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储存红细胞ATP代谢circRNA筛选及功能预测 被引量:3
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作者 张怡宇 苑召虎 +4 位作者 黄慧瑛 李秋娴 李楠 黄建云 魏亚明 《中国输血杂志》 CAS 2018年第4期332-338,共7页
目的筛选4℃储存前、后期红细胞差异表达的circRNA并初步预测其功能。方法采集健康无偿献血者5(人)份血样200 m L/份,制备成悬浮红细胞,滤除白细胞后(悬浮滤白红细胞)分为3组:4℃储存0、20及40 d组,对3组标本用第2代高通量测序技... 目的筛选4℃储存前、后期红细胞差异表达的circRNA并初步预测其功能。方法采集健康无偿献血者5(人)份血样200 m L/份,制备成悬浮红细胞,滤除白细胞后(悬浮滤白红细胞)分为3组:4℃储存0、20及40 d组,对3组标本用第2代高通量测序技术检测,根据FDR〈0.05且|log2FC|〉1这2个条件,以火山图和表达模式聚类分析筛选出差异基因并用cytoscape作出mRNA—circRNA—miRNA网络图;通过KEGG和GO分析筛选出与ATP代谢相关的circRNA验证;最后通过生信软件预测hsacirc0007470—hsa-miR-155-5p—MRP4的分子结合具体区域及生物学功能。结果红细胞储存20 d较0 d时差异表达的circRNA有119个,40 d较20 d时差异表达的circRNA有110个,2个储存阶段都有差异表达的circRNA共有41个。KEGG和GO分析显示在差异表达的circRNA中hsacirc0007470的亲本基因MRP4富集于c AMP代谢通路。mireap、miranda、targetscan、circBase、miRBase、mirTar Base软件分析及序列比对显示hsacirc00007470可与hsa-miR-155-5p结合;hsa-miR-155-5p可与MRP4结合。经PCR验证,红细胞储存在0、20、40 d时,hsacirc00007470、MRP4、hsa-miR-155-5p的变化倍数分别为1.00±0.02、1.36±0.09、0.53±0.16,1.00±0.01、1.87±0.48、0.45±0.20,1.00±0.02、0.43±0.20、0.98±0.29。红细胞储存0、20、40 d时,总ATPase(U/gHb)分别是40.87±5.883、18.300±2.847、10.21±1.636;ATP(U/gHb)分别是8.708±1.25、3.082±0.166、2.462±0.252。结论储存红细胞中存在circRNA,且含量会随储存时间发生改变,储存20 d后红细胞的hsacirc00007470与ATPase及ATP表达呈同向相关性,hsacirc00007470或许能解除hsa-miR-155-5p对MRP4的抑制作用,通过ATP代谢途径改善红细胞变形能力。 展开更多
关键词 储存红细胞ATP酶 环状RNA 小分子RNA CAMP MRP4 生物信息学
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《特殊紧急抢救输血推荐方案》应用实践 被引量:8
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作者 吴千羽 李楠 +5 位作者 张怡宇 陈小洁 黄建云 魏亚明 刘景汉 兰炯采 《中国输血杂志》 CAS 北大核心 2016年第5期454-457,共4页
目的分析《特殊情况紧急抢救输血推荐方案》(简称《紧急输血方案》)在医院紧急医疗抢救工作中实施的效果及意义。方法根据《紧急输血方案》的应用范围,从广州市第一人民医院2013-2015年46 061例输血病例中,收集《紧急输血方案》公布前后... 目的分析《特殊情况紧急抢救输血推荐方案》(简称《紧急输血方案》)在医院紧急医疗抢救工作中实施的效果及意义。方法根据《紧急输血方案》的应用范围,从广州市第一人民医院2013-2015年46 061例输血病例中,收集《紧急输血方案》公布前后3年符合特殊情况紧急抢救输血的524例病例做回顾性总结分析和比较,包括《紧急输血方案》实施前后特殊情况紧急抢救输血的一般及变化情况、ABO及Rh血型同型输注与相容性输注比例、输血适应证种类、病例的临床科室分布、实验室检测处理时间以及输血不良反应发生率等。结果在《紧急输血方案》的指导下,完成374例特殊情况需要紧急抢救输血的临床输血病例,医院输血科及相关科室执行紧急特殊输血治疗的能力和时间效率都有很大提高,尤其是《紧急输血方案》公布前后处理ABO疑难血型患者紧急抢救输血病例的实验室处理时间(h)由1.37±0.21缩短至0.32±0.10(P<0.05)、库存不足导致需要不同型血液成分输注的实验室处理时间(h)由0.31±0.10缩短至0.22±0.10(P<0.05),并体现在RhD阴性血患者紧急抢救的病例中。结论《紧急输血方案》为输血科和临床科室提供了科学、规范、标准的输血急救治疗依据和指导,使得抢救输血能有效缓解患者病情和赢得治疗时间。 展开更多
