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CRISPR/Cas系统对金黄色葡萄球菌耐药及毒力基因的影响
1
作者
谢龙飞
肖丹瑜
+3 位作者
常依
张旭财
李小申
熊文广
《华南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期179-186,共8页
【目的】了解金黄色葡萄球菌(以下简称“金葡菌”)Staphylococcus aureus中成簇的规律间隔短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)的分布情况,分析其对抗生素耐药基因和毒力基因水平转移的...
【目的】了解金黄色葡萄球菌(以下简称“金葡菌”)Staphylococcus aureus中成簇的规律间隔短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)的分布情况,分析其对抗生素耐药基因和毒力基因水平转移的影响。【方法】从公共数据库获取组装完整的金葡菌基因组575个,利用生物信息学方法,统计CRISPR结构的携带情况,菌株多位点序列分型(Multi-locus sequence typing,MLST)型别分布和菌株耐药基因、毒力基因的分布情况;对CRISPR结构阳性(CRISPR+)和CRISPR结构阴性(CRISPR-)的金葡菌耐药基因和毒力基因携带数目进行差异显著性分析。同时对实验室60株金葡菌二代测序数据进行分析,验证公共数据库分析结果。对实验室60株金葡菌中原噬菌体、接合质粒的携带情况进行统计,讨论CRISPR结构对菌株原噬菌体和接合质粒的影响。【结果】基因组组装完整的575株金葡菌中,有62株携带CRISPR结构(CRISPR+),513株不携带CRISPR结构(CRISPR-);CRISPR+金葡球菌携带耐药基因、毒力基因的数目显著小于CRISPR-金葡菌。实验室60株金葡菌中,有14株为CRISPR+,46株为CRISPR-;CRISPR+金葡菌携带更少的耐药基因和毒力基因,与公共数据库分析结果一致。对原噬菌体和接合质粒的分析结果显示,CRISPR-菌株携带更多的原噬菌体序列,与CRISPR+菌株之间差异显著(P<0.05);接合质粒方面,CRISPR-和CRISPR+菌株无显著性差异。【结论】CRISPR结构可能限制了金葡菌中耐药基因和毒力基因的水平转移,CRISPR-菌株更容易受到噬菌体和可移动质粒的干扰。本研究为进一步研究金葡菌耐药基因和毒力基因的传播提供了参考。
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关键词
金黄色葡萄球菌
CRISPR/Cas系统
耐药基因
毒力基因
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职称材料
急性热应激对麻鸡免疫功能的影响
被引量:
3
2
作者
唐陆平
李伟豪
+4 位作者
尤奕鑫
曾森
张旭财
何永明
陈云
《动物医学进展》
北大核心
2020年第6期69-73,共5页
研究急性热应激对麻鸡免疫机能的影响,将30只28日龄麻鸡随机分成5组,即对照组、热应激3 h组、热应激6 h组、热应激9 h组和热应激12 h组,每组6只。将麻鸡在37℃±1℃条件下分别处理3、6、9、12 h,对照组麻鸡于室温条件下常规饲养。...
研究急性热应激对麻鸡免疫机能的影响,将30只28日龄麻鸡随机分成5组,即对照组、热应激3 h组、热应激6 h组、热应激9 h组和热应激12 h组,每组6只。将麻鸡在37℃±1℃条件下分别处理3、6、9、12 h,对照组麻鸡于室温条件下常规饲养。应激试验后取脾脏和法氏囊制成石蜡切片,分别进行HE染色和γ干扰素(IFN-γ)的免疫组化检测,并通过蛋白免疫印迹的方法检测麻鸡脾脏中HSP70、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、NF-κB p65的蛋白含量水平变化。37℃热应激条件下3 h^12 h麻鸡脾脏无明显的组织学变化;法氏囊中的淋巴滤泡从热应激3 h后开始增大,淋巴滤泡之间排列更加紧密,淋巴细胞增多;脾脏中IFN-α和IFN-β在热应激9 h后显著升高(P<0.05),IFN-γ在6 h时显著升高(P<0.05),9 h后恢复正常值。HSP70在应激3 h出现短暂下降后持续升高,而NF-κB p65在热应激3 h时出现短暂的波动后持续下降,显著低于对照组(P<0.05)。结果表明,37℃条件下热应激12 h内能够提高麻鸡机体免疫能力,有利于麻鸡生长发育。
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关键词
热应激
热休克蛋白70
干扰素
NF-ΚB
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职称材料
广东肇庆地区鸭疫里氏杆菌耐药性和毒力基因分析及ERIC-PCR分型研究
被引量:
5
3
作者
张旭财
李燕红
+4 位作者
陆毅兴
常依
谢龙飞
曾振灵
熊文广
《中国动物传染病学报》
CAS
北大核心
2022年第4期39-47,共9页
为了解广东省肇庆市鸭疫里氏杆菌的流行和耐药现状,本试验对当地4个养鸭场疑似传染性浆膜炎的病鸭进行细菌分离纯化、PCR鉴定,并对分离菌株进行了药敏试验、耐药基因、毒力基因检测及ERIC-PCR分型试验。药敏结果表明,14株鸭疫里氏杆菌...
