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菊叶香藜(Chenopodium foetidum)基因组DNA的提取方法研究 被引量:9
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作者 张勇群 石梦菲 +2 位作者 德吉 索南措 拉多 《西藏大学学报(社会科学版)》 CSSCI 2014年第2期13-16,70,共5页
文章通过传统CTAB法、改良CTAB法、SDS法、高盐低pH法和试剂盒法等5种方法,对菊叶香藜进行基因组DNA提取,旨在筛选一种菊叶香藜基因组DNA的适宜提取方法。同时用紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳对5种方法所提DNA进行检测,并对改良CTAB... 文章通过传统CTAB法、改良CTAB法、SDS法、高盐低pH法和试剂盒法等5种方法,对菊叶香藜进行基因组DNA提取,旨在筛选一种菊叶香藜基因组DNA的适宜提取方法。同时用紫外分光光度法和琼脂糖凝胶电泳对5种方法所提DNA进行检测,并对改良CTAB法提取的DNA进行RAPD-PCR扩增检测。结果表明:改良CTAB法提取速度较快,便于操作,提取的DNA质量较好,进行的RAPD-PCR扩增条带清晰,能满足分子标记的要求。因此,改良CTAB法为菊叶香藜基因组DNA可靠并合适的提取方法。 展开更多
关键词 菊叶香藜 基因组DNA提取 RAPD检测
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一种新的从新疆穴居狼蛛中鉴定的细胞裂解肽(英文) 被引量:3
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作者 张勇群 代龙军 +3 位作者 陈金军 蒋立平 刘中华 梁宋平 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第9期818-823,共6页
蜘蛛粗毒中富含生物活性物质,尤其以多肽类成分为主.分离鉴定了新疆穴居狼蛛粗毒中一种新的细胞裂解肽,命名为LSTX-A1,其分子量为7335.33,含有65个氨基酸残基,且羧基端残基酰胺化.研究了LSTX-A1的细胞裂解作用,结果显示,在100μmol/L浓... 蜘蛛粗毒中富含生物活性物质,尤其以多肽类成分为主.分离鉴定了新疆穴居狼蛛粗毒中一种新的细胞裂解肽,命名为LSTX-A1,其分子量为7335.33,含有65个氨基酸残基,且羧基端残基酰胺化.研究了LSTX-A1的细胞裂解作用,结果显示,在100μmol/L浓度引起42%红细胞溶血.同时LSTX-A1具有抗肿瘤作用,能抑制HeLa细胞的增殖,其IC50剂量为22μmol/L. 展开更多
关键词 新疆穴居狼蛛 毒液 细胞裂解 CDNA克隆
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浸泡预处理提取伊朗蒿精油及其对毕赤酵母的抑制作用研究 被引量:1
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作者 张勇群 石梦菲 +2 位作者 黄云霞 拉巴卓玛 拉琼 《西藏大学学报(社会科学版)》 CSSCI 2013年第5期7-11,共5页
目的:研究浸泡预处理提取伊朗蒿精油的最佳条件及精油的抑菌效果。方法:采用浸泡预处理,并试用不同的条件对精油进行提取,同时采用滤纸片扩散法来检测精油对于毕赤酵母生长的抑制作用。结果:浸泡预处理提取伊朗蒿精油的最佳工艺是料液比... 目的:研究浸泡预处理提取伊朗蒿精油的最佳条件及精油的抑菌效果。方法:采用浸泡预处理,并试用不同的条件对精油进行提取,同时采用滤纸片扩散法来检测精油对于毕赤酵母生长的抑制作用。结果:浸泡预处理提取伊朗蒿精油的最佳工艺是料液比为1:15;浸泡预处理24h后回流5h,得到的精油量为12.0ml/kg。结论:伊朗蒿精油对于毕赤酵母的生长具有明显的抑制作用。 展开更多
