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两种凝集法检测布鲁菌病抗体的比较 被引量:6
1
作者 张相萍 李洋 《检验医学与临床》 CAS 2012年第17期2225-2226,共2页
目的对虎红平板凝集试验(RBPT)和试管凝集试验(SAT)检测布鲁菌病结果进行比较。方法按《布鲁菌病诊断标准》(WS269-2007)中规定方法进行检测。结果 1 558份血清中,99份虎红平板凝集试验阳性,53份试管凝集试验阳性,阳性率分别为6.35%、3.... 目的对虎红平板凝集试验(RBPT)和试管凝集试验(SAT)检测布鲁菌病结果进行比较。方法按《布鲁菌病诊断标准》(WS269-2007)中规定方法进行检测。结果 1 558份血清中,99份虎红平板凝集试验阳性,53份试管凝集试验阳性,阳性率分别为6.35%、3.40%。结论在实际检测工作中应该把两种方法结合起来应用,互补优劣,先用RBPT筛选,阳性样品再用SAT复核,以做出比较准确的判断。 展开更多
关键词 布鲁菌病 虎红平板凝集试验 试管凝集试验 比较
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蛋白质内含子的研究进展 被引量:1
2
作者 张相萍 屈艾 丁铁林 《生物学杂志》 CAS CSCD 2009年第3期59-62,共4页
自1990年发现第一个蛋白质内含子以来,对其研究愈加引起注意。蛋白质内含子是蛋白质剪接元件,可从前体蛋白中切除并将两侧外显子连接起来成为成熟蛋白质,标准的蛋白质剪接主要包括四步亲核置换反应,新近又发现一种反式剪接机制。蛋白质... 自1990年发现第一个蛋白质内含子以来,对其研究愈加引起注意。蛋白质内含子是蛋白质剪接元件,可从前体蛋白中切除并将两侧外显子连接起来成为成熟蛋白质,标准的蛋白质剪接主要包括四步亲核置换反应,新近又发现一种反式剪接机制。蛋白质内含子的演化形成存在先天遗传和后天插入两种方式,但目前还没有直接的实验证据。数据库显示,蛋白质内含子有10个保守模体:A、N2、B、N4、C、D、E、H、F和G,它们在蛋白质剪接过程中具有不同的作用。作为蛋白质剪切元件的蛋白质内含子,是蛋白质工程中一个功能强大的工具,具有重要的实践意义。现对蛋白质内含子的命名、分布、结构、剪接方式以及应用前景等作一全面的综述。 展开更多
关键词 蛋白质内含子 模体 剪接机制 应用
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环境物质拟除虫菊酯毒理学研究进展 被引量:12
3
作者 胡文静 屈艾 +2 位作者 仇敬运 张相萍 丁铁林 《环境科学与管理》 CAS 2007年第10期52-54,57,共4页
拟除虫菊酯作为一种重要的合成杀虫剂,在人们的生产生活中有着广泛的应用,但同时其毒理学问题也越来越引起人们的注意,许多学者对此进行了深入的研究,在此研究基础上,从对动物的神经毒性、生殖毒性和生理生化毒性三个方面,对拟除虫菊酯... 拟除虫菊酯作为一种重要的合成杀虫剂,在人们的生产生活中有着广泛的应用,但同时其毒理学问题也越来越引起人们的注意,许多学者对此进行了深入的研究,在此研究基础上,从对动物的神经毒性、生殖毒性和生理生化毒性三个方面,对拟除虫菊酯的毒理学研究进展作一综述。 展开更多
关键词 拟除虫菊酯 生理生化毒性 神经毒性 生殖毒性
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稀土元素镨对蚕豆的遗传毒性和细胞毒性研究 被引量:4
4
作者 孙玲 屈艾 +3 位作者 胡文静 仇敬运 张相萍 丁铁林 《癌变.畸变.突变》 CAS CSCD 2008年第6期441-444,共4页
