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柑橘TCP家族生物信息学及表达谱分析
被引量:
10
1
作者
周延培
张雅剑
伊华林
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期513-522,共10页
【目的】分析柑橘TCP蛋白家族成员的序列特征和系统进化关系,探究TCP家族成员在柑橘果实发育中的功能。【方法】通过生物信息学方法分析柑橘基因组中TCP家族成员的结构、染色体位置和系统进化关系。以‘兴锦101’(WT)及其晚熟芽变(MT)...
【目的】分析柑橘TCP蛋白家族成员的序列特征和系统进化关系,探究TCP家族成员在柑橘果实发育中的功能。【方法】通过生物信息学方法分析柑橘基因组中TCP家族成员的结构、染色体位置和系统进化关系。以‘兴锦101’(WT)及其晚熟芽变(MT)为试材,利用TA方法克隆柑橘TCP家族2个成员Cs TCP1和Cs TCP3,通过q RT-PCR测定TCP家族成员在‘兴锦101’及其晚熟芽变果实不同发育时期的相对表达量。【结果】克隆的2个基因Cs TCP1和Cs TCP3与原序列比对结果相似性达到100%;柑橘全基因组共编码20个TCP转录因子成员,分布在7条染色体上,都含有非典型的BHLH结构域,系统进化关系结果将Cs TCPs分为2个亚家族:Class I和Class II;多数基因结构简单,没有内含子;同时,定量结果表明Cs TCP基因在不同组织中的相对表达量存在差异,且被聚为2类;此外,在‘兴锦101’及其晚熟芽变果实不同发育时期中同样差异表达,多数基因相对表达量在花后215 d达到峰值,且在该时期2者间差异较显著。【结论】获得20个柑橘TCP家族成员基因,表达量分析显示TCP家族成员基因可能在柑橘的生长发育过程中起到重要的作用,为今后柑橘育种工作奠定了一定的理论基础。
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关键词
柑橘
TCP转录因子
生物信息学
q
RT-PCR
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职称材料
卷柏总黄酮研究进展
被引量:
3
2
作者
张莲珠
刘君
+3 位作者
李驰坤
张雅剑
宋宇
成光宇
《中国医药》
2022年第3期472-476,共5页
卷柏为传统中药,在临床应用广泛,其中富含黄酮类成分,具有抗氧化、抗肿瘤、降血糖、抗过敏、调血脂、改善认知障碍、抗骨质疏松及促血管生成等活性。本文对卷柏总黄酮在化学成分、提取纯化、质量控制、药理活性等方面的研究进展进行综述...
卷柏为传统中药,在临床应用广泛,其中富含黄酮类成分,具有抗氧化、抗肿瘤、降血糖、抗过敏、调血脂、改善认知障碍、抗骨质疏松及促血管生成等活性。本文对卷柏总黄酮在化学成分、提取纯化、质量控制、药理活性等方面的研究进展进行综述,为卷柏及其主要成分总黄酮的研究开发提供参考。
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关键词
卷柏总黄酮
化学成分
质量控制
药理活性
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职称材料
三亚卵形鲳鲹微卫星遗传多态性及性状关联分析
被引量:
3
3
作者
李耀国
孙彤
+1 位作者
张雅剑
杨超杰
《海南热带海洋学院学报》
2018年第2期1-5,12,共6页
卵形鲳鲹是三亚的主要养殖海水鱼类.本研究开发了12个新的多态性微卫星标记,并对三亚海域卵形鲳鲹的养殖群体和野生群体进行了遗传多态性分析和基因型与性状的关联分析.研究结果显示野生群体的平均Na、平均Ne、平均He及平均PIC值均较养...
卵形鲳鲹是三亚的主要养殖海水鱼类.本研究开发了12个新的多态性微卫星标记,并对三亚海域卵形鲳鲹的养殖群体和野生群体进行了遗传多态性分析和基因型与性状的关联分析.研究结果显示野生群体的平均Na、平均Ne、平均He及平均PIC值均较养殖群体高.微卫星位点中TO01、TO03和TO04等位点存在全长、体宽、体高和体质量的优势基因型.这些新开发的微卫星标记为卵形鲳鲹遗传结构和多态性分析、性状关联分析提供了分子资源.
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关键词
卵形鲳鲹
微卫星
养殖和野生
遗传多态性
性状关联
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职称材料
5-氮杂胞苷对马氏珠母贝早期发育的影响
被引量:
1
4
作者
李耀国
孙彤
+1 位作者
张雅剑
巩建豪
《海南热带海洋学院学报》
2016年第5期5-10,共6页
为了解5-氮杂胞苷对马氏珠母贝早期发育的影响,该研究检测并分析了其对早期发育阶段甲基化水平和矿化基因表达的影响.结果显示5-氮杂胞苷处理可引发基因组甲基化水平显著降低.5-氮杂胞苷处理亦使DNMT3的表达量低于海水处理组,而矿化基因...