关键词 伊朗蒿 精油 浸泡预处理 抑菌活性
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超临界CO_2萃取菊叶香藜精油工艺研究 被引量:3
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作者 何花 雷鸣 +3 位作者 薛金彪 郝豆豆 拉多 张勇群 《山西农业科学》 2016年第2期253-254,259,共3页
采用超临界流体萃取技术对菊叶香藜精油的提取工艺进行研究。结果表明,在40℃,15 MPa,1.5 h时精油量最高,为31.26 g/kg,是传统水蒸气法的20倍,并且其气味更接近天然的菊叶香藜;超临界CO_2提取法比水蒸气法优越,精油量高,时间短。此方法... 采用超临界流体萃取技术对菊叶香藜精油的提取工艺进行研究。结果表明,在40℃,15 MPa,1.5 h时精油量最高,为31.26 g/kg,是传统水蒸气法的20倍,并且其气味更接近天然的菊叶香藜;超临界CO_2提取法比水蒸气法优越,精油量高,时间短。此方法可为菊叶香藜精油快速提取和开发利用提供参考,并为其向工业化方向发展提供理论依据。 展开更多
关键词 菊叶香藜 精油 超临界CO_2萃取
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青藏高原特有植物分子谱系地理学研究现状 被引量:2
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作者 拉琼 张勇群 扎西次仁 《西藏大学学报(社会科学版)》 CSSCI 2013年第4期12-15,共4页
分子谱系地理学是研究物种或近缘物种遗传谱系地理格局和历史成因机制的一种研究方法。通过重建物种进化历史过程可探讨以往地质事件、地形地貌和气候变化对生物物种形成、分化和扩散的影响。文章通过对近几年来青藏高原特有植物分子谱... 分子谱系地理学是研究物种或近缘物种遗传谱系地理格局和历史成因机制的一种研究方法。通过重建物种进化历史过程可探讨以往地质事件、地形地貌和气候变化对生物物种形成、分化和扩散的影响。文章通过对近几年来青藏高原特有植物分子谱系地理学研究所取得重要成果的介绍,探讨了高原特有植物谱系地理结构,分析和总结了冰期高原植物微型避难所分布格局、居群各分支分化时间和冰期后回迁和扩散模式等。这些研究结果表明,青藏高原不同植物物种具有不同的冰期避难所分布格局和历史扩散特征。 展开更多
关键词 青藏高原 特有植物 分子谱系地理学
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转变我国经济增长方式浅析
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作者 张勇群 宫文萍 《经济技术协作信息》 2009年第17期10-10,共1页
目前国内很多学者从经济增长依靠的主要因素将经济增长的方式分成两类,即粗放型经济增长方式和集约型经济增长方式。粗放型经济增长方式,是主要依靠增加资金、资源的投入,来增加产品的数量,推动经济增长的方式。集约型经济增长方式... 目前国内很多学者从经济增长依靠的主要因素将经济增长的方式分成两类,即粗放型经济增长方式和集约型经济增长方式。粗放型经济增长方式,是主要依靠增加资金、资源的投入,来增加产品的数量,推动经济增长的方式。集约型经济增长方式,则是主要依靠科技进步和提高劳动者的素质,来增加产品的数量和提高产品的质量,推动经济增长的方式。转变经济增长方式, 展开更多
