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基于网络药理学和分子对接探析二陈汤治疗癫痫的作用机制
1
作者
张莞芬
蒋媛静
+1 位作者
张永全
羊郑薇
《湖北民族大学学报(医学版)》
2024年第3期12-19,共8页
目的运用网络药理学及分子对接探究二陈汤抗癫痫的作用机制。方法采用中药系统药理学数据库(TCMSP)获取二陈汤的有效成分和作用靶点,应用GeneCards、OMIM、TTD及DrugBank数据库检索癫痫相关靶点,使用韦恩图获得二陈汤-癫痫共有靶点。借...
目的运用网络药理学及分子对接探究二陈汤抗癫痫的作用机制。方法采用中药系统药理学数据库(TCMSP)获取二陈汤的有效成分和作用靶点,应用GeneCards、OMIM、TTD及DrugBank数据库检索癫痫相关靶点,使用韦恩图获得二陈汤-癫痫共有靶点。借助Cytoscape 3.8.0及STRING数据库对共有靶点构建二陈汤抗癫痫成分-靶点网络图,进行蛋白质互作网络(PPI)分析及拓扑分析,并筛选核心靶基因。通过R语言软件对共有靶点进行基因本体论(GO)功能与京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析以获取相关生物过程及通路等。最后使用Amtodock将前5的核心靶点与核心成分进行分子对接。结果最终获得肿瘤抑制蛋白P53(TP53)、信号传导和转录激活因子3(STAT3)、B淋巴细胞瘤-2基因(BCL2)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)等8个核心靶点以及相对应的槲皮素、山奈酚、柚皮素等7个核心成分。GO富集分析主要涉及对异生素刺激的反应、金属离子响应、氧化应激反应等生物学过程,膜筏、含胶原蛋白的细胞外基质等细胞组成。KEGG富集通路主要有MAPK、IL-17、TNF等信号通路。分子对接结果显示排名前5靶点与核心成分稳定结合。结论二陈汤可能通过槲皮素、山奈酚、柚皮素等多种主要活性成分作用于TP53、STAT3、BCL2等核心靶点,调控MAPK、IL-17、TNF等信号通路发挥抗癫痫作用。
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关键词
二陈汤
癫痫
作用机制
网络药理学
分子对接
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题名
基于网络药理学和分子对接探析二陈汤治疗癫痫的作用机制
1
作者
张莞芬
蒋媛静
张永全
羊郑薇
机构
广西中医药大学研究生院
广西中医药大学附属瑞康医院
出处
《湖北民族大学学报(医学版)》
2024年第3期12-19,共8页
基金
广西中医药适宜技术开发与推广项目(GZSY21-39)。
文摘
目的运用网络药理学及分子对接探究二陈汤抗癫痫的作用机制。方法采用中药系统药理学数据库(TCMSP)获取二陈汤的有效成分和作用靶点,应用GeneCards、OMIM、TTD及DrugBank数据库检索癫痫相关靶点,使用韦恩图获得二陈汤-癫痫共有靶点。借助Cytoscape 3.8.0及STRING数据库对共有靶点构建二陈汤抗癫痫成分-靶点网络图,进行蛋白质互作网络(PPI)分析及拓扑分析,并筛选核心靶基因。通过R语言软件对共有靶点进行基因本体论(GO)功能与京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析以获取相关生物过程及通路等。最后使用Amtodock将前5的核心靶点与核心成分进行分子对接。结果最终获得肿瘤抑制蛋白P53(TP53)、信号传导和转录激活因子3(STAT3)、B淋巴细胞瘤-2基因(BCL2)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)等8个核心靶点以及相对应的槲皮素、山奈酚、柚皮素等7个核心成分。GO富集分析主要涉及对异生素刺激的反应、金属离子响应、氧化应激反应等生物学过程,膜筏、含胶原蛋白的细胞外基质等细胞组成。KEGG富集通路主要有MAPK、IL-17、TNF等信号通路。分子对接结果显示排名前5靶点与核心成分稳定结合。结论二陈汤可能通过槲皮素、山奈酚、柚皮素等多种主要活性成分作用于TP53、STAT3、BCL2等核心靶点,调控MAPK、IL-17、TNF等信号通路发挥抗癫痫作用。
关键词
二陈汤
癫痫
作用机制
网络药理学
分子对接
Keywords
Erchen Tang
epilepsy
mechanism of action
cyberpharmacology
molecular docking
分类号
R285 [医药卫生—中药学]
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作者
出处
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1
基于网络药理学和分子对接探析二陈汤治疗癫痫的作用机制
张莞芬
蒋媛静
张永全
羊郑薇
《湖北民族大学学报(医学版)》
2024
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