为了解5-氮杂胞苷对马氏珠母贝早期发育的影响,该研究检测并分析了其对早期发育阶段甲基化水平和矿化基因表达的影响.结果显示5-氮杂胞苷处理可引发基因组甲基化水平显著降低.5-氮杂胞苷处理亦使DNMT3的表达量低于海水处理组,而矿化基因nacrein的表达量高于海水处理组.DNMT3和nacrein的表达呈显著正相关(R2=0.755,P=0.000).基因组甲基化水平的改变可能是调控生物矿化过程的重要因素.
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关键词
马氏珠母贝
去甲基化试剂
早期发育
甲基化水平
生物矿化
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职称材料
2017~2018年冬夏季利章港浮游植物物种组成分析
5
作者
周沁抒
徐嘉伟
+1 位作者
沈永富
张雅剑
《热带农业科学》
2020年第11期40-46,共7页
对2017年冬季及2018年夏季海南省东方市利章港近岸表层海水中浮游植物物种组成、丰度及优势种进行研究,并分析了浮游植物群落组成与水环境因子的关系。结果表明,研究水域共鉴定出浮游植物7门64属,冬季硅藻数量占总数的60.34%,绿藻数量...
对2017年冬季及2018年夏季海南省东方市利章港近岸表层海水中浮游植物物种组成、丰度及优势种进行研究,并分析了浮游植物群落组成与水环境因子的关系。结果表明,研究水域共鉴定出浮游植物7门64属,冬季硅藻数量占总数的60.34%,绿藻数量占总数的17.24%;夏季硅藻数量占总数的69.05%,绿藻数量占总数的16.67%。冬季浮游植物平均丰度为3.718×10^4个/L,优势种是小环藻属(Cyclotella)和圆筛藻属(Coscinodiscus)。夏季浮游植物平均丰度为9.98×10^3个/L,优势种是菱形藻属(Nitzschia)和针杆藻属(Synedra)。冬、夏季浮游植物Shannon-Wiener多样性指数的平均值分别为4.295和4.482,对应水质均处于清洁-寡污型状态;Pielou均匀度指数的平均值分别为0.395和0.500,对应水质则均处于β-中污型状态下。由浮游植物群落组成与环境因子相关性分析得出,浮游植物群落结构变化受温度、pH、营养盐、总硬度和光照的影响。
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关键词
浮游植物
物种组成
丰度
优势度
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职称材料
东方市利章港近岸海域水质状况分析与评价
6
作者
沈永富
都业烁
+1 位作者
徐嘉伟
张雅剑
《热带农业科学》
2019年第4期76-80,共5页
对东方市利章港2017年冬季及2018年夏季的多个水环境因子进行研究分析,分别采用单因子指数评价法、有机污染指数法和富营养化指数法进行数据分析。调查表明,利章港总体水质良好,溶解氧、无机氮、化学需氧量含量符合国家一类海水标准,但...
对东方市利章港2017年冬季及2018年夏季的多个水环境因子进行研究分析,分别采用单因子指数评价法、有机污染指数法和富营养化指数法进行数据分析。调查表明,利章港总体水质良好,溶解氧、无机氮、化学需氧量含量符合国家一类海水标准,但是铜和六价铬含量严重超标,仅符合四类海水标准;营养盐中磷的含量在夏季有所上升,只符合四类海水标准;在富营养化方面,全年水体均为贫营养化;在有机污染方面,夏季有机污染较为严重,人们应给予足够重视,以采取措施降低污染程度。
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关键词
利章港
海水
水质因子
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职称材料
题名
柑橘TCP家族生物信息学及表达谱分析
被引量:
10
1
作者
周延培
张雅剑
伊华林
机构
华中农业大学园艺林学学院.园艺植物生物学教育部重点实验室
出处
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016年第5期513-522,共10页
基金
国家现代农业(柑橘)产业技术体系专项(CARS-27)
国家科技支撑计划(2013BAD02132)
文摘