关键词 集约型经济增长方式 粗放型经济增长方式 科技进步 产品 劳动者 资金
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整粒和半粒青稞种子DNA的提取及RAPD检测 被引量:3
7
作者 郝豆豆 张勇群 +3 位作者 高玉花 雷鸣 武俊喜 拉多 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2017年第6期1257-1261,共5页
【目的】从青稞种子中提取高质量的基因组DNA。【方法】以半粒无胚青稞种子和整粒青稞种子为材料,用6种不同的方法提取基因组DNA,用琼脂糖凝胶电泳检测DNA的完整性,紫外分光光度计法检测DNA的浓度和纯度,并对提取的DNA进行了RAPD-PCR扩... 【目的】从青稞种子中提取高质量的基因组DNA。【方法】以半粒无胚青稞种子和整粒青稞种子为材料,用6种不同的方法提取基因组DNA,用琼脂糖凝胶电泳检测DNA的完整性,紫外分光光度计法检测DNA的浓度和纯度,并对提取的DNA进行了RAPD-PCR扩增检测,同时将剩下的半粒有胚青稞种子进行萌发实验。【结果】从半粒和整粒青稞种子中都可以提取到高质量的DNA,用提取的DNA作为RAPD-PCR扩增检测模板,得到的扩增产物条带清晰,多态性条带丰富,其质量满足RAPD分子标记的要求。【结论】高盐低p H法提取的DNA质量最好,是这6种方法中的最佳方法;半粒青稞有胚种子也能够正常生根发芽,可作为遗传实验的材料。 展开更多
关键词 青稞种子 基因组DNA RAPD-PCR扩增
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白草种子基因组DNA五种提取方法的比较 被引量:2
8
作者 郝豆豆 田志华 +3 位作者 雷鸣 武俊喜 拉多 张勇群 《西部林业科学》 CAS 2016年第3期81-84,95,共5页
用5种方法 (传统CTAB法、改良CTAB法、高盐低p H法、改良SDS法、试剂盒法)对白草种子基因组DNA进行提取,分别用紫外分光光度计法、琼脂糖凝胶电泳法、PCR扩增检测提取的DNA的质量。结果表明,传统CTAB法提取的DNA浓度低,含有较多杂质,抑... 用5种方法 (传统CTAB法、改良CTAB法、高盐低p H法、改良SDS法、试剂盒法)对白草种子基因组DNA进行提取,分别用紫外分光光度计法、琼脂糖凝胶电泳法、PCR扩增检测提取的DNA的质量。结果表明,传统CTAB法提取的DNA浓度低,含有较多杂质,抑制PCR反应;改良SDS法和改良CTAB法提取的DNA纯度低,不符合检测要求;高盐低pH法和试剂盒法提取的DNA纯度高、完整性好,但试剂盒法成本高、DNA得率低。所以高盐低pH法为5种方法中最经济、效果最好的白草种子DNA提取方法。 展开更多
关键词 白草 基因组DNA DNA提取方法 高盐低p H法
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循环经济的量及其分析
9
作者 张勇群 《经济技术协作信息》 2008年第33期4-4,共1页
提出了循环经济的量、绿色循环率和等标循环量的概念和计算统计方法;应用循环经济的量与绿色循环率对国民经济的绿色核算,资源能源效率的提高和可再生资源的利用均有意义。
关键词 循环经济 循环经济的量 绿色循环率
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伊朗蒿精油的微波提取及抑菌活性初步研究 被引量:2
10
作者 石梦菲 扎西次仁 +2 位作者 黄云霞 祁锟 张勇群 《安徽农业科学》 CAS 2013年第24期9945-9947,共3页
