基于GEO数据库筛选胃癌差异表达基因及其功能和通路富集分析

目的基于基因表达数据库(GEO)运用生物信息学方法挖掘胃癌诊断和预后相关的核心基因,筛选参与胃癌发生发展的分子靶标。方法从GEO数据库中下载胃癌基因芯片数据GSE118916、GSE54129和GSE79973,筛选差异表达基因(DEGs)并进行分子功能和信号通路的富集分析,构建蛋白质互作网络(PPI),根据网络节点和位置筛选出核心基因,利用癌症基因图谱(TCGA)中胃腺癌(STAD)的全基因组测序数据对核心基因进行表达水平和诊断预后的验证分析,最后通过qRT-PCR检测核心基因在不同胃癌细胞株中的表达水平。结果共筛选出77个DEGs,主要位于细胞外基质(ECM)与基底膜,具有氧化还原酶和ECM受体配体活性,参与机体消化和激素代谢等生物学过程,与胃酸分泌、视黄醇和激素代谢等信号通路相关。共获得9个核心基因,其中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3和THY1在胃癌中表达上调(P<0.05);而TFF1、GKN1、TFF2、PGC在胃癌中下调(P<0.05)。生存预后分析显示,SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3、TFF2、THY1的异常表达与胃癌患者的生存时间显著相关;ROC曲线显示,TIMP1、SPARC、THY1、THBS2对胃癌有较高的诊断价值;在胃癌患者的病理组织中SPARC、TIMP1、THBS2、COL6A3的高表达得到验证;qRT-PCR检测发现,核心基因在不同的胃癌细胞株中不尽相同,但表达趋势基本符合。结论SPARC、TIMP1、THBS2等DEGs可能与胃癌的发生发展有关,可能作为潜在的候选分子标志物,用于胃癌的早期诊断和预后判断。

尿VEGF、ET检测对2型糖尿病患者早期肾脏微血管损伤的诊断价值

目的探讨尿血管内皮生长因子(VEGF)、内皮素(ET)对2型糖尿病患者早期肾脏微血管损伤的诊断价值。方法按尿微量蛋白排泄率把76例2型糖尿病患者分为无肾病、早期肾病、临床肾病3组。采用放射免疫法(RIA)和酶联免疫吸附试验(ELISA)测定尿VEGF、α1-微球蛋白(α1-MG)、β2-微球蛋白(β2-MG)、免疫球蛋白G(IgG)、ET水平。结果2型糖尿病患者尿VEGF、ET与对照组比较差异有统计学意义(t≥2.29,P<0.01),且其水平随病情加重而明显升高;与α1-MG、β2-MG、IgG、Alb、糖化血红蛋白(HbA1c)呈正显著相关(r≥0.309),而与空腹血糖(FBG)无明显相关(r≤0.06)。结论VEGF、ET参与糖尿病微血管病变的发生、发展;尿VEGF、ET是诊断2型糖尿病患者早期肾脏微血管损伤的敏感指标,对糖尿病肾病的早期诊断和肾功能损害程度的判断有一定的临床诊断价值。

动态观察危重病人CRRT中COR,TNF-α,IL-6水平变化的临床意义

目的 :探讨危重病人连续性肾脏替代治疗 (CRRT)中动态观察血中皮质醇 (COR)、肿瘤坏死因子 (TNF-α)、白介素 - 6 (IL - 6 )水平变化的临床意义。方法 :把 2 7例病人于严重创伤后 12h有否进行CRRT随机分成CRRT治疗组和非CRRT治疗组 ,采用放射免疫分析 (RIA)检测两组患者在 12h、2 4h、4 8h、72h血中COR、TNF -α、IL - 6的含量 ,并观察患者体温 (T)、心率 (P)、呼吸 (R)等临床症状的改变。结果 :非CRRT治疗组COR、TNF -α、IL - 6水平呈进行性升高 ;CRRT治疗组TNF -α在CRRT治疗 12h ,显著低于同期非CRRT治疗组水平 (P <0 0 5 ) ,随后逐渐升高 ,但其水平仍较同期非CRRT治疗组低但无统计学意义 (P >0 0 5 ) ,而COR、IL - 6在CRRT治疗 12h后明显降低 ,组间有显著性差异 (P <0 0 0 1,P <0 0 5 ) ,治疗组临床症状显著改善。结论 :危重病人CR RT可明显降低COR、TNF -α、IL - 6水平 ,显著改善全身炎症症状 ,降低多脏器功能障碍综合征 (MODS)的发生率 ;动态观察COR、TNF -α、IL -