为了解广东省肇庆市鸭疫里氏杆菌的流行和耐药现状,本试验对当地4个养鸭场疑似传染性浆膜炎的病鸭进行细菌分离纯化、PCR鉴定,并对分离菌株进行了药敏试验、耐药基因、毒力基因检测及ERIC-PCR分型试验。药敏结果表明,14株鸭疫里氏杆菌对新霉素、安普霉素、恩诺沙星、替加环素、复方新诺明高度耐药,耐药率均为100%;对阿莫西林、头孢他啶和环丙沙星敏感度较高,敏感率分别为100%、100%和92.86%。耐药基因检测结果显示,所有分离菌均携带tet(X)和floR耐药基因,tet(B)和su l1耐药基因的检出率分别为64.29%和50%,其余9种耐药基因(aac(6′)-Ⅰb、aph(3')-Ⅱ、bla_(SHV)、bla_(DHA)、qnrA、qnr B、tet(A)、tet(C)、sul2)未被检出。毒力基因检测结果显示,AS87_04050、luxE和wza毒力基因的检出率较高,分别为100%、92.86%和100%,而TbdR 1均未被检出。ERIC-PCR分型试验结果表明,14株鸭疫里氏杆菌均成功分型,相似性在90%时,可分为7个基因型。本实验为广东省肇庆市鸭疫里氏杆菌病的治疗措施提供理论依据。
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关键词
鸭疫里氏杆菌
耐药性
耐药基因
毒力基因
ERIC-PCR
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职称材料
题名
CRISPR/Cas系统对金黄色葡萄球菌耐药及毒力基因的影响
1
作者
谢龙飞
肖丹瑜
常依
张旭财
李小申
熊文广
机构
广东省兽药研制与安全评价重点实验室/国家兽药安全评价(环境评估)实验室/国家兽医微生物耐药性风险评估实验室/华南农业大学兽医学院/岭南现代农业科学与技术广东省实验室
出处
《华南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期179-186,共8页
基金
广东省基础与应用基础研究基金(2020A1515010917)
广东省珠江人才计划本土创新科研团队项目(2019BT02N054)。
文摘
【目的】了解金黄色葡萄球菌(以下简称“金葡菌”)Staphylococcus aureus中成簇的规律间隔短回文重复序列(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats,CRISPR)的分布情况,分析其对抗生素耐药基因和毒力基因水平转移的影响。【方法】从公共数据库获取组装完整的金葡菌基因组575个,利用生物信息学方法,统计CRISPR结构的携带情况,菌株多位点序列分型(Multi-locus sequence typing,MLST)型别分布和菌株耐药基因、毒力基因的分布情况;对CRISPR结构阳性(CRISPR+)和CRISPR结构阴性(CRISPR-)的金葡菌耐药基因和毒力基因携带数目进行差异显著性分析。同时对实验室60株金葡菌二代测序数据进行分析,验证公共数据库分析结果。对实验室60株金葡菌中原噬菌体、接合质粒的携带情况进行统计,讨论CRISPR结构对菌株原噬菌体和接合质粒的影响。【结果】基因组组装完整的575株金葡菌中,有62株携带CRISPR结构(CRISPR+),513株不携带CRISPR结构(CRISPR-);CRISPR+金葡球菌携带耐药基因、毒力基因的数目显著小于CRISPR-金葡菌。实验室60株金葡菌中,有14株为CRISPR+,46株为CRISPR-;CRISPR+金葡菌携带更少的耐药基因和毒力基因,与公共数据库分析结果一致。对原噬菌体和接合质粒的分析结果显示,CRISPR-菌株携带更多的原噬菌体序列,与CRISPR+菌株之间差异显著(P<0.05);接合质粒方面,CRISPR-和CRISPR+菌株无显著性差异。【结论】CRISPR结构可能限制了金葡菌中耐药基因和毒力基因的水平转移,CRISPR-菌株更容易受到噬菌体和可移动质粒的干扰。本研究为进一步研究金葡菌耐药基因和毒力基因的传播提供了参考。
关键词
金黄色葡萄球菌
CRISPR/Cas系统
耐药基因
毒力基因
Keywords
Staphylococcus aureus
CRISPR/Cas system
Drug resistance gene
Virulence gene
分类号
S852 [农业科学—基础兽医学]
S859 [农业科学—临床兽医学]
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职称材料
题名
急性热应激对麻鸡免疫功能的影响
被引量:
3
2
作者
唐陆平
李伟豪
尤奕鑫
曾森
张旭财
何永明
陈云
机构
