宏基因组技术诊断亲内皮疱疹病毒感染致濒危亚洲象死亡病例

本研究旨在借助宏基因组测序分析技术快速发现引起濒危亚洲象死亡的可能病原,再结合常规诊断技术,对大象病因进行分析和确诊,为大象相关疫病的快速诊断和预防提供参考。对死亡大象进行尸检,取心、肝、脾、肺、肾、淋巴结、肌肉、胃、十二指肠、空肠、结肠、盲肠、胰腺等器官制备切片,进行HE染色和病理分析;取腹股沟淋巴结进行宏基因组测序分析;使用特异性PCR方法对特征基因进行扩增和测序,经序列比对绘制进化树,分析其与其他毒株的进化关系。结果显示,死亡大象的剖检和病例切片结果符合象亲内皮疱疹病毒感染的特征,宏基因组分析结果显示,大象的腹股沟淋巴结中含有大量的象β疱疹病毒1型(即亲内皮疱疹病毒)。该大象死亡的原因可能是象亲内皮疱疹病毒感染所致,宏基因组技术对大象亲内皮疱疹病毒感染以及其他濒危动物病例的快速诊断具有良好的应用前景。

北京五区犬猫肠道冠状病毒感染的监测与分析

【目的】调查北京地区犬猫肠道冠状病毒的感染情况,探索犬猫冠状病毒感染与年龄、季节的相关性,为犬猫冠状病毒病的防治提供参考。【方法】根据各病原基因保守区域序列设计特异性引物,采用PCR或RT-PCR方法,对采集的402份犬猫肛拭子(犬样本192份、猫样本210份)分别进行犬猫冠状病毒检测,并进行犬猫细小病毒、犬星状病毒(CaAstV)的混合感染检测。通过卡方检验对犬冠状病毒(CCoV)和猫冠状病毒(FCoV)感染与季节的相关性进行统计学分析,通过回归统计对CCoV、FCoV感染率与年龄的相关性进行分析,根据临床样本信息统计北京五区的犬猫免疫情况。【结果】192例犬样本中CCoV阳性率为44.27%(85/192),CCoV、犬细小病毒(CPV)混合感染率为34.12%(29/85),未检测到CaAstV阳性样本。210例猫样本中FCoV阳性率为45.71%(96/210),FCoV、猫泛白细胞减少症病毒(FPV)混合感染率为60.42%(58/96)。192例犬样本中,健康犬CCoV阳性率为19.39%(19/98),患病犬CCoV阳性率为70.21%(66/94)。210例猫样本中,健康猫FCoV阳性率为24.41%(31/127),患病猫FCoV阳性率为78.31%(65/83)。CCoV在冬季的检出率最高,为42.35%(36/85);FCoV四季检出率相近,冬季检出率相对较高,为29.17%(28/85)。在不同年龄段中,犬CCoV阳性率为28.6%~87.8%,其中0~3月龄犬CCoV阳性率高达87.8%,为CCoV主要发病群体;猫FCoV阳性率为36.4%~53.8%,各年龄段间无显著差异(P>0.05)。【结论】北京五区犬猫肠道冠状病毒的感染率较高,且在冬季更易流行,各年龄段犬猫CCoV、FCoV的检出率无显著差异,临床多出现冠状病毒与细小病毒混合感染的情况。

狐β-防御素基因的组织分布及表达特性

为研究狐β-防御素(vBDs)在组织中的表达情况,本研究采集健康蓝狐和赤狐的气管、肠淋巴结、肺脏、肝脏、肾脏、脾脏、十二指肠、回肠、睾丸以及附睾10种组织,利用反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)分析10种β防御素基因在不同组织中的表达情况,并利用荧光定量聚合酶链式反应(qPCR)对蓝狐vBD1、vBD2组织表达特征进行分析。结果显示,vBDs基因在狐各组织中均有不同程度的表达,其中vBD1和vBD2在肝脏和肾脏组织中稳定表达,vBD3、vBD108和vBD 122于睾丸和附睾组织中稳定表达。蓝狐vBD1 mRNA在肾脏和肝脏中表达量均显著高于vBD2(P<0.0001),vBD1和vBD2 mRNA在肾脏中表达量均显著高于肝脏中的表达量(P<0.01和P<0.0001)。各β-防御素在特定组织中的稳定表达提示其不仅在抵御外界微生物感染中发挥作用,在其他生理活动中也可能发挥重要作用。