慢性肾衰继发性甲旁亢iPTH水平变化的临床意义及罗钙全疗效观察

目的探讨慢性肾功能衰竭(CRF)并发继发性甲状旁腺机能亢进(SHPT)血中全段甲状旁腺激素(iPTH)水平变化的临床意义及小剂量罗钙全对慢性肾衰继发甲旁亢早期的疗效观察。方法分别采用免疫放射法、苦味酸法、偶氮胂Ⅲ法、直接紫外法测定60例健康体检者和94例CRF患者血iPTH、Cr、Ca、P含量;取iPTH含量87.5～295ng/L的SHPT病人随机分为观察组和治疗组各23例,治疗组每天口服罗钙全0.25ug。结果血iPTH水平随肾功能损害的加重而逐渐升高,与Cr成正相关,P亦逐渐升高,Ca则逐渐降低;治疗组服药3个月后,血iPTH显著降低(P<0.05),Ca明显升高(P<0.05),P无显著性差异(P>0.05),观察组血iPTH显著升高(P<0.05)。结论iPTH可作为早期诊断CRF继发性甲旁亢的敏感指标且其水平与肾功能损害程度一致;口服小剂量罗钙全治疗早期SHPT的疗效与iPTH水平有关。

2型糖尿病患者骨代谢生化指标的临床意义

目的 :探讨 2型糖尿病患者骨代谢生化指标的临床意义。方法 :对 4 0例 2型糖尿病患者及 31例正常人进行血骨钙素 (BGP)、钙 (Ca)、碱性磷酸酶 (ALP) ;尿脱氧吡啶啉 (DPD)、Ca、肌酐 (Cr)测定。结果 :糖尿病组血清BGP较正常对照组明显降低 (P <0 0 5 ) ;尿DPD/Cr比值 ,Ca/Cr比值显著高于正常对照组 (P <0 .0 5 ,P <0 .0 5 ) ;血清Ca、ALP两组无统计学差异。结论 :2型糖尿病患者骨代谢异常引发骨量减少、骨质疏松与骨形成减少和骨吸收增加有关 ;血BGP、尿DPD/Cr、Ca/Cr可作为早期诊断糖尿病骨量减少、骨质疏松敏感的骨代谢生化指标。

血tPSA、cPSA、IGF-I联检对前列腺疾病诊断的临床价值

目的:探讨联检血清前列腺特异性抗原(tPSA)、复合前列腺特异性抗原(cPSA)、胰岛素样生长因子-I(IGF-I)含量及cPSA/tPSA比值对前列腺疾病诊断的临床价值。方法:分别采用磁微粒免疫化学发光法(ICLMA)和免疫放射分析(IRMA)对41例前列腺癌(PCa)、60例前列腺增生(BPH)患者和55例正常对照者进行tPSA、cPSA、IGF-I定量检测和计算cPSA/tPSA比值并比较分析。结果:PCa患者血清中tPSA、cPSA、IGF-I水平明显高于BPH组和正常对照组(P<0.01);BPH、PCa两组患者各项检测指标在"灰色区域"上分布差异有显著性(P<0.01);以tPSA>4ng/ml、cPSA>3.6ng/ml、IGF-I>150和cPSA/tPSA>0.74作为筛选PCa的临界值,其临床灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值分别为88.6%、84.9%、83.0%、90.0%。结论:联合使用tPSA、cPSA、cPSA/tPSA和IGF-I指标进行PCa的筛选,其临床诊断概率优于各单一指标,且对早期PCa的诊断和BPH的区别有重要的临床价值。

