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水稻ECT基因家族的全基因组研究
被引量:
1
1
作者
宁德正
庄可卿
+5 位作者
张巧玲
李华
张婉桐
张桁源
胡颂平
卫海滨
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第7期919-925,共7页
真核生物mRNA转录后修饰可调控许多基因的遗传信息,植物m^(6)A甲基化研究正成为关注的新热点。m^(6)A结合蛋白(m^(6)A readers)调节m^(6)A修饰的特异性,通常具有YTH(YT521-B homology)结构域,在拟南芥中被命名为ECT结构域(evolutionaril...
真核生物mRNA转录后修饰可调控许多基因的遗传信息,植物m^(6)A甲基化研究正成为关注的新热点。m^(6)A结合蛋白(m^(6)A readers)调节m^(6)A修饰的特异性,通常具有YTH(YT521-B homology)结构域,在拟南芥中被命名为ECT结构域(evolutionarily conserved C-terminal region ECT domain)。目前ECT基因已在拟南芥和水稻等植物中检测到,但该基因家族在水稻中的成员及生物学功能还缺乏研究。本研究通过水稻ECT基因家族的全基因组分析,鉴定出12个OsECT基因,具有1个保守的基序,多位于蛋白质氨基酸序列C-端。共线性分析表明,在水稻基因组内OsECT-c与OsECT-e发生了重复事件,在物种间ECT同源基因对可能是在双子叶和单子叶植物分化后形成。同源基因对OsECT的Ka/Ks<1,表明OsECT基因家族在进化过程中可能经历了较强的纯化选择压力。表达模式分析显示,OsECT-b、OsECT-c、OsECT-e和OsECT-j在水稻生长初期各个组织均保持较高的表达水平,OsECT-g在干旱处理后表达量显著下调。因此,OsECT基因在水稻生长发育和逆境胁迫中可能发挥着重要作用。本研究为今后OsECT基因在水稻的节水抗旱机制研究和相关抗逆育种提供了重要的理论基础。
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关键词
水稻
m^(6)A甲基化
YTH结构域
基因组共线性
表达分析
下载PDF
职称材料
快照式显微光谱成像系统及水藻分类识别研究
2
作者
李栋梁
蔡红星
+8 位作者
任玉
李霜
花扬扬
王婷婷
周建伟
曲冠男
王朔
曹洋铭
张桁源
《激光与光电子学进展》
CSCD
北大核心
2024年第6期331-337,共7页
目前的显微光谱成像系统的探测模块主要以推扫型光谱成像仪为主,无法进行动态微观样本的观测。基于超材料宽谱调制型光谱成像技术体制,使用该原理研制的快照式光谱相机作为探测模块,其与显微镜模块形成新型的快照式显微光谱成像系统。...
目前的显微光谱成像系统的探测模块主要以推扫型光谱成像仪为主,无法进行动态微观样本的观测。基于超材料宽谱调制型光谱成像技术体制,使用该原理研制的快照式光谱相机作为探测模块,其与显微镜模块形成新型的快照式显微光谱成像系统。该系统可实时获取样本的光谱曲线与光谱图像信息。同时利用该系统获取不同藻类的吸收光谱曲线,进一步使用基于支持向量机的图像分割识别算法,对水中的动态藻类样本进行识别。共测试样本80个,预测结果准确率为100%,召回率为65.52%,为快照式光谱成像技术在显微领域的应用奠定基础。
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关键词
显微镜
光谱成像
快照式
吸收光谱
目标识别
原文传递
题名
水稻ECT基因家族的全基因组研究
被引量:
1
1
作者
宁德正
庄可卿
张巧玲
李华
张婉桐
张桁源
胡颂平
卫海滨
机构
上海市农业生物基因中心
江西农业大学生物科学与生物工程学院植物功能基因与组织培养技术研究中心
江西农业大学作物生理生态与江西农业大学遗传育种教育部重点实验室
出处
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第7期919-925,共7页
基金
上海市自然科学基金面上项目(No.19ZR1446800)