佛山科学技术学院兽医系
出处
《动物医学进展》
北大核心
2020年第6期69-73,共5页
基金
广东省自然科学基金项目(2017A030310607)。
文摘
研究急性热应激对麻鸡免疫机能的影响,将30只28日龄麻鸡随机分成5组,即对照组、热应激3 h组、热应激6 h组、热应激9 h组和热应激12 h组,每组6只。将麻鸡在37℃±1℃条件下分别处理3、6、9、12 h,对照组麻鸡于室温条件下常规饲养。应激试验后取脾脏和法氏囊制成石蜡切片,分别进行HE染色和γ干扰素(IFN-γ)的免疫组化检测,并通过蛋白免疫印迹的方法检测麻鸡脾脏中HSP70、IFN-α、IFN-β、IFN-γ、NF-κB p65的蛋白含量水平变化。37℃热应激条件下3 h^12 h麻鸡脾脏无明显的组织学变化;法氏囊中的淋巴滤泡从热应激3 h后开始增大,淋巴滤泡之间排列更加紧密,淋巴细胞增多;脾脏中IFN-α和IFN-β在热应激9 h后显著升高(P<0.05),IFN-γ在6 h时显著升高(P<0.05),9 h后恢复正常值。HSP70在应激3 h出现短暂下降后持续升高,而NF-κB p65在热应激3 h时出现短暂的波动后持续下降,显著低于对照组(P<0.05)。结果表明,37℃条件下热应激12 h内能够提高麻鸡机体免疫能力,有利于麻鸡生长发育。
关键词
热应激
热休克蛋白70
干扰素
NF-ΚB
Keywords
heat stress
HSP70
interferon
NF-κB
分类号
S852.3 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
广东肇庆地区鸭疫里氏杆菌耐药性和毒力基因分析及ERIC-PCR分型研究
被引量:
5
3
作者
张旭财
李燕红
陆毅兴
常依
谢龙飞
曾振灵
熊文广
机构
广东省兽药研制与安全评价重点实验室
国家兽药安全评价(环境评估)实验室(华南农大)
国家兽医微生物耐药性风险评估实验室
岭南现代农业科学与技术广东省实验室
出处
《中国动物传染病学报》
CAS
北大核心
2022年第4期39-47,共9页
基金
广州市科技计划项目(202102020039)。
文摘
为了解广东省肇庆市鸭疫里氏杆菌的流行和耐药现状,本试验对当地4个养鸭场疑似传染性浆膜炎的病鸭进行细菌分离纯化、PCR鉴定,并对分离菌株进行了药敏试验、耐药基因、毒力基因检测及ERIC-PCR分型试验。药敏结果表明,14株鸭疫里氏杆菌对新霉素、安普霉素、恩诺沙星、替加环素、复方新诺明高度耐药,耐药率均为100%;对阿莫西林、头孢他啶和环丙沙星敏感度较高,敏感率分别为100%、100%和92.86%。耐药基因检测结果显示,所有分离菌均携带tet(X)和floR耐药基因,tet(B)和su l1耐药基因的检出率分别为64.29%和50%,其余9种耐药基因(aac(6′)-Ⅰb、aph(3')-Ⅱ、bla_(SHV)、bla_(DHA)、qnrA、qnr B、tet(A)、tet(C)、sul2)未被检出。毒力基因检测结果显示,AS87_04050、luxE和wza毒力基因的检出率较高,分别为100%、92.86%和100%,而TbdR 1均未被检出。ERIC-PCR分型试验结果表明,14株鸭疫里氏杆菌均成功分型,相似性在90%时,可分为7个基因型。本实验为广东省肇庆市鸭疫里氏杆菌病的治疗措施提供理论依据。
关键词
鸭疫里氏杆菌
耐药性
耐药基因
毒力基因
ERIC-PCR
Keywords
Riemerella anatipestifer
drug resistance
resistance genes
virulence genes
ERIC-PCR
分类号
S852.612 [农业科学—基础兽医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
CRISPR/Cas系统对金黄色葡萄球菌耐药及毒力基因的影响
谢龙飞
肖丹瑜
常依
张旭财
李小申
熊文广
《华南农业大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
2
急性热应激对麻鸡免疫功能的影响
唐陆平
李伟豪
尤奕鑫
曾森
张旭财
何永明
陈云
《动物医学进展》
北大核心
2020
3
下载PDF
职称材料
3
广东肇庆地区鸭疫里氏杆菌耐药性和毒力基因分析及ERIC-PCR分型研究
张旭财
李燕红
陆毅兴
常依
谢龙飞
曾振灵
熊文广
《中国动物传染病学报》
CAS
北大核心
2022
5
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职称材料
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