五种检测幽门螺杆菌感染方法的评估

目的对五种检测幽门螺杆菌(Hp)感染的方法进行评估。方法对193例有胃肠道症状患者进行快速尿素酶试验(RUT)、组织学检(Warthin-Starry)、13C-尿素呼气试验(13C-UBT)、幽门螺杆菌粪便抗原 (HpSA)、幽门螺杆菌聚合酶链反应(Hp-PCR)五项试验,以上述五项中二项阳性为Hp阳性,全部五项阴性为 Hp阴性作为“金标准”。结果 193例患者按“金标准”诊断Hp阳性94例,阴性99例,RUT、组织学检查(W-S 银染)、13C-UBT、HpSA、Hp-PCR敏感度分别为:78．9％、72．9％、93．6％、89．6％、76．0％,特异度:78．6％、97．9％、 91．9％、90．7％、97．9％,准确度:78．8％、85．5％、92．9％、90．2％、86．5％,阳性预测值:78．1％、97．2％、91．7％、90．5％、 97．4％,阴性预测值:79．4％、78．5％、93．8％、89．8％、99．1％。结论 13C-UBT、HpSA试验是诊断Hp感染及追踪 Hp根治的简便、准确和非侵入性的检查方法。

人工肝支持系统治疗急性肝衰竭患者LPS、TNF-α、IL-2、IL-6水平变化的临床意义

目的探讨人工肝支持系统(ALSS)治疗急性肝衰竭(ALF)患者内毒素(LPS)、肿瘤坏死因子(TNF-α)、白介素-2(IL-2)、白介素-6(IL-6)水平变化的临床意义。方法48例ALF患者随机分为治疗组25例及对照组23例,两组在综合护肝治疗的基础上,治疗组同时采用ALSS治疗。分别检测两组治疗前后血中LPS、TNF-α、IL-2、IL-6、白介素-8(IL-8)的水平。结果治疗后,对照组LPS、TNF-α、IL-6、IL-8水平虽有降低,但无统计学差异(P>0.05);治疗组LPS、TNF-α、IL-6、IL-8水平显著下降,IL-2水平明显上升,有统计学差异(P<0.05或P<0.01);治疗组治疗有效率为80.8%,对照组为39.1%,两组有显著性差异(P<0.01)。结论ALSS能显著降低ALF患者LPS、TNF-α、IL-6、IL-8等炎症介质,观察其水平变化,能较好地了解病情的程度及预后情况,对防止肝衰竭加重及并发多脏器功能不全综合征(MODS)具有重要的治疗意义。

RIA数据管理系统软件的开发

利用ＳＮ－６８２型放射免疫γ计数仪随机配置４８６微机，自行开发ＲＩＡ数据管理系统软件，实现了样品计数测量、实验数据自动接收、检验单打印、检验单查询、质量控制、分类汇总等功能电脑一体化，提高了工作效率及ＲＩＡ数据管理科学化。

^(13)C-UBT对儿童感染幽门螺杆菌的诊断价值

目的 :探讨1 3 碳 -尿素呼气试验 (1 3 C -UBT)对儿童感染幽门螺旋杆菌的诊断价值。方法 :对 99例无症状儿童及 1 0 5例反复腹痛患儿分为两个组 ,各自再分为 (～ 4、～ 7、～ 1 0、～ 1 4 )四个年龄段作1 3 C -UBT。结果 :无症状儿童组Hp感染阳性率为 1 1 .1 % ,反复腹痛患儿组Hp感染阳性率为 2 5 .7% ,两组间有显著性差异 (P <0 .0 1 ) ;无症状儿童组四个年龄段Hp感染阳性率分别为 7%、9%、1 2 %、1 4 % ,且显示随着年龄的增长Hp感染阳性率递增 ,但无显著性差异 (P >0 .0 5 )。反复腹痛患儿组四个年龄段Hp感染阳性率分别为 2 2 %、2 7%、2 6 %、2 8% ,其与年龄无关。结论 :1 3 C -UBT是一种快速、简便、敏感性和特异性好、准确性高无创伤性的Hp诊断方法 ,有重要的临床诊断价值。

