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与坏死性凋亡相关的lncRNA模型预测肾透明细胞癌患者预后及区分肿瘤的研究
1
作者
蒋奕斌
张梦翊
+3 位作者
王朋佳
胡泉
苗叶
钱晶
《现代医药卫生》
2023年第21期3626-3631,3636,共7页
目的通过建立坏死性凋亡相关的长非编码RNA(NR lncRNA)模型,预测肾透明细胞癌(KIRC)患者预后及区分冷、热肿瘤。方法从TCGA数据库中下载KIRC患者基因表达谱及临床信息。通过共表达分析和单变量Cox风险回归分析确定与KIRC预后相关的NR ln...
目的通过建立坏死性凋亡相关的长非编码RNA(NR lncRNA)模型,预测肾透明细胞癌(KIRC)患者预后及区分冷、热肿瘤。方法从TCGA数据库中下载KIRC患者基因表达谱及临床信息。通过共表达分析和单变量Cox风险回归分析确定与KIRC预后相关的NR lncRNA。使用Lasso回归分析构建NR lncRNA模型。应用χ^(2)检验和Kaplan-Meier生存分析对NR lncRNA模型进行验证和分析。通过R语言中“ConsensusClusterPlus”包应用NR lncRNA模型区分冷、热肿瘤。结果确定了3种与KIRC患者预后相关的NR lncRNA,并由此构建了NR lncRNA模型。高风险组较低风险组具有不良的预后。KIRC被分为2个亚型。与亚型2比较,亚型1具有免疫抑制性(即冷肿瘤)。结论建立了一个NR lncRNA模型,可预测KIRC患者预后,并为临床试验提供了理论基础。
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关键词
坏死性凋亡
长非编码RNA
肾透明细胞癌
预后
冷肿瘤
热肿瘤
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题名
与坏死性凋亡相关的lncRNA模型预测肾透明细胞癌患者预后及区分肿瘤的研究
1
作者
蒋奕斌
张梦翊
王朋佳
胡泉
苗叶
钱晶
机构
湖州师范学院医学院
浙江省媒介生物学与病原控制重点实验室
出处
《现代医药卫生》
2023年第21期3626-3631,3636,共7页
基金
教育部国家级大学生创新创业训练计划项目(202210347012)。
文摘
目的通过建立坏死性凋亡相关的长非编码RNA(NR lncRNA)模型,预测肾透明细胞癌(KIRC)患者预后及区分冷、热肿瘤。方法从TCGA数据库中下载KIRC患者基因表达谱及临床信息。通过共表达分析和单变量Cox风险回归分析确定与KIRC预后相关的NR lncRNA。使用Lasso回归分析构建NR lncRNA模型。应用χ^(2)检验和Kaplan-Meier生存分析对NR lncRNA模型进行验证和分析。通过R语言中“ConsensusClusterPlus”包应用NR lncRNA模型区分冷、热肿瘤。结果确定了3种与KIRC患者预后相关的NR lncRNA,并由此构建了NR lncRNA模型。高风险组较低风险组具有不良的预后。KIRC被分为2个亚型。与亚型2比较,亚型1具有免疫抑制性(即冷肿瘤)。结论建立了一个NR lncRNA模型,可预测KIRC患者预后,并为临床试验提供了理论基础。
关键词
坏死性凋亡
长非编码RNA
肾透明细胞癌
预后
冷肿瘤
热肿瘤
Keywords
Necroptosis
Long non-coding RNA
Kidney renal clear cell carcinoma
Prognosis
Cold tumor
Hot tumor
分类号
R737.11 [医药卫生—肿瘤]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
与坏死性凋亡相关的lncRNA模型预测肾透明细胞癌患者预后及区分肿瘤的研究
蒋奕斌
张梦翊
王朋佳
胡泉
苗叶
钱晶
《现代医药卫生》
2023
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