基于细胞焦亡基因构建肾上腺皮质癌预后模型及免疫微环境分析

目的:建立一个细胞焦亡基因相关的肾上腺皮质癌预后模型,分析其免疫微环境并实验验证。方法:运用TCGA数据库和GTEx数据库筛选焦亡相关的差异表达基因,Cox回归和Lasso分析构建ACC预后风险模型,外部队列验证预后价值及临床相关性,对差异表达基因进行GO-KEGG和GSEA富集分析,探究致癌可能的相关通路,ssGSEA算法、Pearson相关性分析研究ACC的免疫微环境,实时荧光定量及免疫组化实验验证预测结果。结果:Lasso分析成功构建了ACC风险模型,Cox多因素回归分析显示风险评分可作为评价预后的独立因素。高风险患者具有更低的OS和PFI,时间依赖性ROC曲线下面积(AUC)均大于0.5。风险模型还与T、M、N临床分期相关,对外部队列进行同样的风险分组,显示高风险患者预后更差,进一步证实风险模型的普适性。富集分析显示E2f、MYC等致癌通路被显著上调。高风险组中多数免疫细胞浸润较差,且MHC分子、趋化因子等分子分泌下降,不利于抗癌免疫微环境的形成。TP53和DNNB1蛋白提示为ACC的潜在治疗靶点。实时荧光定量和免疫组化实验验证了模型的普适性。结论:本研究利用生物信息学方法,成功构建出肾上腺皮质癌风险模型,外部验证良好,具有较准确的预后能力。免疫微环境分析得出ACC患者常处于免疫抑制状态,因此热门免疫检查点抑制剂效果不佳。TP53和DNNB1癌蛋白在高风险患者中表达显著,可作为潜在治疗靶点,以改善免疫治疗失效的现状。希望该风险模型能为肾上腺皮质癌的预后识别及靶向治疗提供新思路。

新一代运载火箭发射场物资供应模式创新与实践

针对目前发射场物资存在单发配套带来的管理和运输成本高、供应难度和风险大等问题,通过对近5年发射场物资供应大数据进行分析,研究各类物资供应规律,识别供应难点和风险点,采取相应供应措施,建立发射场物资供应信息共享机制,创建了新一代运载火箭发射场物资供应新模式。进而规范了发射场物资供应流程,提高了需求预测精准度,实现了发射场物资由按需供应向主动供应的重大转变。进一步推进型号、设计、生产、物资一体化协同管理,全面提高航天物资供应效率,有效降低物资管理和采购成本,为后续型号高密度发射提供坚实物资保障。

鼻咽癌组织中高表达的GSDME对TME免疫浸润和患者预后的影响

目的:探究细胞焦亡相关基因GSDME在鼻咽癌组织中的表达及其对肿瘤微环境(TME)和患者预后的影响。方法:从TCGA数据库获得548例鼻咽癌患者的基因表达数据及临床资料,运用R语言对GSDME进行差异表达分析、GO-KEGG富集分析;从人类蛋白质图谱(HPA)数据库中获取GSDME蛋白在鼻咽癌组织和相应癌旁组织中的表达数据,通过STRING数据库探究与GSDME相互作用的蛋白质网络;应用ss GSEA算法分析GSDME在鼻咽癌组织中的表达及其与24种免疫细胞浸润的相关性,运用Spearman法分析GSDME与免疫检查点分子的相关性,通过TISIDB数据库分析GSDME表达与细胞因子基因表达的相关性。单因素和多因素COX回归分析筛选预后风险因素,基于风险因素GSDME绘制预后预测列线图和校准图,根据GSDME的表达水平对鼻咽癌患者进行生存分析和风险分析。qPCR法验证中国人鼻咽癌组织中GSDME及4种趋化因子mRNA的表达。结果:数据库数据分析显示,与癌旁组织相比,鼻咽癌组织中GSDME呈高表达(P<0.01),GO-KEGG富集分析显示GSDME参与免疫反应、细胞焦亡相关信号通路,GSDME表达与免疫细胞浸润、细胞因子及免疫检查点分子表达等相关,q PCR检查结果验证了中国人鼻咽癌组织中GSDME呈高表达。GSDME表达量、N分期和M分期是鼻咽癌患者预后的风险因素,基于风险因素建立的列线图和校正图能较好地预测鼻咽癌患者OS,鼻咽癌组织中GSDME高表达的患者预后差。结论:GSDME在鼻咽癌癌组织中呈高表达且是患者预后风险因素,基于GSDME建立的列线图预测预后效能良好;GSDME高表达与TME免疫浸润有关,其可能是免疫治疗的潜在靶点。

EB病毒潜伏膜蛋白LMP1疫苗的预测及验证

目的采用生物信息学方法分析EB病毒潜伏膜蛋白LMP1,为疫苗的研发提供理论依据。方法在NCBI数据库中获取LMP1蛋白的基因组序列和氨基酸序列,采用生物信息学分析工具ProtParam、SOPMA、SWISS MODEL、SignalP、TMHMM、Cell-PLoc 2.0、NetNGly、NetPhos-3.1、Conserved domains、IEDB、BLAST、Immunomedicine Group、UniProt预测LMP1蛋白的理化性质,二、三级结构,信号肽和跨膜区域,亚细胞定位,糖基化位点和磷酸化位点,保守结构域,B、T细胞表位,同源性,抗原决定簇以及相互作用蛋白。构建重组质粒LMP1-pMV261以及重组卡介苗,并通过检测LMP1分子及蛋白表达水平探究构建疫苗的基本条件。结果LMP1蛋白分子式为C1901H2877N493O562S11,氨基酸数为386,相对分子质量为41.98238×10^(3),原子总数为5844。LMP1蛋白为稳定亲水蛋白,二级结构主要为无规则卷曲(Cc),占49.48%,易与抗体嵌合。该蛋白无信号肽,具有6个跨膜区,亚细胞定位在宿主细胞膜,无糖基化位点,有27个磷酸化位点,7个相互作用蛋白。实时荧光定量PCR及Western blot检测该蛋白基因及蛋白表达均稳定。结论生物信息学分析LMP1蛋白为稳定亲水蛋白,含有丰富的B、T细胞表位,构建的重组卡介苗蛋白表达稳定,可作为EB病毒的候选疫苗。