小剂量钙三醇对慢性肾衰竭继发性甲旁亢早期的疗效研究

目的 :研究小剂量口服罗盖全治疗慢性肾衰竭 (CRF)继发性甲旁亢 (SHPT)早期患者的疗效和副作用。方法 :将观察期间 (3～ 12个月 )血清全段甲状旁腺激素 (iPTH)浓度动态升高且高达正常值 3～ 5倍的 180名CRF患者随机分为A、B两组 ,A组予罗盖全 0 .12 5 μg/d ,B组予罗盖全 0 .2 5 μg/d口服 ,以血清iPTH浓度降至正常值2 .5倍即 16 0ng/L为观察终点 ;另将血清iPTH浓度高达正常值 5倍以上的 15 3例患者随机分为C、D两组 ,C组予罗盖全 0 .5 μg/d上午口服 ,D组以相同剂量于晚上 10h口服 ,以血清iPTH浓度降至正常值 3倍即 195ng/L为观察终点。以到达终点的例数和时间为指标判断疗效 ,分别比较A、B两组及C、D两组疗效和高钙血症等副作用。结果 :各组均取得良好疗效。B组有效率 90 .91% ,明显高于A组的 5 7.30 % (P <0 .0 1) ,B组到达终点时间 (8.6 6± 3.2 )个月 ,明显早于A组 (15 .2 4± 3.7)个月 (P <0 .0 1)。C、D两组疗效相近 ,有效率分别为 86 .89%和 84 .2 9% (P >0 .0 5 ) ,到达终点的时间分别为 (9.5 1± 3.1)个月和 (9.97± 2 .9)个月 (P >0 .0 5 )。各组均无发生血清iPTH浓度过低 (<130ng/L)。A、B两组极少发生高钙血症 ,发生率分别为 1.11%和 2 .2 2 % ;D组高钙血症发生率为 9.72 % 。

早期糖尿病心肌病患者血浆心钠素水平的变化及其临床意义

目的:探讨早期糖尿病心肌病(DC)患者心脏结构及功能与血浆心钠素(ANP)水平的关系。方法:将早期DC患者根据左心室质量指数(LVM I)分成左心室肥厚(LVH)组23例及无LVH组29例,并设立正常对照组50例。采用脉冲多谱勒超声心动图和放射免疫分析方法分别进行心脏结构、心功能和血浆ANP水平检测。结果:与正常对照组比较,无LVH组患者左心室舒张功能(E峰、A峰及E/A)明显受损,表现为A峰上升,E峰、E/A下降(P<0.01),左心房内径(LAD)扩大(P<0.01),血浆ANP明显升高(P<0.01);有LVH组比无LVH组E/A、LAD及血浆ANP改变更明显(P<0.01)。相关性分析及检验表明,血浆ANP与LAD及LVM I、A峰呈明显正相关(r值依次为0.78、0.74及0.65,P均<0.01);与E/A则有明显负性关系(r=-0.69,P<0.01)。结论:左心室舒张功能减退及心肌肥厚是糖尿病心肌病的早期表现,测定糖尿病患者血浆ANP质量浓度可作为判断早期糖尿病心肌病的参考指标。

三种基因检测分型方法在耐碳青霉烯抗生素肺炎克雷伯菌基因分型中的应用对比观察

目的比较限制性内切酶联合脉冲场凝胶电泳(PFGE)、多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)和肠杆菌基因间重复序列PCR(ERIC-PCR)在耐碳青霉烯抗生素肺炎克雷伯菌基因分型中的应用情况。方法 20株耐碳青霉烯类抗生素的肺炎克雷伯菌,分别采用PFGE、MLVA和ERIC-PCR法,对肺炎克雷伯菌基因进行扩增并分型,并用Bio Numerics软件测算各方法 Simpson差异指数(D值,D值越趋于1表示该方法分辨力越好)。结果20株菌株共分为18个PFGE型,其中2个带型包含2株菌,其余16个带型分别只包含1株菌,分别有两组两株菌具有相同的PFGE型别;17个MLVA型,其中3个型别分别包含2株菌,其余16个型别只包含1株菌,以差异位点≤2个位点作为构建MLVA群的标准,20株菌中构建出4个MLVA克隆群;14个ERIC型,其中中优势型、次优势型分别为5、3株,其余12个型别分别只包含1株菌。PFGE、MLVA和ERIC-PCR法对耐碳青霉烯抗生素的肺炎克雷伯菌的D值分别为0.989 5、0.984 2、0.931 6。结论 PFGE、MLVA和ERIC-PCR对耐碳青霉烯抗生素的肺炎克雷伯菌的分型效果均较好。

