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2个分离自新疆不同枣树样本的花叶伴随病毒基因组测定
1
作者
单佳祁
刘保军
+3 位作者
张李娅
王澍
李克梅
白剑宇
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期108-117,142,共11页
近几年来,新疆南部红枣各种植区大面积发生疑似枣树花叶伴随病毒病症状的病害,造成枣树叶片出现花叶卷曲,枣果畸形失去商品价值,甚至大量落果,造成绝收绝产。对于引起此病害的病原现在尚未完全明确。本文从新疆南部红枣种植区采集病叶,...
近几年来,新疆南部红枣各种植区大面积发生疑似枣树花叶伴随病毒病症状的病害,造成枣树叶片出现花叶卷曲,枣果畸形失去商品价值,甚至大量落果,造成绝收绝产。对于引起此病害的病原现在尚未完全明确。本文从新疆南部红枣种植区采集病叶,通过高通量测序证实病叶中存在枣树花叶伴随病毒(jujube mosaic-associated virus,JuMaV),将JuMaV的2个分离株AKS和YPH的全序列(登录号分别为MW892537和OL739568),与已发表的枣树枣花叶伴随病毒(JuMaV-Z6)的全序列(登录号:KX852476.1)进行了比较,结果显示,JuMaV-AKS和JuMaV-YPH与JuMaV-Z6的核苷酸一致性分别为99.54%和95.93%,氨基酸一致性分别为100%和98.48%。JuMaV-AKS和JuMaV-YPH与JuMaV-Z6在反转录酶(RT)和RNA酶H(RNase H)编码区有较大差异,表明枣树花叶伴随病毒在新疆的红枣上正在发生变异,但还未成为新的种,暂时统一称为枣树花叶伴随病毒XJ分离株(JuMaVXJ)。上述结果为新疆红枣花叶病病原的确认并为该病害的精准防控奠定了基础。
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关键词
高通量测序
枣树
枣树花叶伴随病毒
全核苷酸序列
下载PDF
职称材料
T-DNA插入筛选棉花枯萎病菌致病力减弱突变体及其侧翼序列分析
2
作者
何丹
苏飞鸿
+3 位作者
张李娅
宋东博
夏红飞
顾爱星
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1732-1740,共9页
【背景】新疆是棉花生产的主要地区,枯萎病的发生严重影响着棉花的产量。目前,关于棉花枯萎病原菌的发病机制尚无详细报道。【目的】在尖孢镰刀菌突变体库中筛选出致病力降低的突变体并分析其致病基因,以阐明棉花枯萎病菌的致病分子机...
【背景】新疆是棉花生产的主要地区,枯萎病的发生严重影响着棉花的产量。目前,关于棉花枯萎病原菌的发病机制尚无详细报道。【目的】在尖孢镰刀菌突变体库中筛选出致病力降低的突变体并分析其致病基因,以阐明棉花枯萎病菌的致病分子机制。【方法】在前期已建立的枯萎病菌突变体库的基础上,对随机挑选的136份突变体致病力进行鉴定,并对其表型和侧翼序列进行分析。【结果】获得5个致病能力明显降低的突变株,突变体B-18的形态与野生型有差异且菌落颜色变为紫色;5个突变体生长速率均降低,其中B-18下降最明显;5个突变体产孢数量均降低。扩增5个突变体,测序后经BLAST比对分析,确定了T-DNA在枯萎病菌基因组的分布情况。【结论】对筛选出的5个致病力缺陷的突变体进行分析并找到致病基因,为研究棉花致病基因的功能和克隆提供了坚实的理论基础。
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关键词
棉花
尖孢镰刀菌
T-DNA插入突变体
高效热不对称交错PCR
致病力
原文传递
吐鲁番葡萄病毒病的发生情况及病原鉴定
3
作者
王澍
刘保军
+3 位作者
张李娅
单佳祁
白剑宇
李克梅
《植物检疫》
2024年第3期40-46,共7页
为明确吐鲁番葡萄病毒病发生情况及感染病毒种类,对吐鲁番葡萄种植区的葡萄病毒侵染情况进行调查,依据高通量测序结果,基于田间调查结合RT-PCR技术对采集的疑似葡萄病毒样本进行检测。结果表明,吐鲁番葡萄病毒病的症状一般在6-7月份左...
