目的:通过网络药理学结合分子对接方法探寻金叶败毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制。方法:借助TCMSP及BATMAN-TCM数据库筛选金叶败毒颗粒中金银花、大青叶、蒲公英、鱼腥草的化学成分和作用靶点,通过GeneCards数据库筛...目的:通过网络药理学结合分子对接方法探寻金叶败毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制。方法:借助TCMSP及BATMAN-TCM数据库筛选金叶败毒颗粒中金银花、大青叶、蒲公英、鱼腥草的化学成分和作用靶点,通过GeneCards数据库筛选新冠肺炎的预测靶点,将两者靶点进行映射,得到金叶败毒颗粒治疗COVID-19关键靶点;通过UniProt数据库校正靶点对应的基因,进而运用Cytoscape 3.7.2构建药物-化学成分-关键靶点(基因)网络,通过String数据库绘制蛋白质相互作用网络,通过DAVID数据库对关键靶点进行GO注释和KEGG通路富集分析。采用Maestro version 11.5软件,将活性成分作为配体与受体血管紧张素转换酶II(ACE2)和SARS-CoV-23CL水解酶进行分子对接验证。结果:金叶败毒颗粒共获得349个化合物,筛选得到51个活性化合物,成分相关靶点274个,COVID-19相关靶点345个,药物-疾病的共同靶点49个。GO功能富集分析得到GO条目756个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目688个,细胞组成(CC)条目33个,分子功能(MF)条目35个。KEGG通路富集筛选得到53个信号通路(P<0.05),涉及癌症通路、T细胞受体信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路、细胞凋亡通路等。分子对接结果显示金叶败毒颗粒中靛玉红、异鼠李素、山柰酚、木犀草素等10个成分与受体结合能力较强,可能是金叶败毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎的潜在活性成分。结论:金叶败毒颗粒中的活性化合物可通过与受体结合作用多个靶点调节多条信号通路,对COVID-19发挥潜在防治作用。展开更多
文摘目的:通过网络药理学结合分子对接方法探寻金叶败毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎(COVID-19)的作用机制。方法:借助TCMSP及BATMAN-TCM数据库筛选金叶败毒颗粒中金银花、大青叶、蒲公英、鱼腥草的化学成分和作用靶点,通过GeneCards数据库筛选新冠肺炎的预测靶点,将两者靶点进行映射,得到金叶败毒颗粒治疗COVID-19关键靶点;通过UniProt数据库校正靶点对应的基因,进而运用Cytoscape 3.7.2构建药物-化学成分-关键靶点(基因)网络,通过String数据库绘制蛋白质相互作用网络,通过DAVID数据库对关键靶点进行GO注释和KEGG通路富集分析。采用Maestro version 11.5软件,将活性成分作为配体与受体血管紧张素转换酶II(ACE2)和SARS-CoV-23CL水解酶进行分子对接验证。结果:金叶败毒颗粒共获得349个化合物,筛选得到51个活性化合物,成分相关靶点274个,COVID-19相关靶点345个,药物-疾病的共同靶点49个。GO功能富集分析得到GO条目756个(P<0.05),其中生物过程(BP)条目688个,细胞组成(CC)条目33个,分子功能(MF)条目35个。KEGG通路富集筛选得到53个信号通路(P<0.05),涉及癌症通路、T细胞受体信号通路、Toll样受体信号通路、NOD样受体信号通路、细胞凋亡通路等。分子对接结果显示金叶败毒颗粒中靛玉红、异鼠李素、山柰酚、木犀草素等10个成分与受体结合能力较强,可能是金叶败毒颗粒治疗新型冠状病毒肺炎的潜在活性成分。结论:金叶败毒颗粒中的活性化合物可通过与受体结合作用多个靶点调节多条信号通路,对COVID-19发挥潜在防治作用。