目的:通过网络药理学方法预测和探讨益气活血方抗肝纤维化的活性成分及其潜在的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中医...目的:通过网络药理学方法预测和探讨益气活血方抗肝纤维化的活性成分及其潜在的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中医药综合数据库(Traditional Chinese Medicine Integrated Database,TCMID)筛选出益气活血方的活性成分和相关的潜在靶点;利用GeneCards数据库检索肝纤维化相关靶点;基于益气活血方潜在靶点与肝纤维化相关靶点的匹配结果,利用String平台进行蛋白质相互作用分析,构建蛋白质相互作用网络,拓扑分析筛选核心靶点;利用Cytoscape 3.7.2构建益气活血方活性成分-肝纤维化-靶点网络,拓扑分析筛选出关键活性成分;再利用R语言软件对药物与疾病共有靶点分别进行基因本体(gene ontology,GO)功能、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。结果:益气活血方抗肝纤维化的核心活性成分为槲皮素、木犀草素、山奈酚、柚皮素、丹参酮Ⅱa等。核心靶点有转录激活因子-3(signal transducer and activator of transcription-3,STAT3)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶-1(serine/threonine protein kinase-1,AKT1)、原癌基因(proto-oncogene,JUN)、抑癌基因TP53等,主要涉及营养元素和脂多糖的应答过程、氧化应激反应、类固醇代谢应答过程、脂多糖的反应、活性氧代谢过程、小分子代谢过程的调控等生物过程。主要富集在磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositol-4,5-biphosphate 3-kinase-protein kinase B,PI3K-Akt)、流体剪应力与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的糖基化终末产物及其受体(advanced glycation and products-receptor of AGE,AGE-RAGE)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、TNF-α、白介素17(interleukin-17,IL-17)等信号通路。结论:益气活血方抗肝纤维化具有多成分、多靶点、多通路的作用特点,本研究为益气活血方抗肝纤维化机制的后续实验研究提供了理论基础和参考依据。展开更多
文摘目的:通过网络药理学方法预测和探讨益气活血方抗肝纤维化的活性成分及其潜在的作用机制。方法:采用中药系统药理学数据库和分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)、中医药综合数据库(Traditional Chinese Medicine Integrated Database,TCMID)筛选出益气活血方的活性成分和相关的潜在靶点;利用GeneCards数据库检索肝纤维化相关靶点;基于益气活血方潜在靶点与肝纤维化相关靶点的匹配结果,利用String平台进行蛋白质相互作用分析,构建蛋白质相互作用网络,拓扑分析筛选核心靶点;利用Cytoscape 3.7.2构建益气活血方活性成分-肝纤维化-靶点网络,拓扑分析筛选出关键活性成分;再利用R语言软件对药物与疾病共有靶点分别进行基因本体(gene ontology,GO)功能、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。结果:益气活血方抗肝纤维化的核心活性成分为槲皮素、木犀草素、山奈酚、柚皮素、丹参酮Ⅱa等。核心靶点有转录激活因子-3(signal transducer and activator of transcription-3,STAT3)、肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶-1(serine/threonine protein kinase-1,AKT1)、原癌基因(proto-oncogene,JUN)、抑癌基因TP53等,主要涉及营养元素和脂多糖的应答过程、氧化应激反应、类固醇代谢应答过程、脂多糖的反应、活性氧代谢过程、小分子代谢过程的调控等生物过程。主要富集在磷脂酰肌醇-4,5-二磷酸3-激酶-蛋白激酶B(phosphatidylinositol-4,5-biphosphate 3-kinase-protein kinase B,PI3K-Akt)、流体剪应力与动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的糖基化终末产物及其受体(advanced glycation and products-receptor of AGE,AGE-RAGE)、丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)、TNF-α、白介素17(interleukin-17,IL-17)等信号通路。结论:益气活血方抗肝纤维化具有多成分、多靶点、多通路的作用特点,本研究为益气活血方抗肝纤维化机制的后续实验研究提供了理论基础和参考依据。