[目的]探讨微波提取伊朗蒿精油的最佳工艺条件,并对精油的抑菌效果进行研究。[方法]采用微波处理方法,试用不同的条件对伊朗蒿精油进行提取,并采用滤纸片扩散法来检测精油的抑菌效果。[结果]伊朗蒿精油的最佳微波提取工艺是:料液比为1∶... [目的]探讨微波提取伊朗蒿精油的最佳工艺条件,并对精油的抑菌效果进行研究。[方法]采用微波处理方法,试用不同的条件对伊朗蒿精油进行提取,并采用滤纸片扩散法来检测精油的抑菌效果。[结果]伊朗蒿精油的最佳微波提取工艺是:料液比为1∶15(W/V,g/ml,下同),微波湿处理30 min后保持4 h的回流时间;在此条件下,伊朗蒿精油的精油量为11.0 ml/kg。抑菌试验结果表明,伊朗蒿精油对于细菌生长具有明显的抑制作用。[结论]该研究为伊朗蒿的综合利用与开发提供了理论依据。 展开更多
关键词 伊朗蒿(Artemisia persica Boiss) 精油 微波提取 抑菌活性
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燕麦种子基因组DNA不同提取方法的比较 被引量:2
11
作者 郝豆豆 朱勇 +3 位作者 雷鸣 武俊喜 拉多 张勇群 《黑龙江农业科学》 2015年第10期20-23,共4页
为缩短DNA提取时间,省去种子萌发到幼苗培养等一系列过程,以燕麦种子为材料,用5种方法提取其基因组DNA,通过紫外分光光度法检测DNA的浓度和纯度,琼脂糖凝胶电泳检测DNA的完整性,以ITS2为引物将燕麦种子基因组DNA进行PCR扩增。结果表明:... 为缩短DNA提取时间,省去种子萌发到幼苗培养等一系列过程,以燕麦种子为材料,用5种方法提取其基因组DNA,通过紫外分光光度法检测DNA的浓度和纯度,琼脂糖凝胶电泳检测DNA的完整性,以ITS2为引物将燕麦种子基因组DNA进行PCR扩增。结果表明:5种方法中除了传统CTAB法,其余方法都可以提取到燕麦种子基因组DNA,但不同方法提取到的基因组DNA的纯度、浓度存在差异,试剂盒法提取的DNA质量最好、纯度最高,但提取的DNA量少且成本高,改良CTAB法和高盐低pH法提取的DNA的纯度相近,都有少量的蛋白质和糖类的污染,改良SDS法提取的DNA纯度最低。 展开更多
关键词 燕麦种子 提取方法 PCR扩增
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模拟大气氮沉降对中国森林生态系统影响的研究进展 被引量:64
12
作者 鲁显楷 莫江明 +10 位作者 张炜 毛庆功 刘荣臻 王聪 王森浩 郑棉海 MORI Taiki 毛晋花 张勇群 王玉芳 黄娟 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第5期500-522,共23页
人类活动加剧了活性氮的生产和排放,并导致氮沉降日益增加并全球化。目前,人类活动对全球氮循环的干扰已经超出了地球系统安全运行的界限。中国已成为全球氮沉降的高发区域,高氮沉降已经威胁到生态系统的健康和安全,并成为生态文明建设... 人类活动加剧了活性氮的生产和排放,并导致氮沉降日益增加并全球化。目前,人类活动对全球氮循环的干扰已经超出了地球系统安全运行的界限。中国已成为全球氮沉降的高发区域,高氮沉降已经威胁到生态系统的健康和安全,并成为生态文明建设过程中亟待理清和解决的热点问题。对国际上和中国森林生态系统模拟氮沉降研究的概况进行了综述,并从生物学和非生物学两大过程重点阐述模拟氮沉降增加对中国主要森林生态系统影响的研究进展。中国自2000年以后才开始重视大气氮沉降产生的生态环境问题,中国科学院华南植物园在国内森林生态系统模拟氮沉降试验研究上做出了开创性的贡献。模拟氮沉降研究表明,持续高氮输入将会显著改变森林生态系统的结构和功能,并威胁生态系统的健康发展,特别是处于氮沉降热点区域的中国中南部。森林生态系统的氮沉降效应依赖于系统的氮状态、土地利用历史、气候特征、林型和林龄等。最后,对未来的研究提出了一些建议,包括加强长期跟踪研究和不同气候带站点之间的联网研究,特别是在森林生态系统对长期氮沉降响应与适应的过程机制、地下碳氮吸存潜力研究、以及与其他全球变化因子的耦合研究等方面,以期为森林生态系统的可持续发展提供理论基础和管理依据。 展开更多