背景与目的:研究稀土元素镨对蚕豆的遗传毒性和细胞毒性。材料与方法:蚕豆初生幼苗浸入7个PrCl3浓度(1,2,4,8,16,32,64μg/ml)系列溶液,25℃恒温培养6h,之后双蒸水中修复培养24h,切取根尖。进行蚕豆根尖细胞微核试验,计数有丝分裂指数... 背景与目的:研究稀土元素镨对蚕豆的遗传毒性和细胞毒性。材料与方法:蚕豆初生幼苗浸入7个PrCl3浓度(1,2,4,8,16,32,64μg/ml)系列溶液,25℃恒温培养6h,之后双蒸水中修复培养24h,切取根尖。进行蚕豆根尖细胞微核试验,计数有丝分裂指数、染色体畸变率。结果:PrCl3浓度在≥8μg/ml时可损伤蚕豆根尖细胞,影响根尖的生长;在1~32μg/ml浓度范围内根尖细胞微核率呈剂量_效应关系(r=0.948,P<0.05);在2~64μg/ml浓度范围内有丝分裂指数呈剂量_效应关系(r=-0.789,P<0.05);在1~8μg/ml浓度范围内染色体畸变率呈剂量_效应关系(r=0.992,P<0.05)。结论:稀土元素镨对蚕豆根尖细胞具有一定的遗传毒性和细胞毒性。 展开更多
关键词 稀土元素 蚕豆 微核率 染色体畸变率 有丝分裂指数
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安阳市2011年手足口病病原学特征分析 被引量:3
5
作者 李洋 张相萍 +1 位作者 胡秀杰 侯晓慧 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2014年第1期139-140,143,共3页
目的研究和分析2011年安阳市手足口病病原感染情况及特征。方法采用实时荧光PCR方法检测手足口病病例感染的肠道病毒类型,使用SPSS软件进行统计学分析。结果 2011年安阳市手足口病病例以EV71型肠道病毒感染为主,CA16型次之,其他肠道病... 目的研究和分析2011年安阳市手足口病病原感染情况及特征。方法采用实时荧光PCR方法检测手足口病病例感染的肠道病毒类型,使用SPSS软件进行统计学分析。结果 2011年安阳市手足口病病例以EV71型肠道病毒感染为主,CA16型次之,其他肠道病毒占有一定比例。不同病原感染的季节性特征显著,感染人群主要为低龄婴幼儿,没有发现性别差异。聚类分析显示安阳市手足口病病原谱与周边地区有显著差异。结论安阳市手足口病防治应以低龄婴幼儿为主要防控人群,以春季防治EV71型感染为工作重点,制定更符合本地区疾病流行情况的防治策略。 展开更多
关键词 手足口病 实时荧光PCR 聚类分析
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布氏菌病患者抗体测定与细菌学检验结果的对比分析 被引量:4
6
作者 宋艳文 张相萍 《检验医学与临床》 CAS 2008年第10期604-604,共1页
目的观察布氏菌病抗体测定结果与细菌学检验结果是否存在必然的对应关系。方法抗体测定采用试管凝集试验;细菌学检验采用常规的分离培养方法。结果54例发病症状基本相符患者中有50例被抗体测定判病,1例被细菌学检验判病,其中6例被抗体... 目的观察布氏菌病抗体测定结果与细菌学检验结果是否存在必然的对应关系。方法抗体测定采用试管凝集试验;细菌学检验采用常规的分离培养方法。结果54例发病症状基本相符患者中有50例被抗体测定判病,1例被细菌学检验判病,其中6例被抗体测定和细菌学检验同时判病。结论抗体测定与细菌学检验不一定存在对应关系,无论抗体测定效价高低都有可能分离出布氏菌。 展开更多
关键词 布氏菌病 抗体测定 细菌学检验
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中央空调风管积尘的微生物检验结果及问题探讨 被引量:1
7
作者 宋艳文 张相萍 《检验医学与临床》 CAS 2008年第16期1009-1009,共1页
关键词 中央空调 微生物 检验
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金黄色葡萄球菌增菌培养基增菌效果观察 被引量:4
8
作者 胡秀杰 张相萍 包小兵 《医药论坛杂志》 2005年第18期3-3,5,共2页
目的选择好的增菌培养基,以提高金黄色葡萄球菌(以下简称金葡菌)的检出率。方法用一定数量的大肠埃希氏菌与不同数量的金葡菌混合培养,观察不同增菌液的增菌效果。结果从SCDLP增菌液中,金葡菌划线分离到Baird-parker(以下简称B-P)平板... 目的选择好的增菌培养基,以提高金黄色葡萄球菌(以下简称金葡菌)的检出率。方法用一定数量的大肠埃希氏菌与不同数量的金葡菌混合培养,观察不同增菌液的增菌效果。结果从SCDLP增菌液中,金葡菌划线分离到Baird-parker(以下简称B-P)平板、高盐甘露醇平板、普通琼脂平板上不生长,5个血平板上仅有1个生长;从7.5%氯化钠增菌液中,金葡菌划线分离到上述平板均生长。结论配制的7.5%氯化钠增菌液增菌效果较好。 展开更多
