恩替卡韦耐药乙型肝炎病毒稳定复制细胞系的转录组学分析

目的分析恩替卡韦耐药乙型肝炎病毒(ETV-r HBV)稳定转染前后宿主细胞转录组水平的基因差异表达,为后续开展HBV感染相关机制研究提供基础数据和参考。方法对ETV-r HBV稳定转染细胞株(HepG2.A64)及其原始背景细胞株(HepG2)进行转录组测序(n=3),利用DESeq2软件以|log2 Fold Change|>2、padj<0.05为差异基因筛选条件对测序结果进行差异基因筛选;利用clusterProfiler软件对差异基因进行GO功能富集分析和KEGG功能富集分析。采用RT-qPCR及Western blotting分别检测HBV稳定转染前后宿主细胞DNA修复相关基因mRNA及蛋白的表达水平。结果转录组测序结果显示,与HepG2细胞系相比,ETV-r HBV稳定转染的HepG2.A64细胞系共有613个基因存在差异表达,其中401个上调,212个下调(padj<0.05),GO和KEGG富集分析结果显示,差异表达基因主要参与炎症反应、PI3K/Akt信号通路、PPAR信号通路、NF-κB信号通路以及免疫相关的生物学过程。RT-qPCR及Western blotting检测结果显示,与HepG2细胞系相比,HepG2.A64细胞系中RAD52和XRCC2 mRNA表达量分别下降68.96%±7.59%、69.58%±6.32%,RAD52和XRCC2蛋白表达量分别下降69.93%±3.88%、26.47%±12.7%,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论与原始细胞系HepG2相比,ETV-r HBV稳定转染的HepG2.A64细胞系在转录水平出现大量差异表达基因,同时HepG2.A64细胞系中DNA修复相关基因表达量出现下调。

2016—2023年湖北省人呼吸道合胞病毒的流行特征分析

目的分析2016—2023年湖北省流感监测网络哨点医院急性呼吸道感染(ARIs)病例人呼吸道合胞病毒(HRSV)的流行特征。方法于2016—2023年采集湖北省流感监测哨点医院ARIs病例标本[包括流感样病例(ILI)和严重急性呼吸道感染(SARI)]并收集病例信息,采用荧光定量PCR法进行HRSV病毒核酸分型检测并进行资料整理、绘图和分析。结果2016—2023年采集ILI和SARI病例样本分别为12779和9165例;<5岁年龄组HRSV阳性率最高[15.77%(168/1065)],其中ILI病例2~<5岁组阳性率最高[13.60%(31/228)],SARI病例0~<2岁组阳性率最高[25.97%(60/231)](均P<0.001),各年龄组SARI病例HRSV检测阳性率范围为2.31%~25.97%,均高于ILI病例(0~13.60%)(P=0.016)。HRSV 2016—2020年呈秋、冬季流行,2023年呈春季流行;2016—2023年湖北省HRSV病毒A型和B型交替流行(2016和2020年为B型优势流行,2017—2019以及2023年为A型优势流行)。结论5岁以下SARI和ILI病例为HRSV主要感染人群;2016—2023年湖北地区HRSV季节性流行由秋、冬季流行转变为春季流行。