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GZMA是IDH突变型神经胶质瘤的预后生物标志物且与免疫浸润相关
1
作者
强亦龙
马晨雨
+1 位作者
张研宇
林伟
《中华神经外科疾病研究杂志》
CAS
2024年第2期13-18,共6页
目的探讨颗粒酶A(Granzyme A,GZMA)在脑胶质瘤中的预后价值及其与免疫细胞浸润的相关性.方法使用生物信息学(R语言)对CGGA数据库中胶质瘤转录组数据集中的低级别胶质瘤(LGG,WHO GradeⅡ,IDH-Mutant)和高级别胶质瘤(HGG,WHO GradeⅣ,IDH-...
目的探讨颗粒酶A(Granzyme A,GZMA)在脑胶质瘤中的预后价值及其与免疫细胞浸润的相关性.方法使用生物信息学(R语言)对CGGA数据库中胶质瘤转录组数据集中的低级别胶质瘤(LGG,WHO GradeⅡ,IDH-Mutant)和高级别胶质瘤(HGG,WHO GradeⅣ,IDH-Mutant)两组数据进行差异基因表达分析.使用R软件包对上调基因集做GO/KEGG富集分析.使用TIMER、GEPIA网络平台和TCGA数据集分析了GZMA表达与神经胶质瘤免疫浸润之间的关系.同时评估了GZMA对神经胶质瘤患者生存的影响.结果GZMA在IDH突变型HGG中上调(P<0.05),基因集富集分析结果显示GZMA参与了几个顶级且显著富集的GO类别.与正常脑组织相比,GZMA的mRNA在神经胶质瘤样本中均上调(P<0.05),并与神经胶质瘤患者的预后和分级相关.Kaplan-Meier(K-M)曲线分析显示,GZMA高表达的患者比GZMA低表达的患者总生存期(OS)更短.此外,GZMA的表达可能影响神经胶质瘤的免疫浸润水平.在GBM中,GZMA的表达水平与B细胞、树突状细胞的表达水平呈正相关,而与CD8+T细胞、CD4+T细胞的表达水平呈负相关;在LGG中,GZMA的表达水平与各种免疫细胞的浸润均呈正相关(P<0.05).结论GZMA可作为判断胶质瘤预后和免疫细胞侵袭的候选生物标志物.
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关键词
胶质细胞瘤
免疫浸润
颗粒酶A
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题名
GZMA是IDH突变型神经胶质瘤的预后生物标志物且与免疫浸润相关
1
作者
强亦龙
马晨雨
张研宇
林伟
机构
西安医学院研究生工作部
空军军医大学西京医院神经外科
出处
《中华神经外科疾病研究杂志》
CAS
2024年第2期13-18,共6页
基金
国家自然科学基金项目(82303425)
陕西省自然科学基础研究计划重点项目(2021JZ-34)。
文摘
目的探讨颗粒酶A(Granzyme A,GZMA)在脑胶质瘤中的预后价值及其与免疫细胞浸润的相关性.方法使用生物信息学(R语言)对CGGA数据库中胶质瘤转录组数据集中的低级别胶质瘤(LGG,WHO GradeⅡ,IDH-Mutant)和高级别胶质瘤(HGG,WHO GradeⅣ,IDH-Mutant)两组数据进行差异基因表达分析.使用R软件包对上调基因集做GO/KEGG富集分析.使用TIMER、GEPIA网络平台和TCGA数据集分析了GZMA表达与神经胶质瘤免疫浸润之间的关系.同时评估了GZMA对神经胶质瘤患者生存的影响.结果GZMA在IDH突变型HGG中上调(P<0.05),基因集富集分析结果显示GZMA参与了几个顶级且显著富集的GO类别.与正常脑组织相比,GZMA的mRNA在神经胶质瘤样本中均上调(P<0.05),并与神经胶质瘤患者的预后和分级相关.Kaplan-Meier(K-M)曲线分析显示,GZMA高表达的患者比GZMA低表达的患者总生存期(OS)更短.此外,GZMA的表达可能影响神经胶质瘤的免疫浸润水平.在GBM中,GZMA的表达水平与B细胞、树突状细胞的表达水平呈正相关,而与CD8+T细胞、CD4+T细胞的表达水平呈负相关;在LGG中,GZMA的表达水平与各种免疫细胞的浸润均呈正相关(P<0.05).结论GZMA可作为判断胶质瘤预后和免疫细胞侵袭的候选生物标志物.
关键词
胶质细胞瘤
免疫浸润
颗粒酶A
Keywords
Glioma
Immune cell infiltration
Granzyme A
分类号
R739.41 [医药卫生—肿瘤]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
GZMA是IDH突变型神经胶质瘤的预后生物标志物且与免疫浸润相关
强亦龙
马晨雨
张研宇
林伟
《中华神经外科疾病研究杂志》
CAS
2024
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