关键词 输血 紧急抢救 特殊情况 相容性输注 推荐方案
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储存血小板差异性长链非编码RNA表达谱研究 被引量:7
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作者 李楠 苑召虎 +3 位作者 陈小洁 黄建云 张怡宇 魏亚明 《中国输血杂志》 CAS 2018年第1期27-32,共6页
目的探讨机采血小板储存过程中差异性lncRNA表达谱变化及其差异表达的lncRNA在血小板储存损伤中潜在的生物学功能。方法收集13(人)份O型健康男性机采血小板各50 m L,于(22±2)℃下震荡储存,应用lncRNA芯片技术检测储存2、5、8 ... 目的探讨机采血小板储存过程中差异性lncRNA表达谱变化及其差异表达的lncRNA在血小板储存损伤中潜在的生物学功能。方法收集13(人)份O型健康男性机采血小板各50 m L,于(22±2)℃下震荡储存,应用lncRNA芯片技术检测储存2、5、8 d机采血小板中lncRNA和mRNA表达谱变化;运用GO分析及KEGG分析预测差异表达的lncRNA功能分布,通过顺式调控分析预测lncRNA调控邻近蛋白编码基因表达的分子机制;采用实时PCR(RT-PCR)技术,验证8条lncRNA(MARCH2-2∶1、SLC2A2-1∶1、WBSCR16-3∶6、WEE1-2∶1、ENTPD6-2∶1、NKD2-1∶1、FOXS1-2∶1、MAPK13-3∶1)和4条mRNA(BCL2L1、CAPN2、MAPK14、VAMP8)的表达。结果芯片检测:血小板储存5与2 d相比,有162种lncRNA的表达量发生明显变化,表达升高的4种、降低的158种;8与2 d相比,有691种lncRNA表达量发生明显变化,表达升高的20种、降低的671种;8与5 d相比,246种lncRNA表达量发生明显变化,升高的2种,降低的244种。GO和KEGG分析:差异表达的lncRNA可能参与的生理过程有血小板激活、血小板聚集、内吞、凋亡、肌动蛋白纤维聚集、肌动蛋白骨架的调节;顺式调控分析:lncRNA具有调控血小板相关mRNA表达的功能,USP39-1调控VAMP8的表达、TMEM86B-2调控GP6的表达、FOXS1-2调控BCL2L1的表达等。RT-PCR验证:与芯片检测结果一致,其中lncRNA MARCH2-2∶1、WEE1-2∶1和NKD2-1∶1表达量升高,WBSCR16-3∶6、SLC2A2-1∶1、ENTPD6-2∶1、FOXS1-2∶1和MAPK13-3∶1表达量下降,BCL2L1,CAPN2,MAPK14和VAMP8的表达量也下降。结论血小板中含有大量的lncRNA,其表达量随着血小板储存时间延长而呈不同的变化趋势,总体来讲下调的lncRNA数量较多,且下调的幅度较大。部分变化的lncRNA可能与血小板生理功能密切相关,并且在血小板储存损伤中发挥作用。 展开更多
关键词 血小板 长链非编码RNA RNA表达谱 血小板储存损伤 基因芯片 生物信息学分析
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C反应蛋白和嗜酸性粒细胞百分比在青年输血不良反应危险因素分析中的作用 被引量:2
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作者 李楠 张怡宇 +1 位作者 谢双锋 黎燕玲 《中山大学学报(医学科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期335-341,共7页