关键词 金黄色葡萄球菌 增菌效果 SCDLP增菌液
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不同条件保存的大肠埃希菌对灭菌效果的影响
9
作者 包小兵 张相萍 张卫星 《检验医学与临床》 CAS 2008年第19期1188-1188,共1页
关键词 大肠埃希菌 保存 消毒杀菌
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2022年河南省安阳市甲型H3N2流感病毒基因特征
10
作者 王伟伟 张相萍 +5 位作者 侯自员 李文杰 李战朋 张一纯 晁雪宁 包小兵 《现代疾病预防控制》 2024年第9期698-704,共7页
目的分析河南省安阳市2022年甲型H3N2流感病毒基因特征,为科学防控流感提供依据。方法利用测序技术对2022年安阳市17株甲型H3N2流感病毒进行全基因组序列测定,运用生物信息学软件对甲型H3N2流感病毒的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因序... 目的分析河南省安阳市2022年甲型H3N2流感病毒基因特征,为科学防控流感提供依据。方法利用测序技术对2022年安阳市17株甲型H3N2流感病毒进行全基因组序列测定,运用生物信息学软件对甲型H3N2流感病毒的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因序列进行比对,构建分子进化树,分析基因特征。结果安阳市17株甲型H3N2流感病毒分离株间核苷酸序列的同源性为98.7%~100.0%,氨基酸序列的同源性为98.1%~100.0%;与疫苗株A/Cambodia/e0826360/2020(H3N2)比较,核苷酸序列的同源性为95.7%~99.4%,氨基酸序列的同源性为96.9%~98.6%。17株甲型H3N2流感病毒分离株均属于3C.2a1b.2a.1a.1分支,与疫苗株A/Cambodia/e0826360/2020(H3N2)相比,HA基因共发生16处氨基酸位点变异,但变异位点均没有在HA抗原决定簇和RBS的位置;NA基因共发生13处氨基酸位点变异,与目前已知报道的耐药相关的变异位点不同,HA和NA潜在N-糖基化位点在数量和位置上均发生变化。结论2022年安阳市甲型H3N2流感病毒在流行过程中未发生明显变异;但HA和NA多个氨基酸位点的变异提示仍需加强对甲型H3N2流感病毒分子水平的动态监测。 展开更多
关键词 甲型H3N2流感病毒 HA基因 NA基因 进化分析
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2016-2020年河南省安阳市流行性感冒哨点监测病原学分析 被引量:7
11
作者 张相萍 侯自员 +1 位作者 王伟伟 李文杰 《现代疾病预防控制》 2023年第3期199-201,224,共4页
目的 分析2016-2020年度安阳市流感样病例病原学构成情况,掌握安阳市流行性感冒(流感)流行特征。方法 对安阳市人民医院送检的流感样病例咽拭子标本进行实时荧光定量PCR检测。结果 共检测标本3 904份,流感病毒阳性723份,阳性率18.52%。2... 目的 分析2016-2020年度安阳市流感样病例病原学构成情况,掌握安阳市流行性感冒(流感)流行特征。方法 对安阳市人民医院送检的流感样病例咽拭子标本进行实时荧光定量PCR检测。结果 共检测标本3 904份,流感病毒阳性723份,阳性率18.52%。2018年1月阳性率最高(64.44%),以甲型流感病毒(新甲型H1N1占36.79%,季节性H3N2占39.42%)为主,乙型流感病毒较少(Victoria系占9.27%,Yamagata系占14.52%);2020年1月24日新型冠状病毒感染疫情防控后,流感病毒阳性率为0.88%,管控前后阳性率差异有统计学意义(P<0.05);5~14岁年龄组阳性率最高(28.95%),各年龄组流感病毒核酸阳性率差异有统计学意义(P<0.05)。结论 2016-2020年度安阳市流感流行特征季节性较明显高峰出现在冬季,不同型别病毒交替流行,青少年是流感防控的重点人群,应加大健康教育宣传力度,加强流感疫苗接种工作。 展开更多
