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单细胞转录组测序技术在家养动物中的应用
1
作者
张肖旭
李昊
+5 位作者
冯平捷
杨豪
李新月
吕冉
潘章源
储明星
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期3276-3287,共12页
单细胞转录组测序技术(single cell RNA sequencing, scRNA-seq)能够以高精度分辨率鉴定单个细胞类型和细胞状态,打破普通转录组测序(bulk RNA sequencing, RNA-seq)无法探究目标细胞具体表达特征的困境,在各个领域的探索中起到重要作用...
单细胞转录组测序技术(single cell RNA sequencing, scRNA-seq)能够以高精度分辨率鉴定单个细胞类型和细胞状态,打破普通转录组测序(bulk RNA sequencing, RNA-seq)无法探究目标细胞具体表达特征的困境,在各个领域的探索中起到重要作用,目前广泛应用于人类及小鼠发育生物学、肿瘤学、免疫学、复杂疾病、肠道微生物组及临床应用等诸多领域。近年来,scRNA-seq在畜牧业领域也开展了一些开创性的研究并获得了一系列的成果,主要集中在动物繁殖性能、胚胎发育、关键性状解析等方面,但相较于在人类上的应用还较为薄弱,在其他领域的应用也仍有待深入。本文主要综述了scRNA-seq的工作流程及其在家养动物中应用的研究进展,以期为提高scRNA-seq分析效率以及在家养动物中的创新应用提供参考。
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关键词
单细胞
转录组测序
家养动物
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职称材料
兔β-神经生长因子蛋白(NGF)结构与功能的生物信息学分析
2
作者
张肖旭
李昱逸
+2 位作者
王焕中
吕朝阳
封洋
《中国养兔》
2021年第5期12-17,共6页
NGF蛋白的氨基酸序列从Uniprot网站获取,应用生物信息学在线分析软件对β-NGF进行预测分析,分析该蛋白的理化性质、亲疏水性、跨膜结构和信号肽可能出现的位置。结果显示:β-NGF为亲水蛋白,分子中不存在跨膜结构域,大概率有信号肽说明β...
NGF蛋白的氨基酸序列从Uniprot网站获取,应用生物信息学在线分析软件对β-NGF进行预测分析,分析该蛋白的理化性质、亲疏水性、跨膜结构和信号肽可能出现的位置。结果显示:β-NGF为亲水蛋白,分子中不存在跨膜结构域,大概率有信号肽说明β-NGF属于分泌蛋白。蛋白质二级结构预测分析,无规则卷曲占57.68%,α螺旋占21.99%,延伸链占16.60%,β转角占3.73%。通过对β-NGF进行多方面分析,旨在为研究β-NGF在兔的神经系统和非神经系统上的作用及疾病治疗方面的效果提供理论基础,可以对β-NGF关于兔皮毛损伤修复方面开展进一步研究,侧重关注β-NGF使破损皮毛的愈合情况以及多少含量的β-NGF可达到最大修复程度。
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关键词
兔β-神经生长因子
生物信息学
理化性质
原文传递
獭兔体尺、体重和皮张面积的相关性分析及体重与皮张面积回归方程的建立
被引量:
2
3
作者
杨瑞鑫
张帆
+2 位作者
张建强
张肖旭
封洋
《中国养兔》
2021年第2期10-13,共4页
本试验主要研究獭兔体尺、体重和皮张面积之间的相关性,并在体重与皮张面积间建立回归方程,旨在为生产中獭兔的合理选育与饲养提供依据。试验选用3.5月龄獭兔50只,在甘肃农业大学动物实训中心饲养40 d,测定獭兔体长、背长、胸围、胸深...