为明确吐鲁番葡萄病毒病发生情况及感染病毒种类,对吐鲁番葡萄种植区的葡萄病毒侵染情况进行调查,依据高通量测序结果,基于田间调查结合RT-PCR技术对采集的疑似葡萄病毒样本进行检测。结果表明,吐鲁番葡萄病毒病的症状一般在6-7月份左右出现;采集的183份样品中共检测到5种病毒,分别为葡萄克孜尔萨帕克病毒(GKSV)、葡萄卷叶相关病毒4(GLRaV-4)、葡萄浆果内坏死病毒(GINV)、葡萄蚕豆萎蔫病毒(GFabV)、沙地葡萄茎痘相关病毒(GRSPaV),总检出率分别为8.20%、30.60%、18.58%、10.92%、25.68%,其中,GLRaV-4检出率为最高;葡萄病毒复合侵染发生普遍,有两种或3种复合侵染类型,总检出率分别为27.32%、8.74%。对吐鲁番葡萄病毒病进行调查与鉴定,明确了葡萄病毒种类,掌握了不同葡萄种植区葡萄病毒的发生现状及病毒携带情况,为吐鲁番葡萄病毒病的早期监测和防控提供理论指导。
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关键词
葡萄
病毒病
RT-PCR检测
序列分析
原文传递
题名
2个分离自新疆不同枣树样本的花叶伴随病毒基因组测定
1
作者
单佳祁
刘保军
张李娅
王澍
李克梅
白剑宇
机构
新疆农业大学农学院
新疆林业科学院经济林研究所
出处
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期108-117,142,共11页
基金
国家林业和草原局林业科技专项(65000022P00789110010X)。
文摘
近几年来,新疆南部红枣各种植区大面积发生疑似枣树花叶伴随病毒病症状的病害,造成枣树叶片出现花叶卷曲,枣果畸形失去商品价值,甚至大量落果,造成绝收绝产。对于引起此病害的病原现在尚未完全明确。本文从新疆南部红枣种植区采集病叶,通过高通量测序证实病叶中存在枣树花叶伴随病毒(jujube mosaic-associated virus,JuMaV),将JuMaV的2个分离株AKS和YPH的全序列(登录号分别为MW892537和OL739568),与已发表的枣树枣花叶伴随病毒(JuMaV-Z6)的全序列(登录号:KX852476.1)进行了比较,结果显示,JuMaV-AKS和JuMaV-YPH与JuMaV-Z6的核苷酸一致性分别为99.54%和95.93%,氨基酸一致性分别为100%和98.48%。JuMaV-AKS和JuMaV-YPH与JuMaV-Z6在反转录酶(RT)和RNA酶H(RNase H)编码区有较大差异,表明枣树花叶伴随病毒在新疆的红枣上正在发生变异,但还未成为新的种,暂时统一称为枣树花叶伴随病毒XJ分离株(JuMaVXJ)。上述结果为新疆红枣花叶病病原的确认并为该病害的精准防控奠定了基础。
关键词
高通量测序
枣树
枣树花叶伴随病毒
全核苷酸序列
Keywords
high-throughput sequencing
jujube
jujube mosaic-associated virus
complete nucleotide sequence
分类号
S665.1 [农业科学—果树学]
S436.65 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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职称材料
题名
T-DNA插入筛选棉花枯萎病菌致病力减弱突变体及其侧翼序列分析
2
作者
何丹
苏飞鸿
张李娅
宋东博
夏红飞
顾爱星
机构
新疆农业大学农学院
农林有害生物监测与安全防控重点实验室
新疆农业大学农学院棉花教育部工程研究中心
出处
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第5期1732-1740,共9页
基金