[目的]探讨青年患者发生输血不良事件的危险因素及与外周血C反应蛋白(CRP)及嗜酸性粒细胞百分比(EO%)的关系。[方法]收集2019年1月-2020年12月发生输血不良反应的66例青年患者资料,做为观察组;对照组则随机选取未发生输血反应,且入院年... [目的]探讨青年患者发生输血不良事件的危险因素及与外周血C反应蛋白(CRP)及嗜酸性粒细胞百分比(EO%)的关系。[方法]收集2019年1月-2020年12月发生输血不良反应的66例青年患者资料,做为观察组;对照组则随机选取未发生输血反应,且入院年月、科室、疾病、血制品类型、性别与观察组分别对应的66例青年患者。分析两组患者年龄、输血史、过敏史、输血前静脉血CRP及EO%水平,绘制受试者工作特征(ROC)曲线评价输血前静脉血CRP与EO%对输血不良反应预测的效能,并使用回归分析对危险因素进一步验证。[结果]与对照组患者相比,观察组发生非溶血性发热反应(FNHTR)患者输血前CRP更高;观察组发生过敏性输血反应(ATR)患者输血前CRP更高,有输血史者占比更高,输血前EO%更低,差异有统计学意义(P<0.05)。输入不同血液品种对发生ATR和FNHTR具有差异性(P<0.05)。输血前CRP对诊断FNHTR的ROC曲线下面积0.889,最佳截断值18.05 mg/L(P<0.05);输血前CRP对诊断ATR的ROC曲线下面积0.749,最佳截断值为17.6 mg/L(P<0.05)。[结论]输血前C反应蛋白水平是青年患者发生FNHTR和ATR的独立危险因素,对输血不良反应的发生具有诊断价值;EO%对输血不良反应的预测价值不足。 展开更多
关键词 青年人 输血不良反应 嗜酸性粒细胞百分比 C反应蛋白 危险因素
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非晶ZSO透明导电薄膜的P-MBE制备
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作者 徐博 岳超 +1 位作者 盛拓 张怡宇 《半导体光电》 CAS 北大核心 2015年第3期408-411,共4页
采用射频等离子体辅助分子束外延技术(P-MBE),在石英玻璃基片上制备了高纯度的透明导电ZSO薄膜,利用X射线衍射、原子力显微镜、Hall测试仪和光谱测量等表征技术,研究了射频功率对ZSO的结晶性能、表面形貌、电学参数及透射率等的影响。... 采用射频等离子体辅助分子束外延技术(P-MBE),在石英玻璃基片上制备了高纯度的透明导电ZSO薄膜,利用X射线衍射、原子力显微镜、Hall测试仪和光谱测量等表征技术,研究了射频功率对ZSO的结晶性能、表面形貌、电学参数及透射率等的影响。研究结果表明,在室温350W离化气源功率下,非晶态ZSO薄膜表面平整度高,室温电子迁移率达11.47cm2·V-1·s-1,电阻率为1.497Ω·cm,光学禁带宽度为3.53eV。分析得出,采用此工艺制备的非晶ZSO透明导电薄膜,具有优良的光电性能,是制备透明导电薄膜晶体管的优良宽禁带半导体材料。 展开更多
关键词 ZSO薄膜 微观结构 宽禁带半导体 电学性能 光学常数
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储存红细胞中表达降低的circRNA以及其靶基因预测的研究
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作者 张怡宇 黄国清 +6 位作者 王强 张勇刚 苑召虎 陈小洁 黄建云 李楠 魏亚明 《临床输血与检验》 CAS 2021年第4期428-434,共7页
目的探讨储存红细胞中表达降低的circRNA靶基因预测及其与储存损伤的关系。方法3(人)份血样来自健康无偿献血者血液制备的悬浮红细胞,滤除白细胞后均分为新鲜组(0 d),4℃储存20 d红细胞组(储存组);对2组标本用高通量测序检测,选取下降... 目的探讨储存红细胞中表达降低的circRNA靶基因预测及其与储存损伤的关系。方法3(人)份血样来自健康无偿献血者血液制备的悬浮红细胞,滤除白细胞后均分为新鲜组(0 d),4℃储存20 d红细胞组(储存组);对2组标本用高通量测序检测,选取下降明显的10个circRNA做PCR验证,用circBase和mirTarBase完成数据库注释与靶向预测,并将miRNA可能作用的mRNA也进行了关联分析,以此筛选到可能与储存损伤密切相关的circRNA。结果20 d与0 d组对比,hsa_circ_0005413、hsa_circ_0008937、hsa_circ_0040340、hsa_circ_0003126、hsa_circ_0007995、hsa_circ_0023937、novel_circ_0000402、hsa_circ_0028281表达量显著下降(P<0.05);hsa-miR-7160-5p、hsa-miR-122-5p、hsa-miR-4534的表达量显著上升(P<0.05);CASP8、CDK4、TMOD3显著下降(P<0.05)。生物信息学分析显示这些circRNA的靶基因参与红细胞凋亡与抗凋亡、红细胞膜的稳定、红细胞氧化损伤、铁代谢等生理过程。结论本研究构建了几个差异表达的circRNA-miRNA-mRNA网络,发现hsa_circ_0005413-hsa-miR-7160-5p-CASP8、hsa_circ_0040340-hsa-miR-122-5p-CDK4、hsa_circ_0007995-hsa-miR-4534-TMOD3可能参与了红细胞储存损伤的生物学过程。 展开更多
