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腺泡状横纹肌肉瘤相关基因生物信息学分析
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作者 张汝朋 吕雷锋 +3 位作者 张晨 柏传毅 王坤正 党晓谦 《重庆医学》 CAS 2019年第9期1552-1555,共4页
目的采用生物信息学方法预测与腺泡状横纹肌肉瘤(ARMS)相关的差异表达基因和信号通路。方法从基因表达综合数据库GEO中下载得到14组ARMS与正常对照组织产生的系列数据集GSE2787表达谱数据集,依据生物信息学分析方法,采用R语言分析工具... 目的采用生物信息学方法预测与腺泡状横纹肌肉瘤(ARMS)相关的差异表达基因和信号通路。方法从基因表达综合数据库GEO中下载得到14组ARMS与正常对照组织产生的系列数据集GSE2787表达谱数据集,依据生物信息学分析方法,采用R语言分析工具筛选差异表达基因。注释、可视化和集成发现的数据库DAVID在线分析工具、R包、已知和预测的蛋白质-蛋白质相互作用STRING数据库及Cytoscape软件对差异表达基因进行基因功能、信号通路及蛋白-蛋白相互作用网络分析。结果共筛选出867个差异表达基因,表达上调基因737个,下调基因130个。蛋白-蛋白相互作用网络由752个节点和5 158个交互组成,网络分析列出蛋白相互作用网络的前35个中心节点蛋白。关键差异表达基因主要涉及RNA拼接等生物学过程、核糖核蛋白复合体等细胞组件、RNA结合等分子功能及剪接体信号通路。结论剪切刺激因子3(CSTF3)、剪接体相关蛋白同源体(CWC25)、Asp-Glu-Ala-Asp解旋酶5(DDX5)等差异表达基因及剪接体信号通路可能与ARMS的发生、发展密切相关。 展开更多
关键词 计算生物学 横纹肌肉瘤 差异表达基因 信号通路
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基于有限元的二辊轧机轧辊热凸度分析与研究
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作者 赵军 张汝朋 李敏 《科学中国人》 2015年第11X期68-69,共2页
轧辊热凸度是影响板材板形质量的一个重要因素。通过有限元分析和实际测试对非稳态轧制下工作辊温度场和热膨胀进行建模研究,并分析非稳态下轧辊温度场及热膨胀的影响规律。结果表明,所建立的模型与实际生产相吻合。
关键词 有限元 辊型 热凸度 温度场
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