关键词 流感 流感病毒 病原学 监测
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一例新型冠状病毒奥密克戎BA.2.2.1的全基因组分析 被引量:1
12
作者 张相萍 马红霞 +1 位作者 侯自员 王伟伟 《现代疾病预防控制》 2023年第5期366-370,共5页
目的对河南省安阳市1例新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染病例全基因组测序及进化变异分析。方法选取1例新型冠状病毒无症状感染者的鼻咽拭子进行Nanopore纳米孔测序获得病毒的全基因组序列,应用在线分析平台,判断病毒型别;利用分子进化遗... 目的对河南省安阳市1例新型冠状病毒(SARS-CoV-2)感染病例全基因组测序及进化变异分析。方法选取1例新型冠状病毒无症状感染者的鼻咽拭子进行Nanopore纳米孔测序获得病毒的全基因组序列,应用在线分析平台,判断病毒型别;利用分子进化遗传分析软件鉴别病毒基因的变异位点;与参考基因进行比对,构建进化树。结果成功获得该病例的SARS-CoV-2的全基因组序列,基因组全长29850 bp;同武汉参考株(NC_04512.2)序列相比,共检测出78处核苷酸突变位点,在共享上海参考株(ON955521.1)74个突变位点的基础上,增加4个突变位点,分别为C4832T、C5157T、C20030T、C25546T;病毒分型结果显示属于奥密克戎BA.2.2.1型;进化分析显示与上海参考株全基因组序列高度同源。结论通过Nanopore纳米孔测序获得全基因组序列,能够为当地的病毒进化溯源、病毒变异、流行病学调查和疫情防控提供依据。 展开更多
关键词 新型冠状病毒 基因测序 奥密克戎BA.2.2.1 进化分析
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河南省安阳市龙安区2017-2021年手足口病病原学检测结果分析 被引量:1
13
作者 刘俊玲 张相萍 李爱军 《安徽预防医学杂志》 2023年第6期497-500,共4页
目的 探讨2017-2021年安阳市龙安区手足口病(HFMD)病原学变化。方法 采集2017年1月至2021年12月龙安区某市级医疗机构门诊及住院的HFMD患儿粪便标本655份和咽拭子标本345份,采用荧光定量RTPCR法对标本进行肠道病毒核酸检测,根据标本检... 目的 探讨2017-2021年安阳市龙安区手足口病(HFMD)病原学变化。方法 采集2017年1月至2021年12月龙安区某市级医疗机构门诊及住院的HFMD患儿粪便标本655份和咽拭子标本345份,采用荧光定量RTPCR法对标本进行肠道病毒核酸检测,根据标本检测结果分析病原学变化情况。结果 2017-2021年共检测1 000份标本,近5年手足口病病原学阳性检出率为27.56%~93.18%,每年不同型别病原学构成比不同,差异均有统计学意义(P值均<0.05)。其中2017年以CVA6型为主,2018年以EV71型为主,2019年以其他肠道病毒为主,2020年与2021年均以CVA16为主。男性患儿不同型别病毒的阳性检出率均略高于女性。0~3岁儿童标本,病原学阳性406份,占88.26%;10~12岁儿童标本,病原学阳性1份,仅占0.22%。655份粪便标本中,病原学阳性356份,检出率为54.35%,其中CVA16型占比最高,为32.58%;345份咽拭子标本中,病原学阳性104份,检出率为30.14%,其中EV71型、CVA16型占比较高,均为34.62%。不同类型的标本,手足口病肠道病毒阳性检出率差异有统计学意义(χ^(2)=53.304,P<0.001)。结论 龙安区手足口病肠道病毒阳性检出率不断上升,其中CVA16型和EV71型肠道病毒为主要病原体。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒 粪便 咽拭子
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安阳市HIV感染者和患者CD_4^+ T淋巴细胞检测分析 被引量:3
14
