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TNFα诱导激活NF-κB上调抑癌基因CDKN2B表达 被引量:5
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作者 周飞 彭仲特 +2 位作者 郑锦玲 曾咏仪 周梦逸 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期972-981,共10页
NF-κB通过转录调控其靶基因,在肿瘤发生发展和精准治疗中起关键作用。过表达抑癌基因细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B(CDKN2B)可抑制肿瘤细胞增殖并诱导凋亡,但是否受NF-κB调节尚无报道。本文发现,NF-κB直接结合并上调CDKN2B基因:在... NF-κB通过转录调控其靶基因,在肿瘤发生发展和精准治疗中起关键作用。过表达抑癌基因细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B(CDKN2B)可抑制肿瘤细胞增殖并诱导凋亡,但是否受NF-κB调节尚无报道。本文发现,NF-κB直接结合并上调CDKN2B基因:在TNFα处理的He La细胞内,CDKN2B的基因区覆盖大量NF-κB结合峰,其中富集倍数大于20的结合峰有14个。TRANSFAC软件分析发现,NF-κB结合峰内包含大量经典的κB位点。Ch IP-q PCR证明,TNFα诱导NF-κB结合CDKN2B基因。将NF-κB结合峰中心区DNA片段插入荧光素酶报告基因载体中,发现该DNA片段的插入使荧光素酶相对活性上调至7.88倍,TNFα处理又使其相对活性提高到2.37倍,且NF-κB/p65 siRNA显著干扰其相对活性的升高。免疫荧光检测显示,TNFα诱导激活NF-κB进入细胞核,而NF-κB/p65 siRNA阻止它入核。此结果提示,我们成功构建了具有NF-κB转录活性差异的细胞模型,q PCR检测两个已知的NF-κB靶基因NFKB2和STAT5A的表达,进一步验证该细胞模型构建成功。利用此细胞模型,发现受TNFα诱导激活的NF-κB,能够上调CDKN2B基因。总之,本文发现抑癌基因CDKN2B是NF-κB新的靶基因,NF-κB直接结合并上调CDKN2B基因在转录水平的表达。本研究为抑癌基因CDKN2B的抗肿瘤应用奠定了基础。 展开更多
关键词 TNFΑ 核因子ΚB 细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B 靶基因 肿瘤
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基于生物信息学数据库分析IER2在肿瘤中高表达及其作用机制 被引量:2
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作者 李雪霞 邹焱堂 +5 位作者 李炫坤 薛文佳 彭仲特 朱慧 李云 周飞 《中国生物化学与分子生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1333-1345,共13页
人即刻早期反应基因2(immediate early response 2,IER2)可能参与肿瘤的发生发展,但它在此过程中的作用及表达调控的机制仍不清楚。本研究通过在线数据库GEPIA2与Kaplan-Meier Plotter分析发现:TNF和IER2基因在食管癌组织和宫颈癌组织... 人即刻早期反应基因2(immediate early response 2,IER2)可能参与肿瘤的发生发展,但它在此过程中的作用及表达调控的机制仍不清楚。本研究通过在线数据库GEPIA2与Kaplan-Meier Plotter分析发现:TNF和IER2基因在食管癌组织和宫颈癌组织中高表达。而且IER2基因高表达的食管癌病人的预后显著较差。通过UCSC基因组数据库分析发现,在宫颈癌细胞和淋巴细胞内,TNFα(由TNF基因编码)诱导激活NF-κB结合IER2基因区。qRT-PCR检测证明,在食管癌和宫颈癌等细胞内,TNFα诱导NF-κB在转录水平上调IER2基因的表达。