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大型综合性医院生物样本信息资源大数据科研平台的建设与应用
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作者 刘辉 蔡宏伟 +3 位作者 高娟娟 张琳珮 那天 王亚文 《医学信息学杂志》 CAS 2024年第1期77-82,共6页
目的/意义通过整合临床与生物样本信息,构建生物样本信息资源大数据科研平台,为科研人员提供一站式数据检索、集成、分析服务,建立数据治理体系,提升医院临床科研基础设施建设水平。方法/过程采用通用数据模型和数据治理技术,通过抽取... 目的/意义通过整合临床与生物样本信息,构建生物样本信息资源大数据科研平台,为科研人员提供一站式数据检索、集成、分析服务,建立数据治理体系,提升医院临床科研基础设施建设水平。方法/过程采用通用数据模型和数据治理技术,通过抽取、转换、加载等步骤整合来自不同厂商的数据源,提供统一数据访问入口。结果/结论该生物样本信息资源大数据科研平台具备多维数据筛查和快速集成分析的优势,可为临床科研提供支撑。 展开更多
关键词 生物样本 医疗大数据 数据治理 通用数据模型
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朝天罐总酚对脂多糖诱导的小鼠巨噬细胞炎症反应的调控作用 被引量:4
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作者 张琳珮 陈依雨 +3 位作者 陆洪艳 史雯雪 郭玲 蒋霞 《广西医科大学学报》 CAS 2022年第3期370-374,共5页
目的:探讨朝天罐总酚对脂多糖(LPS)诱导小鼠巨噬细胞(RAW264.7)炎症反应的调控作用。方法:培养小鼠RAW264.7巨噬细胞,以LPS诱导构建细胞炎症模型,采用MTT法测定不同浓度(1.88μg/mL、3.75μg/mL、7.5μg/mL、15μg/mL、30μg/mL、60μg/... 目的:探讨朝天罐总酚对脂多糖(LPS)诱导小鼠巨噬细胞(RAW264.7)炎症反应的调控作用。方法:培养小鼠RAW264.7巨噬细胞,以LPS诱导构建细胞炎症模型,采用MTT法测定不同浓度(1.88μg/mL、3.75μg/mL、7.5μg/mL、15μg/mL、30μg/mL、60μg/mL)朝天罐总酚对细胞增殖的影响,中性红吞噬实验检测朝天罐总酚对RAW264.7细胞吞噬能力的影响。根据细胞存活率和吞噬功能检测结果,设为朝天罐总酚低、中、高剂量组,Griess法检测细胞上清液一氧化氮(NO)含量,酶联免疫吸附试验(ELISA)法检测细胞上清液中肿瘤坏死因子(TNF)-α和白细胞介素(IL)-6水平。结果:朝天罐总酚浓度≤15μg/mL时,其对RAW264.7细胞存活率无显著影响(P>0.05)。与空白对照比较,3.75~15μg/mL朝天罐总酚可增强RAW264.7细胞细胞吞噬能力(P<0.01)。与空白对照组比较,模型组NO、TNF-α、IL-6水平升高(P<0.01);与模型组比较,朝天罐总酚中、高剂量组NO、TNF-α水平降低,朝天罐总酚各剂量组IL-6水平降低(均P<0.01)。结论:朝天罐总酚可能通过抑制炎症因子产生、增强细胞吞噬功能对LPS诱导的RAW264.7巨噬细胞发挥抗炎作用。 展开更多
关键词 朝天罐总酚 抗炎 吞噬功能 小鼠巨噬细胞 RAW264.7
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葡聚糖硫酸钠诱导不同性别溃疡性结肠炎小鼠模型的比较
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作者 张琳珮 陆洪艳 +1 位作者 史雯雪 蒋霞 《药品评价》 CAS 2022年第3期141-144,共4页
目的:探讨性别差异对小鼠溃疡性结肠炎(UC)模型成模的影响,为实验造模提供参考依据。方法:将24只C57BL/6J小鼠根据性别随机分为4组,雌性对照组、雄性对照组、雌性DSS组和雄性DSS组,每组6只,对照组正常饮食,雌性或雄性DSS组给予正常饮食... 目的:探讨性别差异对小鼠溃疡性结肠炎(UC)模型成模的影响,为实验造模提供参考依据。方法:将24只C57BL/6J小鼠根据性别随机分为4组,雌性对照组、雄性对照组、雌性DSS组和雄性DSS组,每组6只,对照组正常饮食,雌性或雄性DSS组给予正常饮食+3%葡聚糖硫酸钠(DSS)溶液自由饮用7 d进行造模。每日记录各组小鼠精神状态、毛色光泽、体质量、进食量、粪便性状及隐血,评估疾病活动指数(DAI)、病死率、成模率、结肠长度、脾脏系数,苏木精-伊红(HE)染色观察结肠病理变化。结果:雌性DSS组小鼠DAI评分、病死率均较雄性DSS组低,脾脏系数较雄性DSS组低(P<0.01),体质量变化、结肠长度缩短较雄性DSS组较少(P<0.01,P<0.05),成模率较雄性DSS组高,结肠病理变化较雄性DSS组黏膜充血水肿轻,炎症细胞较少。结论:3% DSS溶液诱导C57BL/6J小鼠UC模型存在一定的性别偏倚,提示使用3% DSS溶液7 d建立雌性UC小鼠更易于模型的诱导。 展开更多