作者 张相萍 胡秀杰 《职业与健康》 CAS 2011年第8期884-885,共2页
目的检测安阳地区可随访到的56例H IV感染者和患者(H IV和AIDS)的CD4+T淋巴细胞值,分析CD4+、CD8+T淋巴细胞水平,以了解H IV和AIDS病程进展情况,为抗病毒治疗提供依据。方法对56份抗凝血标本通过BD FACSCount流式细胞仪进行CD4+和CD8+T... 目的检测安阳地区可随访到的56例H IV感染者和患者(H IV和AIDS)的CD4+T淋巴细胞值,分析CD4+、CD8+T淋巴细胞水平,以了解H IV和AIDS病程进展情况,为抗病毒治疗提供依据。方法对56份抗凝血标本通过BD FACSCount流式细胞仪进行CD4+和CD8+T淋巴细胞绝对值及CD4+/CD8+比值的检测,统计分析测定值。结果检测56份样本中,CD4+T淋巴细胞绝对计数<200/μl的有32例,占57.14%;200~300/μl的有12例,占21.43%;300~500/μl的有8例,占14.29%。CD4+/CD8+<1,占总检测人数的96.43%。结论按照《国家免费艾滋病抗病毒药物治疗手册》(第2版)标准,安阳市能随访到的H IV感染者已经进入发病高峰。 展开更多
关键词 HIV和AIDS CD4+T淋巴细胞计数 CD4+/CD8+比值
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2010年安阳市正常人群手足口病隐性感染调查 被引量:7
15
作者 张相萍 李洋 《河南预防医学杂志》 2012年第3期173-174,共2页
目的了解安阳市2010年成人及健康儿童手足口病隐性感染情况。方法选取我市滑县王庄镇刘草滩村作为现场,开展人群感染率状况调查。调查对象分10个年龄组,0岁-、1岁-、2岁-、3岁-、4岁-、5岁-、6岁-,7-12岁、13-18岁、〉18岁组各10人;共调... 目的了解安阳市2010年成人及健康儿童手足口病隐性感染情况。方法选取我市滑县王庄镇刘草滩村作为现场,开展人群感染率状况调查。调查对象分10个年龄组,0岁-、1岁-、2岁-、3岁-、4岁-、5岁-、6岁-,7-12岁、13-18岁、〉18岁组各10人;共调查100人。每人采集粪便标本5-8 g,进行实时荧光PCR肠道病毒核酸检测(包括肠道病毒通用型,肠道病毒71型,柯萨奇病毒A16型)。结果肠道病毒通用型阳性35份,阳性率35.00%,35份阳性标本中EV71型1份,CA16型0份。35例阳性标本中,33例为6岁以下儿童,占94.28%。结论我市健康人群中的肠道病毒隐性感染较为普遍;6岁以下儿童为主要感染人群;通常引起手足口病的CA16和EV71亚型的隐性感染在健康人群中较为少见。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒 实时荧光PCR
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自我剪接内含子结构与剪接的关系
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作者 张相萍 林瑛 +1 位作者 屈艾 孟清 《生命科学》 CSCD 北大核心 2009年第4期524-530,共7页
自我剪接内含子是指具有催化活性的RNA分子,可介导自身的剪切和两侧外显子的连接。自我剪接内含子包括Ⅰ型内含子和Ⅱ型内含子两类,主要存在于原生生物、真菌、藻类、植物细胞器以及细菌和古细菌(Ⅱ型内含子)基因组中。尽管核苷酸序列... 自我剪接内含子是指具有催化活性的RNA分子,可介导自身的剪切和两侧外显子的连接。自我剪接内含子包括Ⅰ型内含子和Ⅱ型内含子两类,主要存在于原生生物、真菌、藻类、植物细胞器以及细菌和古细菌(Ⅱ型内含子)基因组中。尽管核苷酸序列保守性很低,但两类自我剪接内含子均能分别形成不同的保守二级结构,且它们都可通过两步连续的转酯反应完成剪接。但由于其结构存在较大差异,导致其剪接机制也各不相同。对其结构与剪接关系的深入研究将有助于进一步探索自我剪接内含子在生物体内的功能、起源和进化。 展开更多
关键词 自我剪接内含子 ORF 结构 剪接 成熟酶
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安阳市首次分离到产毒O157:H7菌株的PCR鉴定