新疆维吾尔自治区科技厅自然科学基金(2022D01A188)
新疆棉花产业技术体系(XJARS-03)。
文摘
【背景】新疆是棉花生产的主要地区,枯萎病的发生严重影响着棉花的产量。目前,关于棉花枯萎病原菌的发病机制尚无详细报道。【目的】在尖孢镰刀菌突变体库中筛选出致病力降低的突变体并分析其致病基因,以阐明棉花枯萎病菌的致病分子机制。【方法】在前期已建立的枯萎病菌突变体库的基础上,对随机挑选的136份突变体致病力进行鉴定,并对其表型和侧翼序列进行分析。【结果】获得5个致病能力明显降低的突变株,突变体B-18的形态与野生型有差异且菌落颜色变为紫色;5个突变体生长速率均降低,其中B-18下降最明显;5个突变体产孢数量均降低。扩增5个突变体,测序后经BLAST比对分析,确定了T-DNA在枯萎病菌基因组的分布情况。【结论】对筛选出的5个致病力缺陷的突变体进行分析并找到致病基因,为研究棉花致病基因的功能和克隆提供了坚实的理论基础。
关键词
棉花
尖孢镰刀菌
T-DNA插入突变体
高效热不对称交错PCR
致病力
Keywords
cotton
Fusarium oxysporum
T-DNA insertion mutants
hi TAIL-PCR
pathogenicity
分类号
S435.621 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
原文传递
题名
吐鲁番葡萄病毒病的发生情况及病原鉴定
3
作者
王澍
刘保军
张李娅
单佳祁
白剑宇
李克梅
机构
新疆农业大学农学院
新疆林科院经济林研究所
出处
《植物检疫》
2024年第3期40-46,共7页
基金
国家林业和草原局林业科技专项项目(65000022P00789110010X)。
文摘
为明确吐鲁番葡萄病毒病发生情况及感染病毒种类,对吐鲁番葡萄种植区的葡萄病毒侵染情况进行调查,依据高通量测序结果,基于田间调查结合RT-PCR技术对采集的疑似葡萄病毒样本进行检测。结果表明,吐鲁番葡萄病毒病的症状一般在6-7月份左右出现;采集的183份样品中共检测到5种病毒,分别为葡萄克孜尔萨帕克病毒(GKSV)、葡萄卷叶相关病毒4(GLRaV-4)、葡萄浆果内坏死病毒(GINV)、葡萄蚕豆萎蔫病毒(GFabV)、沙地葡萄茎痘相关病毒(GRSPaV),总检出率分别为8.20%、30.60%、18.58%、10.92%、25.68%,其中,GLRaV-4检出率为最高;葡萄病毒复合侵染发生普遍,有两种或3种复合侵染类型,总检出率分别为27.32%、8.74%。对吐鲁番葡萄病毒病进行调查与鉴定,明确了葡萄病毒种类,掌握了不同葡萄种植区葡萄病毒的发生现状及病毒携带情况,为吐鲁番葡萄病毒病的早期监测和防控提供理论指导。
关键词
葡萄
病毒病
RT-PCR检测
序列分析
Keywords
grape
viral disease
RT-PCR detection
sequence analysis
分类号
S436 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2个分离自新疆不同枣树样本的花叶伴随病毒基因组测定
单佳祁
刘保军
张李娅
王澍
李克梅
白剑宇
《植物保护》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
T-DNA插入筛选棉花枯萎病菌致病力减弱突变体及其侧翼序列分析
何丹
苏飞鸿
张李娅
宋东博
夏红飞
顾爱星
《微生物学通报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
原文传递
3
吐鲁番葡萄病毒病的发生情况及病原鉴定
王澍
刘保军
张李娅
单佳祁
白剑宇
李克梅
《植物检疫》
2024
0
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