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不同组织与逆境胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选
1
作者
邓嘉硕
冯程
+1 位作者
张泷昊
杨旭
《中国蔬菜》
北大核心
2024年第8期37-46,共10页
为了筛选茄子中不同组织与不同逆境胁迫下合适的内参基因,本研究选取UBC、EF-1a、18S、Actin、GAPDH、β-TUB、L33和EF28个候选内参基因,在涝害胁迫、干旱胁迫、冷胁迫、热胁迫、大丽轮枝菌侵染、盐胁迫、水杨酸处理和不同组织部位8种...
为了筛选茄子中不同组织与不同逆境胁迫下合适的内参基因,本研究选取UBC、EF-1a、18S、Actin、GAPDH、β-TUB、L33和EF28个候选内参基因,在涝害胁迫、干旱胁迫、冷胁迫、热胁迫、大丽轮枝菌侵染、盐胁迫、水杨酸处理和不同组织部位8种试验条件下,利用geNorm、NormFinder、ΔC_(T)、Bestkeeper和RefFinder对其稳定性进行分析。结果显示,在全部样品、冷胁迫、热胁迫、大丽轮枝菌侵染和盐胁迫下,Actin均为最稳定内参基因,β-TUB是涝害胁迫下表达最稳定的基因,干旱胁迫下表达最稳定的是EF2,水杨酸处理下表达最稳定的是EF-1a,18S在不同组织部位的处理下稳定性最好。UBC、L33和GAPDH在各个处理下均不稳定表达。本研究为茄子不同组织及逆境胁迫下基因特异性表达研究提供了合适的内参基因。
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关键词
茄子
不同组织
逆境胁迫
内参基因
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题名
不同组织与逆境胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选
1
作者
邓嘉硕
冯程
张泷昊
杨旭
机构
扬州大学园艺园林学院
扬州大学教育部农业与农产品安全国际合作联合实验室
出处
《中国蔬菜》
北大核心
2024年第8期37-46,共10页
基金
国家自然科学基金项目(31972395)。
文摘
为了筛选茄子中不同组织与不同逆境胁迫下合适的内参基因,本研究选取UBC、EF-1a、18S、Actin、GAPDH、β-TUB、L33和EF28个候选内参基因,在涝害胁迫、干旱胁迫、冷胁迫、热胁迫、大丽轮枝菌侵染、盐胁迫、水杨酸处理和不同组织部位8种试验条件下,利用geNorm、NormFinder、ΔC_(T)、Bestkeeper和RefFinder对其稳定性进行分析。结果显示,在全部样品、冷胁迫、热胁迫、大丽轮枝菌侵染和盐胁迫下,Actin均为最稳定内参基因,β-TUB是涝害胁迫下表达最稳定的基因,干旱胁迫下表达最稳定的是EF2,水杨酸处理下表达最稳定的是EF-1a,18S在不同组织部位的处理下稳定性最好。UBC、L33和GAPDH在各个处理下均不稳定表达。本研究为茄子不同组织及逆境胁迫下基因特异性表达研究提供了合适的内参基因。
关键词
茄子
不同组织
逆境胁迫
内参基因
Keywords
eggplant
different tissues
adversity stress
internal reference genes
分类号
S641.1 [农业科学—蔬菜学]
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作者
出处
发文年
被引量
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1
不同组织与逆境胁迫下茄子qRT-PCR内参基因筛选
邓嘉硕
冯程
张泷昊
杨旭
《中国蔬菜》
北大核心
2024
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