17
作者 张相萍 《中国卫生检验杂志》 CAS 2011年第1期114-115,共2页
目的:鉴定从生羊肉中分离到的大肠杆菌O157:H7菌株的毒性基因和rfbO157、flicH7特异性基因。方法:PCR技术同时检测大肠杆菌O157:H7的四种毒性基因和rfbO157、flicH7特异性基因。结果:可疑菌株含有鞭毛H7基因(fli-cH7),志贺毒素2(stx2)基... 目的:鉴定从生羊肉中分离到的大肠杆菌O157:H7菌株的毒性基因和rfbO157、flicH7特异性基因。方法:PCR技术同时检测大肠杆菌O157:H7的四种毒性基因和rfbO157、flicH7特异性基因。结果:可疑菌株含有鞭毛H7基因(fli-cH7),志贺毒素2(stx2)基因,溶血素基因(hlyA),肠上皮细胞纤毛清除素基因(eaeA)和O157:H7特异性基因(rfbO157),但不含有志贺毒素1(stx1)基因。结论:菌株为产志贺毒素大肠杆菌O157:H7血清型。 展开更多
关键词 大肠杆菌O157:H7 PCR技术 志贺样毒素
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从生羊肉中检出一株大肠埃希氏菌O157:H7
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作者 张相萍 李洋 《河南预防医学杂志》 2012年第5期336-337,共2页
目的了解和掌握安阳市市售生鲜肉类食品受EHECO157:H7污染的状况。方法从安阳市市售生鲜类食品中随机采样,选择增菌培养后,用免疫磁珠富集分离病原菌,应用VITEK-32全自动微生物分析系统和血清学方法鉴定,并用PCR方法进行STX1、STX2、eae... 目的了解和掌握安阳市市售生鲜肉类食品受EHECO157:H7污染的状况。方法从安阳市市售生鲜类食品中随机采样,选择增菌培养后,用免疫磁珠富集分离病原菌,应用VITEK-32全自动微生物分析系统和血清学方法鉴定,并用PCR方法进行STX1、STX2、eaeA、hlyA、rfbO157和flicH7基因检测。结果从一份生羊肉中分离到一株大肠埃希氏菌O157:H7,该菌株有rfbO157、flicH7、STX2、eaeA和hlyA基因,不含有STX1。结论此次从生羊肉中分离出带有毒性基因的O157:H7。该菌在我市食品中的存在有引起食源性疾病的潜在危险性,须引起重视,加强防范。 展开更多
关键词 O157:H7大肠埃希氏菌(Escherichia COLI O157:H7) 生羊肉
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安阳地区2013年手足口病柯萨奇病毒A6 VP1基因特征研究 被引量:16
19
作者 李洋 张相萍 +2 位作者 翟明强 黄学勇 李懿 《病毒学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期324-330,共7页
为了解2013年安阳地区手足口病病原谱组成特点及柯萨奇病毒A6(CV-A6)VP1基因特征,采用实时荧光逆转录PCR方法对全年采集的临床手足口病例的479份粪便标本进行检测和分型,统计各型肠道病毒阳性标本数量及比例。对10份CV-A6阳性标本VP1基... 为了解2013年安阳地区手足口病病原谱组成特点及柯萨奇病毒A6(CV-A6)VP1基因特征,采用实时荧光逆转录PCR方法对全年采集的临床手足口病例的479份粪便标本进行检测和分型,统计各型肠道病毒阳性标本数量及比例。对10份CV-A6阳性标本VP1基因进行扩增测序以获得全序列。使用BIOEDIT 7.2和MEGA 5.1软件对获得序列和NCBI数据库中检索到的参考序列进行VP1基因核苷酸、氨基酸相似性及系统发育分析。研究结果显示,检出肠道病毒阳性标本共429份,其中CV-A6阳性标本为90份,占全部阳性标本的比例为20.98%,这是安阳地区首次记录非CV-A16和EV-A71型肠道病毒列居手足口病病原谱第二位,成为手足口病主要病原之一。将成功获得的10条VP1序列与CV-A6原型株Gdula比较,发现安阳序列与Gdula VP1基因的核苷酸、氨基酸序列差异皆较大。与河南历史株HN421(2011)比较,发现有4条本地序列与HN421的核苷酸、氨基酸序列差异较大,其余6条与HN421差异较小。系统发育树显示,全部49条CV-A6序列共形成A、B、C、D四个分支。其中D分支可进一步分为D1和D2两个亚分支。安阳地区获得的10条CV-A6序列中,有6条属于D1亚分支,4条属于D2亚分支。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒 柯萨奇病毒A6 系统发育树