本文据此提出,TNFα诱导NF-κB上调IER2基因的表达可能是其在食管癌和宫颈癌等肿瘤中高表达的调控机制。本研究还通过在线数据库GeneMANIA和String分析发现11个与IER2具有关联性的基因。通过在线数据库Oncomine分析发现了88个基因在食管癌细胞内与IER2基因共表达。其中,包含7个与IER2具有关联性的基因ATF3、DUSP1、EGR1、EGR2、FOSB、JUN、NR4A1。本研究通过Oncomine数据库分析证明,在前列腺癌组织细胞内,这7个基因也与IER2共表达。并通过qRT-PCR检测验证这7个基因在食管癌细胞内与IER2基因共表达。GO注释表明,IER2可能通过与ATF3、EGR1、JUN相互作用,协同参与细胞增殖等生物学过程。CCK8检测证明,IER2基因过表达促进食管癌细胞生长增殖。总之,本研究初步揭示了IER2在食管癌和宫颈癌中高表达的调控机制及其作用,为深入研究该基因功能提供了线索。 展开更多
关键词 人即刻早期反应基因2 肿瘤坏死因子Α 核因子ΚB 食管癌 宫颈癌
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人KIAA0146基因及蛋白质的生物信息学分析 被引量:2
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作者 周飞 刘雪梅 彭仲特 《生命科学研究》 CAS CSCD 2018年第4期283-290,共8页
KIAA0146是同源重组修复蛋白质复合体BLM/RAD51的支架蛋白质。当前KIAA0146相关的实验研究非常少。本文采用生物信息学方法对KIAA0146基因及其蛋白质进行快速分析以期为其往后的实验研究提供线索。首先发现KIAA0146基因存在多个转录起... KIAA0146是同源重组修复蛋白质复合体BLM/RAD51的支架蛋白质。当前KIAA0146相关的实验研究非常少。本文采用生物信息学方法对KIAA0146基因及其蛋白质进行快速分析以期为其往后的实验研究提供线索。首先发现KIAA0146基因存在多个转录起始位点及启动子,且启动子(2 127~2 177 bp)和(3 127~3 177 bp)的侧翼各有2个Cp G岛。然后发现KIAA0146是亲水的不稳定蛋白质。由于未发现KIAA0146蛋白包含信号肽和跨膜区域,所以它可能既不是分泌蛋白质也不是跨膜蛋白质。但是KIAA0146可能是细胞核蛋白质,在其N端包含核定位信号"RARGSKRKR",而且构建的KIAA0146蛋白的三级结构提示它可能具有核酸结合结构域。最后发现RAD51、ATM、RAD51B、MRE11A、BLM、DNA2、RMI1、BRCA1、BRCA2和XRCC2可能与KIAA0146相互作用,而且KIAA0146可能通过与这10个蛋白质相互作用参与DNA损伤应答及修复、发育和细胞代谢调节等生物过程。总之,文中对KIAA0146基因结构及其蛋白质的亚细胞定位、三级结构和潜在的分子功能等进行了预测分析,为往后实验研究KIAA0146提供了重要的理论依据和新线索。 展开更多
关键词 KIAA0146 同源重组修复 支架蛋白质 生物信息学
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TNFα诱导NF-κB转录调控SLC2A3基因 被引量:4
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作者 周飞 彭仲特 +2 位作者 王微 孙延杰 王茂先 《韩山师范学院学报》 2017年第6期48-55,共8页
葡萄糖转运蛋白3编码基因SLC2A3在多种癌症中高表达,促进癌症进展,被认为是癌基因.但是SLC2A3基因高表达的机制一直不清楚.该研究首先在TNFα诱导的HeLa细胞内发现许多NF-κB结合峰分布于SLC2A3基因区,其中富集倍数大于10的结合峰57个,... 葡萄糖转运蛋白3编码基因SLC2A3在多种癌症中高表达,促进癌症进展,被认为是癌基因.但是SLC2A3基因高表达的机制一直不清楚.该研究首先在TNFα诱导的HeLa细胞内发现许多NF-κB结合峰分布于SLC2A3基因区,其中富集倍数大于10的结合峰57个,大于20的结合峰5个.并且NF-κB结合峰与染色质上DNase I超敏感位点和H_3K_(27)A_c富集区重合或相邻.