关键词 氮沉降 全球变化 森林生态系统 氮饱和 氮限制 氮素生物地球化学循环 生物多样性 碳吸存
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伊朗蒿花露水的研制及试用调查
13
作者 石梦菲 扎西次仁 +2 位作者 刘婷 张晓莉 张勇群 《西藏科技》 2015年第4期34-35,共2页
利用水蒸气蒸馏法提取并配制得到伊朗蒿花露水,通过试用调查可得知大众对于该花露水的感受及评价,证明了伊朗蒿花露水具有很好的前景以及一定的生产价值。
关键词 伊朗蒿 花露水 试用调查
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氮沉降对土壤线虫群落影响的研究进展 被引量:7
14
作者 张勇群 毛庆功 +4 位作者 王聪 王森浩 刘滔 莫江明 鲁显楷 《热带亚热带植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第1期105-114,共10页
综述了主要陆地生态系统(草原、农田和森林)土壤线虫群落对氮沉降增加的响应格局和机制。总体上,氮沉降增加对线虫数量一般无显著影响,但增加了土壤中富集机会主义者(即低营养级的r-策略者)数量,降低了线虫群落成熟度指数(MI),表明氮沉... 综述了主要陆地生态系统(草原、农田和森林)土壤线虫群落对氮沉降增加的响应格局和机制。总体上,氮沉降增加对线虫数量一般无显著影响,但增加了土壤中富集机会主义者(即低营养级的r-策略者)数量,降低了线虫群落成熟度指数(MI),表明氮沉降增加可能会使土壤食物网简化。氮沉降增加主要通过改变土壤微环境(如增加含氮离子浓度、降低土壤pH)直接影响土壤线虫群落,或者改变植物地上地下资源的输入和线虫与其他土壤动物的关系,间接影响线虫群落。最后,根据目前研究现状,指出了当前研究存在的局限性,包括研究时间和空间尺度上以及研究技术手段上的局限。建议综合多个全球环境变化因子,并结合室内试验及分子手段的方法对土壤线虫群落进行研究。 展开更多
关键词 氮沉降 土壤线虫 线虫生态功能 陆地生态系统 土壤食物网
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菊叶香藜精油的提取及对昆虫活力抑制的研究 被引量:8
15
作者 雷鸣 何花 +4 位作者 张鹏飞 姚永杰 赵琦 张勇群 拉多 《安徽农业科学》 CAS 2015年第28期64-66,共3页
[目的]探讨菊叶香藜精油的最佳提取方式,初步研究精油对昆虫的活力抑制。[方法]利用水蒸气蒸馏的方法,对不同形式、不同部位及不同条件下菊叶香藜的精油进行提取,并用提取的精油设计不同的精油剂量梯度进行玉米象的活力抑制试验。[结果... [目的]探讨菊叶香藜精油的最佳提取方式,初步研究精油对昆虫的活力抑制。[方法]利用水蒸气蒸馏的方法,对不同形式、不同部位及不同条件下菊叶香藜的精油进行提取,并用提取的精油设计不同的精油剂量梯度进行玉米象的活力抑制试验。[结果]不同形式、不同部位及不同条件下菊叶香藜的精油提取量均有较明显的差异。微波处理10 min、料液比1∶15时,回流4 h,菊叶香藜的精油量达最大值;菊叶香藜的花部位的精油含量最大,在4 h的回流时间下可以获得8.4 ml/kg的精油量;菊叶香藜精油对玉米象活力有一定抑制作用,且随精油浓度增加抑制程度增加。[结论]该研究为菊叶香藜精油向杀虫剂方面发展提供理论依据。 展开更多
