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暗纹东方鲀与红鳍东方鲀鳔的转录组比较分析
1
作者
李岩
陆芸
+6 位作者
魏仁杰
尚凤芹
韩冰
张华琨
李润
王秀利
刘洋
《水产研究》
2023年第1期1-12,共12页
为了探究暗纹东方鲀和红鳍东方鲀的差异,本研究通过转录组测序技术(RNA-Seq)及生物信息学分析比较了暗纹东方鲀和红鳍东方鲀的鳔组织(TOSB vs TRSB)在转录水平上的差异。结果表明:在两种东方鲀中共得到了4062个差异表达基因(以p.adj <...
为了探究暗纹东方鲀和红鳍东方鲀的差异,本研究通过转录组测序技术(RNA-Seq)及生物信息学分析比较了暗纹东方鲀和红鳍东方鲀的鳔组织(TOSB vs TRSB)在转录水平上的差异。结果表明:在两种东方鲀中共得到了4062个差异表达基因(以p.adj < 0.05 & |log2foldchange| ≥ 1为阈值),其中上调表达的差异基因有2282个,下调表达的差异基因有1780个;通过GO和KEGG富集分析发现,差异基因显著富集到了与信号传导和听力相关的通路中。研究表明两种东方鲀在信号传导和听力功能方面存在显著差异,这种差异可能与其生存环境的不同相关。本研究为暗纹东方鲀与红鳍东方鲀的后续研究提供了数据支持,同时也为其他生物鳔组织的研究提供了参考。
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关键词
暗纹东方鲀
红鳍东方鲀
鳔
RNA-SEQ
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职称材料
热应激对鱼类hsp70基因和caspase-3基因影响的研究进展
被引量:
2
2
作者
张华琨
王冠
王秀利
《河北渔业》
2022年第2期28-32,共5页
鱼类对温度的适应因其种类不同而有差异,这是长期进化和演变的结果。本文通过对不同种鱼类的最大临界温度和高起始致死温度这两个热耐受性指标、耐热相关基因的表达等进行了综述,发现影响鱼类耐热能力的重要因素是基础水温和温度升高的...
鱼类对温度的适应因其种类不同而有差异,这是长期进化和演变的结果。本文通过对不同种鱼类的最大临界温度和高起始致死温度这两个热耐受性指标、耐热相关基因的表达等进行了综述,发现影响鱼类耐热能力的重要因素是基础水温和温度升高的速率,以及生物的生理及遗传,进而掌握不同鱼类的耐热能力,并对在高温胁迫下表达差异显著的hsp70基因和caspase-3细胞凋亡相关基因进行了分析讨论;发现热应激使hsp70在鱼类体内的合成速度显著增加,以提高鱼类的抗应激能力,同时也会使caspase-3基因被激活,诱导细胞发生凋亡。
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关键词
鱼类
热耐受性
HSP70基因
CASPASE-3基因
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职称材料
题名
暗纹东方鲀与红鳍东方鲀鳔的转录组比较分析
1
作者
李岩
陆芸
魏仁杰
尚凤芹
韩冰
张华琨
李润
王秀利
刘洋
机构
大连海洋大学水产与生命学院
辽宁省河鲀良种繁育及健康养殖重点实验室
大连海洋大学海洋科技与环境学院
出处
《水产研究》
2023年第1期1-12,共12页
文摘
为了探究暗纹东方鲀和红鳍东方鲀的差异,本研究通过转录组测序技术(RNA-Seq)及生物信息学分析比较了暗纹东方鲀和红鳍东方鲀的鳔组织(TOSB vs TRSB)在转录水平上的差异。结果表明:在两种东方鲀中共得到了4062个差异表达基因(以p.adj < 0.05 & |log2foldchange| ≥ 1为阈值),其中上调表达的差异基因有2282个,下调表达的差异基因有1780个;通过GO和KEGG富集分析发现,差异基因显著富集到了与信号传导和听力相关的通路中。研究表明两种东方鲀在信号传导和听力功能方面存在显著差异,这种差异可能与其生存环境的不同相关。本研究为暗纹东方鲀与红鳍东方鲀的后续研究提供了数据支持,同时也为其他生物鳔组织的研究提供了参考。
关键词
暗纹东方鲀
红鳍东方鲀
鳔
RNA-SEQ
分类号
G63 [文化科学—教育学]
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职称材料
题名
热应激对鱼类hsp70基因和caspase-3基因影响的研究进展
被引量:
2
2
作者
张华琨
王冠
王秀利
机构
大连海洋大学水产与生命学院
出处
《河北渔业》
2022年第2期28-32,共5页
基金
财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助(CARS-47)。
文摘
鱼类对温度的适应因其种类不同而有差异,这是长期进化和演变的结果。本文通过对不同种鱼类的最大临界温度和高起始致死温度这两个热耐受性指标、耐热相关基因的表达等进行了综述,发现影响鱼类耐热能力的重要因素是基础水温和温度升高的速率,以及生物的生理及遗传,进而掌握不同鱼类的耐热能力,并对在高温胁迫下表达差异显著的hsp70基因和caspase-3细胞凋亡相关基因进行了分析讨论;发现热应激使hsp70在鱼类体内的合成速度显著增加,以提高鱼类的抗应激能力,同时也会使caspase-3基因被激活,诱导细胞发生凋亡。
关键词
鱼类
热耐受性
HSP70基因
CASPASE-3基因
Keywords
fish
thermal tolerance
gene hsp70
gene caspase-3
分类号
R73 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
暗纹东方鲀与红鳍东方鲀鳔的转录组比较分析
李岩
陆芸
魏仁杰
尚凤芹
韩冰
张华琨
李润
王秀利
刘洋
《水产研究》
2023
0
下载PDF
职称材料
2
热应激对鱼类hsp70基因和caspase-3基因影响的研究进展
张华琨
王冠
王秀利
《河北渔业》
2022
2
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职称材料
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