【目的】探究中华鳖(Pelodiscus sinensis)甘露糖受体C2(Mannose receptor C type 2)基因PsMRC2在应答嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染中的免疫功能,为中华鳖抗细菌感染的免疫机制研究提供理论依据。【方法】通过PCR克隆PsMRC2...【目的】探究中华鳖(Pelodiscus sinensis)甘露糖受体C2(Mannose receptor C type 2)基因PsMRC2在应答嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染中的免疫功能,为中华鳖抗细菌感染的免疫机制研究提供理论依据。【方法】通过PCR克隆PsMRC2基因开放阅读框(ORF)序列,对其进行生物信息学和系统发育进化分析,并以实时荧光定量PCR检测PsMRC2基因在中华鳖各组织中表达谱及嗜水气单胞菌感染后的时序表达。【结果】PsMRC2基因ORF序列为4086 bp,共编码1361个氨基酸残基。PsMRC2蛋白结构域包括1个纤连蛋白Ⅱ型(FNⅡ)结构域(第61~109位氨基酸)、8个串联的C型凝集素(CLECT)结构域(第116~1276位氨基酸)、1个跨膜结构域(第1295~1317位氨基酸)。通过SOMPA预测得到PsMRC2蛋白二级结构包含706个无规则卷曲(占51.87%)、302个延伸链(占22.19%)、289个α-螺旋(占21.23%)和64个β-转角(占4.70%);SWISS-MODEL预测PsMRC2蛋白三级结构匹配的模板与PsMRC2氨基酸序列相似性为90%,预测结果可信。基于PsMRC2蛋白氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树显示,中华鳖与龟类的亲缘关系最近,而与鱼类相距较远。PsMRC2基因在中华鳖的心脏、肝脏、脾脏、肾脏、肠道、肌肉、脑和肺脏组织中均有表达,以脾脏组织中的相对表达量最高。感染嗜水气单胞菌后,PsMRC2基因在中华鳖肝脏、脾脏、肾脏和肠道组织中的相对表达量均呈上调趋势。【结论】PsMRC2基因在进化上较保守,广泛表达于中华鳖各组织中,参与中华鳖抗细菌感染的免疫应答过程。展开更多
文摘【目的】探究中华鳖(Pelodiscus sinensis)甘露糖受体C2(Mannose receptor C type 2)基因PsMRC2在应答嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila)感染中的免疫功能,为中华鳖抗细菌感染的免疫机制研究提供理论依据。【方法】通过PCR克隆PsMRC2基因开放阅读框(ORF)序列,对其进行生物信息学和系统发育进化分析,并以实时荧光定量PCR检测PsMRC2基因在中华鳖各组织中表达谱及嗜水气单胞菌感染后的时序表达。【结果】PsMRC2基因ORF序列为4086 bp,共编码1361个氨基酸残基。PsMRC2蛋白结构域包括1个纤连蛋白Ⅱ型(FNⅡ)结构域(第61~109位氨基酸)、8个串联的C型凝集素(CLECT)结构域(第116~1276位氨基酸)、1个跨膜结构域(第1295~1317位氨基酸)。通过SOMPA预测得到PsMRC2蛋白二级结构包含706个无规则卷曲(占51.87%)、302个延伸链(占22.19%)、289个α-螺旋(占21.23%)和64个β-转角(占4.70%);SWISS-MODEL预测PsMRC2蛋白三级结构匹配的模板与PsMRC2氨基酸序列相似性为90%,预测结果可信。基于PsMRC2蛋白氨基酸序列相似性构建的系统发育进化树显示,中华鳖与龟类的亲缘关系最近,而与鱼类相距较远。PsMRC2基因在中华鳖的心脏、肝脏、脾脏、肾脏、肠道、肌肉、脑和肺脏组织中均有表达,以脾脏组织中的相对表达量最高。感染嗜水气单胞菌后,PsMRC2基因在中华鳖肝脏、脾脏、肾脏和肠道组织中的相对表达量均呈上调趋势。【结论】PsMRC2基因在进化上较保守,广泛表达于中华鳖各组织中,参与中华鳖抗细菌感染的免疫应答过程。