肺炎支原体培养和血清学检验在小儿支原体肺炎感染中的诊断价值差异

目的分析肺炎支原体培养和血清学检验在小儿支原体肺炎感染中的诊断价值差异。方法选取收治的100例支原体肺炎感染患儿,分别采用肺炎支原体培养和血清学检验,比较两种检测方法的阳性检出率及不同年龄组、不同发病时间组各检测方法的阳性检出情况的差异。结果肺炎支原体培养阳性86例(86.0%),血清学检验阳性84例(84.0%),两种检测方法的阳性检出率无明显差异(χ2=0.157,P=0.692)。1～6岁组肺炎支原体培养阳性检出率(91.9%)高于7～12岁组(76.3%,P<0.05),血清学检验阳性检出率(77.4%)低于7～12岁组(94.7%,P<0.05)。发病时间1～6d组肺炎支原体培养阳性检出率(93.2%)高于7～11d组(75.6%,P<0.05),血清学检验阳性检出率(78.0%)低于7～11d组(92.7%,P<0.05)。结论两组检验方法在小儿支原体肺炎感染中的阳性检出率皆较高,年龄较小、病程较短的患儿建议采用肺炎支原体培养诊断,年龄较大、病程较长的患儿建议采用血清学检验诊断。

比较不同基因类型新生儿地中海贫血基因携带者的血液学特征

地中海贫血是一种遗传性溶血性疾病，主要是由α、β珠蛋白生成障碍引起的。根据文献报道，地中海贫血可能会导致患儿智力发育受损，生长缓慢等一系列并发症。临床上目前使用较多的筛选地中海贫血的方法是通过定量检测血红蛋白及红细胞压积等指标。

血浆溶血磷脂酸水平预测脑血管痉挛的价值

目的探讨血浆溶血磷脂酸水平预测动脉瘤性蛛网膜下腔出血继发脑血管痉挛的价值,寻找判断有无脑血管痉挛及其严重程度的简易方法。方法动态监测40例动脉瘤性蛛网膜下腔出血患者血浆溶血磷脂酸浓度,分析其与病情严重程度、TCD检查结果的相关性。结果动脉瘤性蛛网膜下腔出血患者血浆溶血磷脂酸浓度随病情及脑血管痉挛加重而增高,与TCD检查结果表现出一定相关性。结论血浆溶血磷脂酸(LPA)水平可作为动脉瘤性蛛网膜下腔出血继发脑血管痉挛诊断和预后评估的一个重要的生物学指标。

红细胞分布宽度对乳腺癌患者总体生存期的预测价值

目的探讨术前红细胞分布宽度(RDW)对乳腺癌患者总体生存期的预测价值。方法回顾性分析280例浸润性乳腺癌患者的临床资料,收集患者术前RDW值。依据患者总体生存情况将患者分成生存组和非生存组,比较两组患者临床病理资料。通过受试者工作特征曲线确定RDW患者无病生存期和总体生存期的截点值,并根据截点值将入组患者分为低RDW组(RDW≤13.45%,188例)和高RDW组(RDW>13.45%,92例),比较两组患者5年生存率和临床病理因素。单因素分析评价各因素对预后生存的影响,并进行多因素Cox回归,筛选影响预后的独立因素,并进行生存分析。结果生存组与年龄、RDW、肿瘤大小、孕激素受体、淋巴转移及肿瘤临床分期有相关性(P<0.05)。治疗前RDW≤13.45%与RDW>13.45%的患者比较,高RDW组与肿瘤大小(P=0.000),阳性淋巴结转移(P=0.016)及肿瘤临床分期(TNM)晚期程度(P=0.001)有明显的相关性。高RDW组患者的无病生存率(P<0.001)及总体生存率(P<0.001)比低RDW组患者明显下降。Cox多元回归分析显示术前高RDW是不良无病生存期和总体生存期的独立危险因子,风险率分别为1.614(95%CI1.421~1.834,P<0.001)和1.507(95%CI1.309~1.735,P<0.001)。结论术前高RDW是影响乳腺癌患者预后的独立因素,乳腺癌患者术前RDW与无病生存期和总生存率有一定的相关性。

