基于生物信息学分析TSPAN9在宫颈鳞状细胞癌中的表达和预后意义

目的通过生物信息学方法,基于TCGA数据和多种在线数据库分析TSPAN9在宫颈鳞状细胞癌(CESC)中的表达和预后意义。方法应用UCSC数据库中下载的肿瘤数据集和TIMER 2.0数据库分别分析TSPAN9在泛癌中的表达情况;使用UALCAN数据库、HPA数据库和Kaplan-Meier Plotter数据库分析TSPAN9在CESC中的表达和预后情况;运用R语言分析TSPAN9与免疫检查点、免疫微环境、免疫浸润细胞的相关性,并进行TSPAN9在CESC中的富集分析。结果TSPAN9在多种癌症中异常表达,其中在CESC中低表达,与CESC患者的预后密切相关。TSPAN9在CESC中与45个免疫激活剂、免疫抑制剂的标记基因相关,与CD4 T细胞、中性粒细胞、巨噬细胞、树突状细胞浸润显著相关。GO富集分析显示在CESC中TSPAN9参与了上皮-间质转化、WNT的细胞信号转导等生物过程;KEGG通路富集分析显示在CESC中TSPAN9在TGF-β信号通路、P53信号通路等发挥作用。结论TSPAN9在CESC中的低表达对于CESC患者的预后具有临床意义,有望成为肿瘤免疫治疗的新靶点。