关键词 红细胞储存损伤 环状RNA分子 小分子RNA 凋亡 CASP8
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储存红细胞中circRNA变化对泛素介导蛋白水解通路调控的预测分析 被引量:1
7
作者 张怡宇 黄国清 +6 位作者 张勇刚 苑召虎 王强 陈小洁 黄建云 李楠 魏亚明 《临床输血与检验》 CAS 2021年第4期420-427,共8页
目的探讨储存红细胞中circRNA对泛素蛋白水解通路调节的可能机制及其在红细胞储存损伤中可能发挥的作用的预测分析。方法健康无偿献血者3(人)份血液制备的悬浮红细胞,过滤白细胞后平均分为新鲜组(0 d组),4℃储存20 d红细胞组(20 d组),4... 目的探讨储存红细胞中circRNA对泛素蛋白水解通路调节的可能机制及其在红细胞储存损伤中可能发挥的作用的预测分析。方法健康无偿献血者3(人)份血液制备的悬浮红细胞,过滤白细胞后平均分为新鲜组(0 d组),4℃储存20 d红细胞组(20 d组),4℃储存40 d红细胞组(40 d组);对3组标本用高通量测序检测,然后做KEGG和GO分析,选取母基因在泛素介导的蛋白水解通路中的circRNA做PCR验证,用circBase和mirTarBase完成数据库注释与靶向预测,并将miRNA可能作用的mRNA也进行了关联分析。用circRNA interactome预测circRNA的RBP结合蛋白。结果与泛素蛋白水解调控相关的hsa_circ_0036044、hsa_circ_0024173、hsa-miR-4530表达量,20 d组均高于0 d组,差异有统计学意义(P<0.05),20 d组的hsa_circ_0035761和TRAF2表达量低于0 d组,差异有统计学意义(P<0.05);40 d组hsa_circ_0002502表达量低于0 d组,且差异有统计学意义(P<0.05);40 d组的hsa_circ_0024173和hsa-miR-4530表达量低于与20 d组,且差异有统计学意义(P<0.05),40 d组的hsa_circ_0028196、hsa_circ_0035761、TRAF2表达量高于20 d组,且差异有统计学意义(P<0.05)。进一步通过生物信息学分析预测显示hsa_circ_0035761参与抗凋亡生理过程。结论本研究发现了多个体外储存红细胞中与泛素介导的蛋白水解通路的circRNA表达呈差异变化,发现和验证了hsa_circ_0035761—hsa-miR-4530—TRAF2轴,并揭示了hsa_circ_0035761还具有抗凋亡作用。与多种RNA结合蛋白结合能力,可能是这些circRNA表达量升高主要机制。 展开更多
关键词 红细胞储存损伤 环状RNA分子 小RNA分子 RNA结合蛋白 凋亡
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探讨降低医院血液报废率的方法
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作者 王强 张怡宇 《国际检验医学杂志》 CAS 2021年第S01期223-225,共3页
目的调查本院近年来血液报废率情况,分析血液报废的原因,总结减少血液报废的经验教训,不断降低血液报废率。方法对2011-2019本院血液报废率情况进行比较和统计学分析。结果2011-2019年血液报废率分别为1.29%、1.28%、1.34%、0.76%、0.65... 目的调查本院近年来血液报废率情况,分析血液报废的原因,总结减少血液报废的经验教训,不断降低血液报废率。方法对2011-2019本院血液报废率情况进行比较和统计学分析。结果2011-2019年血液报废率分别为1.29%、1.28%、1.34%、0.76%、0.65%、0.67%、0.61%、0.62%、0.20%。各年度血液报废率比较差异有统计学意义(P<0.001)。结论通过科学合理调整库存,密切与临床和血站沟通,实施精细化管理等方法,可以不断降低血液报废率。 展开更多
关键词 降低 血液报废率 方法
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