耐亚胺培南铜绿假单胞菌耐药特征及其耐药机制的研究

目的探讨耐亚胺培南铜绿假单胞菌耐药特征及其耐药机制。方法收集2016年1月至2017年12月东莞地区2家医院110株耐亚胺培南铜绿假单胞菌,采用VITEK2系统分析临床菌株耐药性,脉冲场凝胶电泳(PFGE)行同源性分析,PCR法检测金属β?内酰胺酶相关基因以及oprD基因,并对阳性株进行测序;对oprD基因无中断突变株,利用qRT?PCR检测其mRNA表达情况。结果 110株耐亚胺培南铜绿单胞菌PFGE分析结果显示高度克隆多样性。PCR法检测出18株金属β?内酰胺酶基因阳性的菌株,主要类型是:IMP?25,VIM?2,SIM?2。PCR法检测出107株阳性菌株,测序结果表明有意突变率高达93.46%(100/107),类型包括点突变,缺失突变,插入突变以及提早终止突变。7株oprD mRNA表达量均降低。结论本实验进一步证实了oprD基因缺失,发生广泛有意突变,mRNA表达减少以及金属β?内酰胺酶基因产生是铜绿假单胞菌对亚胺培南耐药的主要机制。

中性粒细胞和淋巴细胞比值对乳腺癌患者总体生存期的预测价值

目的探讨术前中性粒细胞和淋巴细胞比值(NLR)对乳腺癌患者总体生存期的价值。方法回顾性分析2010~2012年于东莞市人民医院乳腺科诊断为浸润性乳腺癌的280例患者的临床资料,包括手术前的NLR,临床病理资料和预后资料。根据患者术前外周静脉血NLR分为2组:172例低NLR患者(NLR≤2.63)和108例高NLR患者(NLR>2.63)。通过卡方检验和Wilcoxon秩和检验分析两组之间不同临床病理资料的差异。通过Kaplan Meier生存分析及Cox比例风险回归分析NLR对存活的影响。结果高NLR组与年龄(P=0.041)、肿瘤大小(P=0.006)、阳性淋巴结转移(P=0.027)、肿瘤临床分期晚期程度(P=0.008)及表皮生长因子受体-2(P=0.003)有相关性。相比低NLR组患者,高NLR组患者的无病生存期及总体生存期明显下降(P<0.001)。此外,Cox多元回归分析显示术前高NLR是不良无病生存期和总体生存期的独立危险因子,风险率分别为1.600(95%CI:1.370~1.868,P<0.001)和1.497(95%CI:1.262~1.777,P<0.001)。结论术前高NLR是女性乳腺癌患者生存预后的一个独立因素,女性乳腺癌患者其术前NLR与无病生存期和总体生存期有一定的相关性。

东莞地区耐亚胺培南铜绿假单胞菌oprD基因分析

目的:分析东莞地区oprD基因突变对耐亚胺培南铜绿假单胞菌的作用。方法:收集2016年至2017年东莞地区2家医院的110株耐亚胺培南铜绿假单胞菌临床分离株,PCR法扩增基因oprD并测序分析其序列突变类型。结果:110株确认为亚胺培南耐药菌株,其中3株oprD基因PCR扩增阴性。余107株阳性菌株进行oprD基因测序发现其中7株无突变,84株有框码移位(其中有8株发现携带插入序列ISPpu21、IS1394、ISPpu29以及ISPst2),16株有终止密码子提前出现(形成1个位置提前的新终止密码子进而引起其肽链异常),基因突变率高达90.91%。结论:广东东莞地区铜绿假单胞菌oprD基因突变导致其氨基酸改变或(和)移码突变,影响oprD与IMP结合是本组铜绿假单胞菌对亚胺培南耐药的主要机制。