关键词 菊叶香藜 精油 提取 玉米象 活力抑制
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浅谈新经济环境下对企业发展的若干思考
16
作者 宫文萍 张勇群 《经济技术协作信息》 2009年第15期4-4,共1页
自二十世纪四十年代以来,伴随着计算机技术的运用,人类的信息获取和加工能力有了超常的进步,这是知识经济时代的开始。在知识经济时代,知识生产力已成为经济发展的首要和关键因素。知识经济时代的到来,对全球经济产生了深刻的影响。
关键词 新经济环境 企业发展 知识生产力 二十世纪四十年代 经济时代 计算机技术 加工能力 信息获取
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砂生槐单粒种子DNA的快速提取及RAPD检测
17
作者 石梦菲 拉多 张勇群 《黑龙江农业科学》 2014年第8期35-38,共4页
为探讨快速提取种子DNA的有效方法,以砂生槐单粒种子为试验材料,在传统CTAB法基础上建立一种快速提取DNA的方法,并通过紫外分光光度法、凝胶电泳和RAPD-PCR检测所提基因组DNA。结果表明:快速法提取得到了质量较好、浓度及纯度较高的DNA... 为探讨快速提取种子DNA的有效方法,以砂生槐单粒种子为试验材料,在传统CTAB法基础上建立一种快速提取DNA的方法,并通过紫外分光光度法、凝胶电泳和RAPD-PCR检测所提基因组DNA。结果表明:快速法提取得到了质量较好、浓度及纯度较高的DNA,可以满足分子生物学实验的要求。此方法操作方便、快捷,是一种有效的砂生槐种子的DNA提取方法。 展开更多
关键词 砂生槐 单粒种子 DNA快速提取 RAPD检测
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菊叶香藜干粉熏香抑菌研究 被引量:4
18
作者 雷鸣 薛金彪 +4 位作者 郝豆豆 石梦菲 姚永杰 张勇群 拉多 《西藏科技》 2015年第12期63-64,共2页
菊叶香藜干粉熏香抑菌研究的目的是探讨菊叶香藜干粉是否具有抑菌的作用。研究中采用的供试菌为大肠杆菌DH5α,通过烟熏实验证明,菊叶香藜烟熏对大肠杆菌有很强的抑制作用,且随着烟熏时间的延长,抑制率逐渐增加,其中烟熏时间为0.5min时... 菊叶香藜干粉熏香抑菌研究的目的是探讨菊叶香藜干粉是否具有抑菌的作用。研究中采用的供试菌为大肠杆菌DH5α,通过烟熏实验证明,菊叶香藜烟熏对大肠杆菌有很强的抑制作用,且随着烟熏时间的延长,抑制率逐渐增加,其中烟熏时间为0.5min时,大肠杆菌的抑菌效果达到了1/3;烟熏时间为6min时,抑菌率达到100%。研究结果为菊叶香藜熏香方式的抑菌功效提供理论依据,对菊叶香藜在疾病预防的开发与利用具有一定的意义。 展开更多
关键词 菊叶香藜 熏香 抑菌 大肠杆菌
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骨髓间充质干细胞旁分泌IGF-1体外调节胰岛瘤细胞 被引量:1
19
作者 张勇群 施静 +3 位作者 郝豆豆 万莎 陈思媛 葛志静 《西南民族大学学报(自然科学版)》 CAS 2021年第2期174-180,共7页