【目的】分析柑橘TCP蛋白家族成员的序列特征和系统进化关系,探究TCP家族成员在柑橘果实发育中的功能。【方法】通过生物信息学方法分析柑橘基因组中TCP家族成员的结构、染色体位置和系统进化关系。以‘兴锦101’(WT)及其晚熟芽变(MT)为试材,利用TA方法克隆柑橘TCP家族2个成员Cs TCP1和Cs TCP3,通过q RT-PCR测定TCP家族成员在‘兴锦101’及其晚熟芽变果实不同发育时期的相对表达量。【结果】克隆的2个基因Cs TCP1和Cs TCP3与原序列比对结果相似性达到100%;柑橘全基因组共编码20个TCP转录因子成员,分布在7条染色体上,都含有非典型的BHLH结构域,系统进化关系结果将Cs TCPs分为2个亚家族:Class I和Class II;多数基因结构简单,没有内含子;同时,定量结果表明Cs TCP基因在不同组织中的相对表达量存在差异,且被聚为2类;此外,在‘兴锦101’及其晚熟芽变果实不同发育时期中同样差异表达,多数基因相对表达量在花后215 d达到峰值,且在该时期2者间差异较显著。【结论】获得20个柑橘TCP家族成员基因,表达量分析显示TCP家族成员基因可能在柑橘的生长发育过程中起到重要的作用,为今后柑橘育种工作奠定了一定的理论基础。
关键词
柑橘
TCP转录因子
生物信息学
q
RT-PCR
Keywords
Citrus
Transcription factors
Bioinformatics
qRT-PCR
分类号
S666.2 [农业科学—果树学]
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职称材料
题名
卷柏总黄酮研究进展
被引量:
3
2
作者
张莲珠
刘君
李驰坤
张雅剑
宋宇
成光宇
机构
海南热带海洋学院水产与生命学院
长春中医药大学附属医院中医药研究中心
出处
《中国医药》
2022年第3期472-476,共5页
基金
海南省自然科学基金(821RC598)
海南省三亚市院地科技合作项目(2019YD11)
海南热带海洋学院博士启动项目(RHDXB201708)。
文摘
卷柏为传统中药,在临床应用广泛,其中富含黄酮类成分,具有抗氧化、抗肿瘤、降血糖、抗过敏、调血脂、改善认知障碍、抗骨质疏松及促血管生成等活性。本文对卷柏总黄酮在化学成分、提取纯化、质量控制、药理活性等方面的研究进展进行综述,为卷柏及其主要成分总黄酮的研究开发提供参考。
关键词
卷柏总黄酮
化学成分
质量控制
药理活性
Keywords
Total flavonoids from Selaginella tamariscina
Chemical contituent
Quality control
Pharmacological activity
分类号
R282 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
三亚卵形鲳鲹微卫星遗传多态性及性状关联分析
被引量:
3
3
作者
李耀国
孙彤
张雅剑
杨超杰
机构
海南热带海洋学院生命科学与生态学院
出处
《海南热带海洋学院学报》
2018年第2期1-5,12,共6页
基金
海南省高等学校科研资助项目(Hnky2016-39)
文摘
卵形鲳鲹是三亚的主要养殖海水鱼类.本研究开发了12个新的多态性微卫星标记,并对三亚海域卵形鲳鲹的养殖群体和野生群体进行了遗传多态性分析和基因型与性状的关联分析.研究结果显示野生群体的平均Na、平均Ne、平均He及平均PIC值均较养殖群体高.微卫星位点中TO01、TO03和TO04等位点存在全长、体宽、体高和体质量的优势基因型.这些新开发的微卫星标记为卵形鲳鲹遗传结构和多态性分析、性状关联分析提供了分子资源.
关键词
卵形鲳鲹
微卫星
养殖和野生
遗传多态性
性状关联
Keywords
Trachinotus ovatus
microsatellite
cultured and wild
genetic diversity
trait association
分类号
S91 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
5-氮杂胞苷对马氏珠母贝早期发育的影响
被引量:
1
4
作者
李耀国
孙彤
张雅剑
巩建豪
机构
海南热带海洋学院生命科学与生态学院
出处
《海南热带海洋学院学报》
2016年第5期5-10,共6页
基金
海南自然科学基金面上项目(20164166)
海南热带海洋学院学科带头人和博士科研启动基金项目(RHDXB201620)
文摘
为了解5-氮杂胞苷对马氏珠母贝早期发育的影响,该研究检测并分析了其对早期发育阶段甲基化水平和矿化基因表达的影响.结果显示5-氮杂胞苷处理可引发基因组甲基化水平显著降低.5-氮杂胞苷处理亦使DNMT3的表达量低于海水处理组,而矿化基因nacrein的表达量高于海水处理组.DNMT3和nacrein的表达呈显著正相关(R2=0.755,P=0.000).基因组甲基化水平的改变可能是调控生物矿化过程的重要因素.