关键词 溃疡性结肠炎 性别因素 葡聚糖硫酸钠 动物模型 小鼠 近交C57BL/6J
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朝天罐总酚对人肺癌细胞增殖抑制及诱导凋亡作用的研究 被引量:5
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作者 陈艳华 陆洪艳 +3 位作者 史雯雪 姚石丽 张琳珮 蒋霞 《中药材》 CAS 北大核心 2021年第6期1483-1487,共5页
目的:研究朝天罐总酚对人肺癌细胞株的抑制作用及其抗肺癌作用机制。方法:培养人肺癌细胞,在倒置显微镜下观察朝天罐总酚对肺癌细胞形态学的影响;采用CCK-8法检测10、20、40、80、160μg/mL5个不同浓度朝天罐总酚对三株人肺癌细胞NCI-H1... 目的:研究朝天罐总酚对人肺癌细胞株的抑制作用及其抗肺癌作用机制。方法:培养人肺癌细胞,在倒置显微镜下观察朝天罐总酚对肺癌细胞形态学的影响;采用CCK-8法检测10、20、40、80、160μg/mL5个不同浓度朝天罐总酚对三株人肺癌细胞NCI-H1299、A549、NCI-H460的体外增殖抑制率;应用台盼蓝拒染法检测朝天罐总酚作用后的细胞活力;Hoechst 33342检测细胞核染色质的变化;流式细胞术Annexin V-FITC/PI双染色法检测朝天罐总酚对NCI-H460细胞凋亡的影响;Real-time PCR检测朝天罐总酚对NCI-H460细胞Bcl-2、Bax、Fas、Caspase-3、Caspase-9 mRNA表达的影响。结果:倒置显微镜观察到在朝天罐总酚的作用下肺癌细胞的增殖均受到不同程度的抑制,细胞数量减少;CCK-8实验表明朝天罐总酚能显著抑制NCI-H1299、A549、NCI-H460细胞的增殖活性,台盼蓝拒染结果显示朝天罐总酚能显著降低三种肺癌细胞活力。Hoechst 33342检测NCI-H460细胞凋亡发现细胞核染色质明显改变;流式细胞术结果显示朝天罐总酚可促进NCI-H460细胞凋亡;Real-time PCR显示在朝天罐总酚的作用下NCI-H460细胞Bcl-2 mRNA表达显著降低,Bax、Fas、Caspase-3、Caspase-9 mRNA表达显著升高。结论:朝天罐总酚能抑制肺癌细胞增殖并诱导其凋亡。 展开更多
关键词 朝天罐总酚 人肺癌细胞 增殖 凋亡
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基于网络药理学和分子对接技术探讨罗汉果治疗糖尿病的作用机制 被引量:1
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作者 史雯雪 张琳珮 +2 位作者 陆洪艳 姚石丽 蒋霞 《湖南中医杂志》 2022年第10期166-174,共9页
目的:运用网络药理学和分子对接技术探讨罗汉果治疗糖尿病的作用机制。方法:通过TCMSP平台和Swiss Target Prediction数据库筛选出罗汉果的活性成分及其靶点;利用GeneCard、TTD、OMIM数据库筛选出糖尿病潜在靶点;采用Cytoscape 3.7.2软... 目的:运用网络药理学和分子对接技术探讨罗汉果治疗糖尿病的作用机制。方法:通过TCMSP平台和Swiss Target Prediction数据库筛选出罗汉果的活性成分及其靶点;利用GeneCard、TTD、OMIM数据库筛选出糖尿病潜在靶点;采用Cytoscape 3.7.2软件构建药物-活性成分-疾病-靶点的可视化网络;通过STRING数据库对关键靶点构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;利用Metascape数据库进行基因本体(GO)功能以及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;利用Autodock4和Pymol软件对关键活性成分和关键靶点进行分子对接分析和可视化。结果:筛选出有效成分18种,糖尿病靶点146个。GO功能富集分析得到GO条目572条,KEGG通路富集分析得到信号通路167条。分子对接结果显示β-谷甾醇、山柰酚、罗汉果醇等关键活性成分与原癌基因酪氨酸蛋白激酶(SRC)等关键靶点的亲和力较高。结论:罗汉果通过多靶点、多通路发挥抗糖尿病的作用,其关键活性成分通过与SRC、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、丝裂原活化蛋白激酶3(MAPK-3)等靶点调节晚期糖基化终末产物-糖基化终末产物受体(AGE-RAGE)、缺氧诱导因子1(HIF-1)、磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶(PI3K-Akt)等信号通路起到治疗糖尿病的作用。 展开更多
关键词 糖尿病 罗汉果 作用机制 网络药理学 分子对接
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