本试验主要研究獭兔体尺、体重和皮张面积之间的相关性,并在体重与皮张面积间建立回归方程,旨在为生产中獭兔的合理选育与饲养提供依据。试验选用3.5月龄獭兔50只,在甘肃农业大学动物实训中心饲养40 d,测定獭兔体长、背长、胸围、胸深、腿臀围、体重和皮张面积,计算胸深指数和体躯指数。对獭兔体尺、体重和皮张面积做相关性分析,对獭兔体重和皮张面积做回归分析并建立回归方程。结果表明:体重与胸围、皮张面积呈极显著正相关(P<0.01),体长与背长、体躯指数呈极显著正相关(P <0.01),腿臀围与体躯指数呈显著负相关(P<0.01)。利用体重与皮张面积所得回归方程为Y=0.454X-224.32。结果表明体重对皮张面积大小的影响程度高于体尺指标。在獭兔的选育与饲养中应更加注重体重,并同时兼顾胸围与体长等体尺指标。
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关键词
獭兔
体尺
体重
皮张面积
相关性分析
回归分析
原文传递
题名
单细胞转录组测序技术在家养动物中的应用
1
作者
张肖旭
李昊
冯平捷
杨豪
李新月
吕冉
潘章源
储明星
机构
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所畜禽生物育种全国重点实验室
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024年第8期3276-3287,共12页
基金
国家重点研发计划青年科学家项目(2023YFF1001800)
国家重点研发计划(2022YFF1000103)
+2 种基金
国家自然科学基金(31802031,31960659)
中国农业科学院科技创新工程(CAAS-ZDRW202106,ASTIP-IAS13)
财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系资助(CARS-38)。
文摘
单细胞转录组测序技术(single cell RNA sequencing, scRNA-seq)能够以高精度分辨率鉴定单个细胞类型和细胞状态,打破普通转录组测序(bulk RNA sequencing, RNA-seq)无法探究目标细胞具体表达特征的困境,在各个领域的探索中起到重要作用,目前广泛应用于人类及小鼠发育生物学、肿瘤学、免疫学、复杂疾病、肠道微生物组及临床应用等诸多领域。近年来,scRNA-seq在畜牧业领域也开展了一些开创性的研究并获得了一系列的成果,主要集中在动物繁殖性能、胚胎发育、关键性状解析等方面,但相较于在人类上的应用还较为薄弱,在其他领域的应用也仍有待深入。本文主要综述了scRNA-seq的工作流程及其在家养动物中应用的研究进展,以期为提高scRNA-seq分析效率以及在家养动物中的创新应用提供参考。
关键词
单细胞
转录组测序
家养动物
Keywords
single-cell
transcriptome sequencing
domesticated animals
分类号
S813.1 [农业科学—畜牧学]
下载PDF
职称材料
题名
兔β-神经生长因子蛋白(NGF)结构与功能的生物信息学分析
2
作者
张肖旭
李昱逸
王焕中
吕朝阳
封洋
机构
甘肃农业大学动物科学技术学院
出处
《中国养兔》
2021年第5期12-17,共6页
基金
甘肃农业大学生科研训练计划项目(项目号:202104023)
甘肃省青年科技基金(项目号:20JR10RA547)。
文摘
NGF蛋白的氨基酸序列从Uniprot网站获取,应用生物信息学在线分析软件对β-NGF进行预测分析,分析该蛋白的理化性质、亲疏水性、跨膜结构和信号肽可能出现的位置。结果显示:β-NGF为亲水蛋白,分子中不存在跨膜结构域,大概率有信号肽说明β-NGF属于分泌蛋白。蛋白质二级结构预测分析,无规则卷曲占57.68%,α螺旋占21.99%,延伸链占16.60%,β转角占3.73%。通过对β-NGF进行多方面分析,旨在为研究β-NGF在兔的神经系统和非神经系统上的作用及疾病治疗方面的效果提供理论基础,可以对β-NGF关于兔皮毛损伤修复方面开展进一步研究,侧重关注β-NGF使破损皮毛的愈合情况以及多少含量的β-NGF可达到最大修复程度。
关键词
兔β-神经生长因子
生物信息学
理化性质
Keywords
Rabbitβ-nerve growth factor
Bioinformatics
Physicochemical properties
分类号
S829.1 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
獭兔体尺、体重和皮张面积的相关性分析及体重与皮张面积回归方程的建立
被引量:
2
3
作者
杨瑞鑫
张帆
张建强
张肖旭
封洋
机构
甘肃农业大学动物科学技术学院
出处
《中国养兔》
2021年第2期10-13,共4页
基金
甘肃省级大学生创新创业训练计划项目(S202010733023)。
文摘
本试验主要研究獭兔体尺、体重和皮张面积之间的相关性,并在体重与皮张面积间建立回归方程,旨在为生产中獭兔的合理选育与饲养提供依据。试验选用3.5月龄獭兔50只,在甘肃农业大学动物实训中心饲养40 d,测定獭兔体长、背长、胸围、胸深、腿臀围、体重和皮张面积,计算胸深指数和体躯指数。对獭兔体尺、体重和皮张面积做相关性分析,对獭兔体重和皮张面积做回归分析并建立回归方程。结果表明:体重与胸围、皮张面积呈极显著正相关(P<0.01),体长与背长、体躯指数呈极显著正相关(P <0.01),腿臀围与体躯指数呈显著负相关(P<0.01)。利用体重与皮张面积所得回归方程为Y=0.454X-224.32。结果表明体重对皮张面积大小的影响程度高于体尺指标。在獭兔的选育与饲养中应更加注重体重,并同时兼顾胸围与体长等体尺指标。
关键词
獭兔
体尺
体重
皮张面积
相关性分析
回归分析
Keywords
Rex rabbit
Body ruler
Weight
Skin area
Correlation analysis
Regression analysis
分类号
S829.1 [农业科学—畜牧学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
单细胞转录组测序技术在家养动物中的应用
张肖旭
李昊
冯平捷
杨豪
李新月
吕冉
潘章源
储明星
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
兔β-神经生长因子蛋白(NGF)结构与功能的生物信息学分析
张肖旭
李昱逸
王焕中
吕朝阳
封洋
《中国养兔》
2021
0
原文传递
3
獭兔体尺、体重和皮张面积的相关性分析及体重与皮张面积回归方程的建立
杨瑞鑫
张帆
张建强
张肖旭
封洋
《中国养兔》
2021
2
原文传递
已选择
0
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引证文献
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