关键词
马氏珠母贝
去甲基化试剂
早期发育
甲基化水平
生物矿化
Keywords
Pinctada fucata
demethylation agent
early development
methylation level
biomineralization
分类号
S91 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
2017~2018年冬夏季利章港浮游植物物种组成分析
5
作者
周沁抒
徐嘉伟
沈永富
张雅剑
机构
海南热带海洋学院水产与生命学院
上海海洋大学海洋科学学院
海南省热带海洋渔业资源保护与利用重点试验室
出处
《热带农业科学》
2020年第11期40-46,共7页
基金
2017海南省高等学校科学研究项目“海南省近岸海域表层蓝藻群落分析”(No.Hnky2017-51)
2016海南热带海洋学院博士研究生科研“南海三亚湾及近岸海域表层蓝藻类群时空分布及生理生化持续分析”(No.KHDXB 201619)。
文摘
对2017年冬季及2018年夏季海南省东方市利章港近岸表层海水中浮游植物物种组成、丰度及优势种进行研究,并分析了浮游植物群落组成与水环境因子的关系。结果表明,研究水域共鉴定出浮游植物7门64属,冬季硅藻数量占总数的60.34%,绿藻数量占总数的17.24%;夏季硅藻数量占总数的69.05%,绿藻数量占总数的16.67%。冬季浮游植物平均丰度为3.718×10^4个/L,优势种是小环藻属(Cyclotella)和圆筛藻属(Coscinodiscus)。夏季浮游植物平均丰度为9.98×10^3个/L,优势种是菱形藻属(Nitzschia)和针杆藻属(Synedra)。冬、夏季浮游植物Shannon-Wiener多样性指数的平均值分别为4.295和4.482,对应水质均处于清洁-寡污型状态;Pielou均匀度指数的平均值分别为0.395和0.500,对应水质则均处于β-中污型状态下。由浮游植物群落组成与环境因子相关性分析得出,浮游植物群落结构变化受温度、pH、营养盐、总硬度和光照的影响。
关键词
浮游植物
物种组成
丰度
优势度
Keywords
planktonic microalgae
species composition
abundance
dominance
分类号
S932.7 [农业科学—渔业资源]
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职称材料
题名
东方市利章港近岸海域水质状况分析与评价
6
作者
沈永富
都业烁
徐嘉伟
张雅剑
机构
海南热带海洋学院/海南省热带海洋渔业资源保护与利用重点实验室
出处
《热带农业科学》
2019年第4期76-80,共5页
基金
2017海南省高等学校科学研究项目——海南省近岸海域表层蓝藻群落分析(No.Hnky2017-51)
2016海南热带海洋学院博士研究生科研项目——南海三亚湾及近岸海域表层蓝藻类群时空分布及生理生化持续分析(No.KHDXB201619)
文摘
对东方市利章港2017年冬季及2018年夏季的多个水环境因子进行研究分析,分别采用单因子指数评价法、有机污染指数法和富营养化指数法进行数据分析。调查表明,利章港总体水质良好,溶解氧、无机氮、化学需氧量含量符合国家一类海水标准,但是铜和六价铬含量严重超标,仅符合四类海水标准;营养盐中磷的含量在夏季有所上升,只符合四类海水标准;在富营养化方面,全年水体均为贫营养化;在有机污染方面,夏季有机污染较为严重,人们应给予足够重视,以采取措施降低污染程度。
关键词
利章港
海水
水质因子
Keywords
Lizhang port
seawater
water quality factor
分类号
X824 [环境科学与工程—环境工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
柑橘TCP家族生物信息学及表达谱分析
周延培
张雅剑
伊华林
《果树学报》
CAS
CSCD
北大核心
2016
10
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职称材料
2
卷柏总黄酮研究进展
张莲珠
刘君
李驰坤
张雅剑
宋宇
成光宇
《中国医药》
2022
3
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职称材料
3
三亚卵形鲳鲹微卫星遗传多态性及性状关联分析
李耀国
孙彤
张雅剑
杨超杰
《海南热带海洋学院学报》
2018
3
下载PDF
职称材料
4
5-氮杂胞苷对马氏珠母贝早期发育的影响
李耀国
孙彤
张雅剑
巩建豪
《海南热带海洋学院学报》
2016
1
下载PDF
职称材料
5
2017~2018年冬夏季利章港浮游植物物种组成分析
周沁抒
徐嘉伟
沈永富
张雅剑
《热带农业科学》
2020
0
下载PDF
职称材料
6
东方市利章港近岸海域水质状况分析与评价
沈永富
都业烁
徐嘉伟
张雅剑
《热带农业科学》
2019
0
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职称材料
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