BioMGE——一个用于采集和分析生物医用材料和多组学数据的数据库

随着机器学习技术的发展,生物医用材料的科学研究也逐渐走向数据驱动,利用生物测序技术来测试生物医用材料的生物功能,需要对生物医用材料进行进一步优化.因此,一个开放、共享的基础设施来存储来自不同研究领域的异构科学数据是多学科交叉联合分析的基石.本文介绍了BioMGE,一个基于灵活的自定义平台NMDMS(国家材料数据管理与服务平台)实现的数据库建设案例,用于收集生物医用材料和多组学测序数据.NMDMS的动态容器框架允许用户定义个性化的数据提交模式,存储来自生物医用材料和多组学研究领域的数据.自2019年以来,BioMGE已收集了1547100个生物医用材料和多组学数据集.BioMGE提供了数据导出接口,方便用户直接导出数据以进行数据分析.以组学数据可视化为例,提供BioMGE-viewer模块以实现对生物染色质结构数据从一维到三维的数据可视化.该数据库可为其他跨领域研究的数据共享提供了新的思路和平台.

关于民歌大赛在各中小城市举办的几点思考

文化自信,是党的十八大以来,在多个场合谈到的一个重要名词。是一个民族、一个国家以及一个政党对自身文化价值的充分肯定和积极践行,是对文化生命力的坚定信心。近一年的时间里,江苏省内的民歌活动可谓是异彩纷呈,如2018第四届“巴城杯”长三角民歌邀请赛、泰州兴化市里下河民歌大会、江海门户山歌沿江沿海地区山歌民歌交流展演和《茉莉花栀子花》里下河风情组歌专场演出等等。在这些民歌艺术文化活动中,笔者注意到活动的举办地多为兴化市、海门市一类的县级市,而大城市却鲜有这类活动的影子。所以,笔者希望通过此文探究民歌活动的开展对于县级市等一系列中小城市经济的推动作用以及当地民俗民风文化发展之意义所在。

圆与合——论戏曲中的图形之美与中国传统审美

戏曲是中国特有的一门集音乐、舞蹈和文学等于一身的中国传统艺术形式。而对于戏曲的审美,是在一代又一代戏曲剧本创作者、戏曲表演艺术家与观众的共同努力和相互作用下,经过无数次的揣摩、表演与欣赏的过程中提炼出来的。戏曲的审美,是综合艺术的审美,各类艺术形式如戏曲唱腔、程式性的舞蹈和情节丰富的剧本等,在戏曲这样一个大熔炉中革新、交融,最终成为一个有机的整体。传统中国人的审美喜爱"圆"与"合",而戏曲不论是在表演时还是在创作时都是与这种心理息息相关的。本文从戏曲中的声腔特点、舞蹈动作和文学剧本三个方面,探寻戏曲艺术与中国传统审美中"圆"与"合"的关系,努力为理解与研究戏曲艺术打开一条新思路。

以美洲音乐历史概况思考我国文化自信的意义

无论在世界的哪个国家或者哪个区域,音乐与当地居民的生活环境、生活方式都有着不可分割的紧密联系。当地的自然环境,决定了当地人民的生活方式,也就决定了当地的音乐风格。这一特点,在北美地区体现得更为典型与鲜明。整个美洲,都经历了长期的殖民统治。但与北美不同的是,在拉丁美洲,殖民统治与奴隶贸易对于音乐文化的影响显得更为深远。

基于密度聚类的染色质拓扑相关结构域识别方法

高通量染色质构象捕获(Hi-C)技术的快速发展为染色质结构分析提供了丰富的基因组位点间交互作用数据,但目前基于Hi-C数据的已有拓扑相关结构域(TAD)识别方法存在准确率低、参数敏感等问题。在此背景下,本文设计并实现了一种基于空间密度聚类的TAD识别方法。该方法首先对原始Hi-C数据进行预处理,得到归一化后的Hi-C接触矩阵数据;然后计算位点之间的距离矩阵,基于位点的核心距离和可达距离生成可达性图,并提取聚类簇;最后基于聚类结果和TAD提取边界。该方法能够识别出内聚性更高的TAD结构,且TAD边界处富集了更多的ChIP-seq因子。实验结果表明,本文方法在TAD识别中更准确,更具有现实意义。