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水稻分蘖期叶片淀粉和蔗糖代谢途径的转录组动态分析
被引量:
1
1
作者
谢威
刘天奇
+5 位作者
张雪晴
张时煜
高红秀
金正勋
张忠臣
姜振峰
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1623-1637,共15页
为了探索水稻分蘖期叶片中生育进程相关代谢途径的转录响应情况,分别在分蘖期7 d、14 d和21 d收获水稻品种‘五优稻4号’(‘WYD4’)叶片,并进行动态转录组分析。结果表明,在水稻分蘖期共有12815个差异表达基因,通过GO分析显示这些基因...
为了探索水稻分蘖期叶片中生育进程相关代谢途径的转录响应情况,分别在分蘖期7 d、14 d和21 d收获水稻品种‘五优稻4号’(‘WYD4’)叶片,并进行动态转录组分析。结果表明,在水稻分蘖期共有12815个差异表达基因,通过GO分析显示这些基因主要集中在细胞组分方面,KEGG分析表明淀粉与蔗糖代谢途径在整个分蘖期生育进程内有差异表达基因(DEGs)显著富集,并有6个淀粉与蔗糖代谢途径相关的差异表达基因在整个分蘖期显著差异表达。同时,预测的转录因子SSⅠ(LOC_Os06g06560)在分蘖前期差异表达倍数达到9.7倍,并与64个预测的蛋白互作。这表明淀粉与蔗糖途径关键基因在不同时间点的应答是有差异的,为水稻分蘖形成和群体构建提供了时间上的能量来源,也为水稻栽培精确调控提供了转录组学指导。
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关键词
水稻
分蘖期
淀粉
可溶性淀粉合酶Ⅰ
转录组
下载PDF
职称材料
题名
水稻分蘖期叶片淀粉和蔗糖代谢途径的转录组动态分析
被引量:
1
1
作者
谢威
刘天奇
张雪晴
张时煜
高红秀
金正勋
张忠臣
姜振峰
机构
东北农业大学农学院
出处
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第11期1623-1637,共15页
基金
国家重点研发计划(2016YFD0300604-4)。
文摘
为了探索水稻分蘖期叶片中生育进程相关代谢途径的转录响应情况,分别在分蘖期7 d、14 d和21 d收获水稻品种‘五优稻4号’(‘WYD4’)叶片,并进行动态转录组分析。结果表明,在水稻分蘖期共有12815个差异表达基因,通过GO分析显示这些基因主要集中在细胞组分方面,KEGG分析表明淀粉与蔗糖代谢途径在整个分蘖期生育进程内有差异表达基因(DEGs)显著富集,并有6个淀粉与蔗糖代谢途径相关的差异表达基因在整个分蘖期显著差异表达。同时,预测的转录因子SSⅠ(LOC_Os06g06560)在分蘖前期差异表达倍数达到9.7倍,并与64个预测的蛋白互作。这表明淀粉与蔗糖途径关键基因在不同时间点的应答是有差异的,为水稻分蘖形成和群体构建提供了时间上的能量来源,也为水稻栽培精确调控提供了转录组学指导。
关键词
水稻
分蘖期
淀粉
可溶性淀粉合酶Ⅰ
转录组
Keywords
Rice
Tillering stage
Starch
Soluble starch synthaseⅠ
Transcriptome
分类号
S511.22 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻分蘖期叶片淀粉和蔗糖代谢途径的转录组动态分析
谢威
刘天奇
张雪晴
张时煜
高红秀
金正勋
张忠臣
姜振峰
《西北农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
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