果表明,昆明杯冠藤和青羊参叶绿体基因组均具有... 昆明杯冠藤和青羊参隶属于夹竹桃科鹅绒藤属,是重要的药用植物。本研究对昆明杯冠藤和青羊参叶绿体基因组进行测序、组装,并对两者叶绿体基因组的结构特征及其系统发育位置进行了分析。结果表明,昆明杯冠藤和青羊参叶绿体基因组均具有典型的四分体结构,注释到133个基因,两者总GC含量接近。密码子偏好性分析显示,昆明杯冠藤和青羊参叶绿体基因组中相对同义密码子使用度略有不同,但差异不大,且在密码子第3位有强烈的A或U偏好。在两者叶绿体基因组中分别检测到91个和103个简单重复序列,以A/T类型重复占比最大。核苷酸多态性分析显示,鹅绒藤属叶绿体基因组共有间区序列的核苷酸多态性值高于共有基因序列,基于共有间区序列的高变区设计了一对引物可对昆明杯冠藤和青羊参进行鉴别。系统发育分析表明,昆明杯冠藤和地梢瓜亲缘关系最近,青羊参、白首乌和隔山消在鹅绒藤属中形成稳定的单系分支,三者亲缘关系较近。对昆明杯冠藤和青羊参叶绿体基因组特征及其系统发育的比较分析将为两种植物的物种鉴定及鹅绒藤属植物的遗传多样性和系统进化研究奠定理论基础。 展开更多
关键词 鹅绒藤属 叶绿体基因组 系统发育 高通量测序 DNA条形码
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青藏高原生物资源开发的现状与前景 被引量:10
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作者 张体操 乔琴 钟扬 《生命科学》 CSCD 2013年第5期446-450,共5页
青藏高原是全世界最高的高原,也是国际生物多样性热点地区之一,生物资源十分丰富,是研究和开发生物资源持续利用的天然实验室。概述了青藏高原生物资源的特点,列举了珍稀濒危的动植物资源及保护现状,探讨了青藏高原生物资源开发的前景,... 青藏高原是全世界最高的高原,也是国际生物多样性热点地区之一,生物资源十分丰富,是研究和开发生物资源持续利用的天然实验室。概述了青藏高原生物资源的特点,列举了珍稀濒危的动植物资源及保护现状,探讨了青藏高原生物资源开发的前景,尤其是高新生物技术在该领域的应用潜力。 展开更多
关键词 青藏高原 生物资源 生物多样性 生物技术
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水平基因转移在生物进化中的作用 被引量:10
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作者 王洽 乐霁培 +2 位作者 张体操 黄锦岭 孙航 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2014年第21期2055-2064,共10页
水平基因转移现象的发现揭示出生物进化的另一条途径,并引发研究人员对生物进化描述方式进行更多的思考和讨论.目前普遍认为,水平基因转移在原核生物和单细胞真核生物中发生较为频繁,并且是二者进化的重要动力,但在多细胞真核生物中,其... 水平基因转移现象的发现揭示出生物进化的另一条途径,并引发研究人员对生物进化描述方式进行更多的思考和讨论.目前普遍认为,水平基因转移在原核生物和单细胞真核生物中发生较为频繁,并且是二者进化的重要动力,但在多细胞真核生物中,其发生范围及进化意义尚存争议.本文列举原核生物、单细胞真核生物以及多细胞真核生物3个重要类群(动物、植物、真菌)中已被报道的部分研究实例,分析水平基因转移在这些类群进化过程中的作用及其产生的影响.此外,还简要地介绍了目前水平基因转移常用的检测手段、可能的发生机制以及其发生的倾向性,并对未来多细胞真核生物水平基因转移事例的发现作出预测. 展开更多
关键词 水平基因转移 生物进化 生命之树 生命之网 动物 植物 真菌
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青藏高原生物多样性与典型物种适应机制
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作者 拉琼 +7 位作者 卢欣 张体操 王忠 德吉 龚燕兵 刘怡萱 曹鹏熙 王俊伟 《中国科技成果》 2023年第16期F0003-F0003,共1页
青藏高原历史上的隆升使其环境发生了剧烈变化,形成独特地形地貌和气候自然条件,使原有生物发生了巨大的遗传变异,形成了丰富的生物多样性,并孕育出了大量适应高寒极端环境的特有物种.这些特有物种在长期的高海拔适应性进化过程中受到... 青藏高原历史上的隆升使其环境发生了剧烈变化,形成独特地形地貌和气候自然条件,使原有生物发生了巨大的遗传变异,形成了丰富的生物多样性,并孕育出了大量适应高寒极端环境的特有物种.这些特有物种在长期的高海拔适应性进化过程中受到了强烈的自然选择,拥有独特的基因及其表达产物,并具有很强的抗逆性和抗胁迫性,是人类尚未充分开发的珍贵生物遗传资源宝库,在我国经济与社会发展中有着巨大的潜力和不可替代的战略地位. 展开更多
关键词 生物遗传资源 特有物种 极端环境 生物多样性 适应性进化 适应机制 自然选择 战略地位
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