而且TRANSFAC软件分析发现,这些结合峰内包含大量经典的κB位点.以上结果提示TNFα可能诱导NF-κB转录调控SLC2A3基因.因此,该研究随后用NF-κB诱导剂(TNFα)和抑制剂(NF-κB p65 si RNA)构建NF-κB转录活性差异的HeLa细胞模型.再通过检测NF-κB及其三个已知靶基因(IL6,IL7R和IL8)的转录水平评价构建的HeLa细胞模型.利用此细胞模型,发现TNFα诱导NF-κB转录上调SLC2A3基因.同时在Hep G2细胞进行类似的研究并得到一致的结果.该研究证明SLC2A3基因为NF-κB的靶基因,初步揭示了癌细胞中SLC2A3高表达的分子机制,为癌症中NF-κB的分子功能研究提供了新视角. 展开更多
关键词 NF-ΚB SLC2A3 生物信息学 转录调控 靶基因
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论高中生物课程学习兴趣激发的意义和策略
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作者 周飞 刘雪梅 +3 位作者 彭仲特 连红云 郑馥琪 王茂先 《课程教育研究(学法教法研究)》 2018年第12期57-57,共1页
生物技术在当前经济、医药和大健康等领域的重大贡献必然奠定了生物学在高中教育课程改革中的特殊重要地位。但是以往应试教学模式和教学观念已根深蒂固。面对新课改提出的生物学教学观念和要求,师生均普遍感到不适。本文不仅分析了中... 生物技术在当前经济、医药和大健康等领域的重大贡献必然奠定了生物学在高中教育课程改革中的特殊重要地位。但是以往应试教学模式和教学观念已根深蒂固。面对新课改提出的生物学教学观念和要求,师生均普遍感到不适。本文不仅分析了中学生物学习兴趣的现状和激发生物学习兴趣的意义,还归纳总结出了11种激发生物学习兴趣的策略,以供在高中实际教学活动中灵活选择,构建以学生为主体的兴趣课堂。总之,本研究旨在提升中学生物教学质量和效率。 展开更多
关键词 中学 生物学 教学 兴趣
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LCN2在宫颈癌和食管癌中高表达的机制及作用 被引量:3
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作者 彭仲特 李雪霞 +3 位作者 曾咏仪 周梦逸 郑锦玲 周飞 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期5363-5372,共10页
肿瘤细胞异常表达LCN2的调控机制及作用目前尚不明确。本研究通过Oncomine数据库分析发现,LCN2在宫颈癌和食管癌等多种肿瘤组织中高表达。进一步分析在TNFα处理的宫颈癌细胞内测得的NF-κB/ChIP-Seq数据发现,LCN2基因区的转录活性标记... 肿瘤细胞异常表达LCN2的调控机制及作用目前尚不明确。本研究通过Oncomine数据库分析发现,LCN2在宫颈癌和食管癌等多种肿瘤组织中高表达。进一步分析在TNFα处理的宫颈癌细胞内测得的NF-κB/ChIP-Seq数据发现,LCN2基因区的转录活性标记区(DNaseⅠ超敏感位点,H3K27Ac修饰标记位点和转录因子结合位点)覆盖24个富集倍数大于20的NF-κB结合峰,其中启动子区上的结合峰最高,且每个NF-κB结合峰包含许多κB位点。采用ChIP-qPCR验证了LCN2启动子区的NF-κB结合峰。15 ng/m L、30 ng/m L和60 ng/mL的TNFα以及TNFα的细胞内过表达均诱导宫颈癌细胞和食管癌细胞上调LCN2的表达,而NF-κB抑制剂(Bay11-7082和NF-κB/p65 siRNA)可阻止TNFα诱导宫颈癌细胞和食管癌细胞上调LCN2表达。以上结果表明TNFα可诱导NF-κB结合并上调LCN2。本研究还发现,LCN2高表达促进食管癌细胞和宫颈癌细胞增殖,高表达LCN2的宫颈癌患者预后不良。总之,本研究揭示了宫颈癌和食管癌中LCN2高表达的分子机制及作用。 展开更多
关键词 食管癌 宫颈癌 LCN2 高表达机制
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