国家自然科学基金项目(No.31971926)
+2 种基金
江西省自然科学基金重点项目(No.20202ACBL205007)
江西农业大学作物生理生态与遗传育种教育部重点实验室基金项目(No.2019DFP01)
国家级大学生创新创业项目(No.202110410033)资助。
文摘
真核生物mRNA转录后修饰可调控许多基因的遗传信息,植物m^(6)A甲基化研究正成为关注的新热点。m^(6)A结合蛋白(m^(6)A readers)调节m^(6)A修饰的特异性,通常具有YTH(YT521-B homology)结构域,在拟南芥中被命名为ECT结构域(evolutionarily conserved C-terminal region ECT domain)。目前ECT基因已在拟南芥和水稻等植物中检测到,但该基因家族在水稻中的成员及生物学功能还缺乏研究。本研究通过水稻ECT基因家族的全基因组分析,鉴定出12个OsECT基因,具有1个保守的基序,多位于蛋白质氨基酸序列C-端。共线性分析表明,在水稻基因组内OsECT-c与OsECT-e发生了重复事件,在物种间ECT同源基因对可能是在双子叶和单子叶植物分化后形成。同源基因对OsECT的Ka/Ks<1,表明OsECT基因家族在进化过程中可能经历了较强的纯化选择压力。表达模式分析显示,OsECT-b、OsECT-c、OsECT-e和OsECT-j在水稻生长初期各个组织均保持较高的表达水平,OsECT-g在干旱处理后表达量显著下调。因此,OsECT基因在水稻生长发育和逆境胁迫中可能发挥着重要作用。本研究为今后OsECT基因在水稻的节水抗旱机制研究和相关抗逆育种提供了重要的理论基础。
关键词
水稻
m^(6)A甲基化
YTH结构域
基因组共线性
表达分析
Keywords
rice
m^(6)A methylation
YTH domain
genome synteny
expression analysis
分类号
S511 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
快照式显微光谱成像系统及水藻分类识别研究
2
作者
李栋梁
蔡红星
任玉
李霜
花扬扬
王婷婷
周建伟
曲冠男
王朔
曹洋铭
张桁源
机构
长春理工大学物理学院
长春理工大学吉林省光谱探测科学与技术重点实验室
吉林求是光谱数据科技有限公司
出处
《激光与光电子学进展》
CSCD
北大核心
2024年第6期331-337,共7页
基金
吉林省教育厅项目(JJKH20230795KJ)。
文摘
目前的显微光谱成像系统的探测模块主要以推扫型光谱成像仪为主,无法进行动态微观样本的观测。基于超材料宽谱调制型光谱成像技术体制,使用该原理研制的快照式光谱相机作为探测模块,其与显微镜模块形成新型的快照式显微光谱成像系统。该系统可实时获取样本的光谱曲线与光谱图像信息。同时利用该系统获取不同藻类的吸收光谱曲线,进一步使用基于支持向量机的图像分割识别算法,对水中的动态藻类样本进行识别。共测试样本80个,预测结果准确率为100%,召回率为65.52%,为快照式光谱成像技术在显微领域的应用奠定基础。
关键词
显微镜
光谱成像
快照式
吸收光谱
目标识别
Keywords
microscope
spectral imaging
snapshot
absorption spectrum
target recognition
分类号
O433 [机械工程—光学工程]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
水稻ECT基因家族的全基因组研究
宁德正
庄可卿
张巧玲
李华
张婉桐
张桁源
胡颂平
卫海滨
《中国生物化学与分子生物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
1
下载PDF
职称材料
2
快照式显微光谱成像系统及水藻分类识别研究
李栋梁
蔡红星
任玉
李霜
花扬扬
王婷婷
周建伟
曲冠男
王朔
曹洋铭
张桁源
《激光与光电子学进展》
CSCD
北大核心
2024
0
原文传递
已选择
0
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