采用体外共培养技术探索骨髓间充质干细胞(BMSCs)体外调节胰岛瘤细胞功能的可能机制.将培养的细胞分为:大鼠胰岛瘤细胞系(INS-1)单独培养的三组(培养的INS-1细胞系、培养的INS-1细胞系+IGF-1、培养的INS-1细胞系+NVPAEW541)、培养的INS-... 采用体外共培养技术探索骨髓间充质干细胞(BMSCs)体外调节胰岛瘤细胞功能的可能机制.将培养的细胞分为:大鼠胰岛瘤细胞系(INS-1)单独培养的三组(培养的INS-1细胞系、培养的INS-1细胞系+IGF-1、培养的INS-1细胞系+NVPAEW541)、培养的INS-1细胞系加BMSCs上清液后培养组的三组(培养的INS-1细胞系+BMSCs上清液、培养的INS-1细胞系+BMSCs上清液+IGF-1、培养的INS-1细胞系+BMSCs上清液+NVPAEW541)共6组,按不同干预进行刺激48h,取各组细胞的上清液、细胞爬片、进行细胞形态学观察、胰岛素及IGF-1分泌水平及免疫荧光学检测,对比分析各组的实验结果.结果显示,培养的INS-1细胞系+NVPAEW541组与培养的INS-1细胞系+BMSCs上清液+NVPAEW541组的细胞都呈缩小状、细胞数量也较其他各组少;培养的INS-1细胞系+BMSCs+IGF-1组的胰岛素分泌水平、IGF-1的分泌水平及免疫荧光强度是所有组中最高的(P<0.05);培养的INS-1细胞系+BMSCs组的胰岛素分泌水平、IGF-1分泌水平以及免疫荧光强度较INS-1组高(P<0.05);而培养的INS-1细胞系+BMSCs组的胰岛素水平较培养的INS-1细胞系+IGF-1组略低(P>0.05);但培养的INS-1细胞系+NVPAEW541组的胰岛素水平及IGF-1水平和免疫荧光强度仅较INS-1组略低(P>0.05);培养的INS-1细胞系+BMSCs++NVPAEW541组的各分泌水平以及免疫荧光强度也较培养的INS-1细胞系+BMSCs组低(P<0.05).研究发现BMSCs上清液具有和IGF-1因子相似的功能,能通过刺激IGF-1R通路调节大鼠胰岛瘤细胞的功能. 展开更多
关键词 骨髓间充质干细胞 胰岛素样生长因子(IGF-1) 胰岛瘤细胞(INS-1) IGF-1R信号通路
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菊叶香藜转录组数据库中FPPS基因的挖掘与生物信息学分析 被引量:4
20
作者 付苏宏 雷鸣 +2 位作者 张勇群 施静 郝豆豆 《广西植物》 CAS CSCD 北大核心 2019年第6期831-842,共12页
为深入了解菊叶香藜法尼基焦磷酸合酶基因,该研究对菊叶香藜转录组数据库进行挖掘,获取了两条FPPS基因序列(DsFPPS1和DsFPPS2),并对DsFPPS1和DsFPPS2编码蛋白的理化性质、结构、功能、系统进化进行了分析。结果表明:DsFPPS1和DsFPPS2基... 为深入了解菊叶香藜法尼基焦磷酸合酶基因,该研究对菊叶香藜转录组数据库进行挖掘,获取了两条FPPS基因序列(DsFPPS1和DsFPPS2),并对DsFPPS1和DsFPPS2编码蛋白的理化性质、结构、功能、系统进化进行了分析。结果表明:DsFPPS1和DsFPPS2基因分别包含1029bp和969bp的开放阅读框,分别编码342个(DsFPPS1)和322个(DsFPPS2)氨基酸。DsFPPS1和DsFPPS2位于线粒体内,未发现信号肽和跨膜结构,DsFPPS1为稳定蛋白,DsFPPS2为不稳定蛋白。氨基酸序列比对发现DsFPPS1和DsFPPS2序列相似性为60.53%,均含有5个保守结构域和2个天冬氨酸富集区域。DsFPPS1和DsFPPS2二级结构主要由α-螺旋构成,三级结构为由8个α-螺旋形成的α-螺旋束,但DsFPPS2的三级结构中缺少一个α-螺旋A。系统进化树中DsFPPS1与藜科植物聚为一枝,与藜科植物遗传距离较近,而DsFPPS2单独聚为一枝。通过对菊叶香藜转录组数据库中FPPS基因的挖掘与生物信息学分析,为菊叶香藜FPPS的功能研究及其倍半萜类化合物的生物合成研究奠定了一定的理论基础。 展开更多
关键词 法尼基焦磷酸合酶 转录组 菊叶香藜 基因挖掘 生物信息学
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