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2011-2015年安阳地区手足口病相关人肠道病毒B种病原组成及柯萨奇病毒B2、B5 VP1基因特征分析 被引量:9
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作者 李洋 张相萍 +2 位作者 翟明强 黄学勇 李懿 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第6期435-441,共7页
目的:调查2011—2015年安阳地区手足口病( hand,foot and mouth disease, HFMD)相关人肠道病毒B种(HEV-B)病原组成,对柯萨奇病毒B2(CVB2)和柯萨奇病毒B5(CVB5)VP1基因特征进行研究。方法使用实时荧光逆转录 PCR 和半巢式逆转录... 目的:调查2011—2015年安阳地区手足口病( hand,foot and mouth disease, HFMD)相关人肠道病毒B种(HEV-B)病原组成,对柯萨奇病毒B2(CVB2)和柯萨奇病毒B5(CVB5)VP1基因特征进行研究。方法使用实时荧光逆转录 PCR 和半巢式逆转录 PCR 法对柯萨奇病毒 A16(CVA16)、肠道病毒71(EV71)以及其他肠道病毒进行鉴定,以获得完整的手足口病病原组成,统计出HEV-B病原种类及阳性比例。针对HEV-B病原中阳性病例数较多的CVB2和CVB5病原,分别以其VP1基因为靶段设计引物 PCR扩增测序后获得 VP1基因核苷酸序列全长。使用 MEGA7.0和BioEdit7.2软件对本研究获得的CVB2、CVB5序列以及GenBank数据库已收录的全部相关VP1序列构建系统发育树并进行系统发育分析。使用DateMonkey在线分析程序对我国近年来流行的CVB2和CVB5毒株的VP1基因进行选择压力分析。结果2011—2015年安阳地区共鉴定出手足口病相关HEV-B病原14种,HEV-B阳性标本57份。 HEV-B病原占手足口病全部病原种类的比例为56%, HEV-B阳性标本占总肠道病毒阳性标本的比例为3.06%。绝大多数HEV-B病原引起的手足口病呈高度散发,个别病原如 CVB2、CVB5在特定时间内的病例较为聚集。经过测序获得安阳地区8条CVB2和9条CVB5 VP1序列。构建的系统发育树显示,CVB2毒株可分为A-D四个基因型,各基因型的组间平均进化距离介于0.191-0.208,核苷酸序列相似性介于79.7%-85.8%。 CVB5毒株可分为A-F六个基因型,各基因型的组间平均进化距离介于0.170-0.285,核苷酸序列相似性介于76.0%-86.8%。 CVB2 VP1基因氨基酸序列第157、263位,CVB5 VP1基因氨基酸序列第75、90、95位在不同基因型毒株中的残基有较大差异。安阳地区CVB2序列均属于D基因型,且集中于1个分支内;CVB5序列均属于F基因型,分布于其中2个分支内。中国大陆地区近年流行的CVB2( D基因型)和CVB5(F基因亚型)毒株的进化选择压力ω值分别为0.037、0.036,未发现CVB2 VP1基因的正选择氨基酸位点,但在CVB5 VP1基因中发现6处正选择氨基酸位点。结论 HEV-B是安阳地区2011—2015年手足口病病原谱的重要组成。 CVB2、CVB5在安阳地区手足口病HEV-B病原中占有一定优势,其中CVB5 VP1基因比CVB2 VP1基因具有更为复杂和活跃的进化特征。 展开更多
关键词 手足口病 肠道病毒 柯萨奇病毒B2 柯萨奇病毒B5 系统发育树 正向选择压力
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